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Metabolomica

A metabolomica, una disciplina à valle di a genomica, si rivolge principalmente à e sostanze à piccule molecule cù un pesu moleculare inferiore à 1500 Da. Permette à i metaboliti di riflette e risposte di l'organismi à stimuli esterni è cambiamenti fisiologichi/patologichi in modu più sensibile. I cambiamenti di u livellu di i metaboliti indotti da variazioni genetiche sò ancu in u so scopu di ricerca, furnendu una nova perspettiva di ricerca.

BMKGENE offre una gamma cumpleta di servizii di metabolomica, cumprese a metabolomica micca mirata, a metabolomica largamente mirata è a metabolomica mirata. Usendu a cromatografia liquida-spettrometria di massa (LC-MS) o a cromatografia gassosa-spettrometria di massa (GC-MS), si ponu rilevà i cambiamenti dinamichi in a maiò parte di i metaboliti di piccule molecule in l'organismi prima è dopu a stimulazione esterna. U core di sti servizii stà in l'identificazione di metaboliti cù differenze significative trà i gruppi sperimentali è di cuntrollu è in l'esplorazione ulteriore di a so currelazione cù i cambiamenti fisiologichi/patologichi è i meccanismi sottostanti.

 


Dettagli di u serviziu

Bioinformatica

Risultati di a Dimostrazione

Publicazione in risaltu

Funziunalità

Non-Metabolomica mirata (Discovery Metabolomics)

Basata annantu à a tecnulugia di cromatografia liquida-spettrometria di massa (LC-MS), a metabolomica senza target permette a rilevazione imparziale di u più grande numeru pussibule di metaboliti di piccule molecule in campioni biologichi cum'è cellule, tessuti, organi o fluidi corporei. Conduce analisi comparative trà gruppi sperimentali è di cuntrollu, è analizza i metaboliti differenziali per mezu di analisi statistica.

● Metabolomica micca mirata per i lipidi

Utilizendu a tecnulugia di cromatografia liquida-spettrometria di massa (LC-MS),nA metabolomica mirata per i lipidi permette di detectà senza pregiudiziu u più numeru pussibule di molecule lipidiche in campioni biologichi, cumprese cellule, tessuti, organi o fluidi corporei.

● Largu-Metabolomica Mirata

Stu serviziu combina perfettamente i vantaghji di l'alta risoluzione è di l'ampia cupertura di a tecnulugia senza mira cù l'alta sensibilità è e capacità di quantificazione accurate di a tecnulugia MRM (Multiple Reaction Monitoring) mirata. U flussu di travagliu hè u seguente: Prima, a spettrometria di massa ad alta risoluzione hè aduprata per eseguisce una scansione MS² à cupertura ultra-alta nantu à i campioni per ottene spettri MS² di "tutti" i metaboliti. Dopu, l'identificazione accurata di i metaboliti hè realizata cumbinendu cù una biblioteca MS² ad alta risoluzione (chì copre più di 25.000 metaboliti, cù parechji spettri MS² standard ad alta risoluzione per ogni metabolitu). In seguitu, l'infurmazioni nantu à e coppie di ioni MRM sò estratte da i spettri di massa per stabilisce una biblioteca specifica per i campioni. Infine, a spettrometria di massa à triplu quadrupolo cù a tecnulugia MRM hè applicata per una quantificazione accurata.

● Metabolomica Mirata

A metabolomica mirata si cuncentra nantu à parechji cumposti bersagliu o metaboliti tutti/parziali implicati in una via specifica. Utilizendu sustanze standard, stabilisce un metudu di rilevazione cù una forte specificità, alta sensibilità è bona ripetibilità per a quantificazione è l'analisi di i cumposti bersagliu. Adotta un standard esternu cumminatu cù un standard internu per a quantificazione assoluta, cù a linearità di a curva standard chì righjunghje più di 0,99 è a sensibilità finu à u livellu di ng/mL.

Vantaghji

Piattaforma di Rilevazione Avanzata

-Equipatu cù spettrometri di massa à alta risoluzione di punta è spettrometri di massa à triplu quadrupolo, chì permettenu a rilevazione è l'analisi simultanea di migliaia di metaboliti.

Basi di dati cumplete

- Basi di dati pubbliche: Coprenu METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas è Lipidmaps, chì includenu più di 500 000 metaboliti.

- In casaBase di dati specifica di a pianta: Contene più di 25 000 metaboliti, cumpresi metaboliti primari è secundarii.

- In casaBase di dati specifica per l'animali/medicina: Include più di 12.000 metaboliti.

Sistema di cuntrollu di qualità strettu

-Cuntrollu di qualità rigorosu chì copre a stabilità di u strumentu, i residui di sustanza, u QC PCA di u campione è l'analisi di currelazione per assicurà una qualità affidabile di i dati.

Alta capacità di rilevazione di metaboliti

- Non-Metabolomica mirata: Rileva una media di più di 4.200 metaboliti per esecuzione, ideale per esplorà metaboliti scunnisciuti in campioni è identificà metaboliti in campioni cumplessi.

- Largu-Metabolomica Mirata (Pianta): Rileva una media di più di 2.410 metaboliti per esecuzione, cumpresi metaboliti primari è secundarii.

- Largu-Metabolomica Mirata (Animale): Rileva una media di più di 1.250 metaboliti per esecuzione.

- Metabolomica Mirata: Pannelliperparechje categurie di metaboliti.

Analisi cumpleta

-Offre più di 10 elementi d'analisi è più di 20 grafichi di visualizazione.

Serviziu post-vendita attentivu

-Fornisce cunsultazioni post-vendita è supportu per l'interpretazione di u rapportu finale.

Specifiche di serviziu

Soluzione Piattaforma Repliche biologiche raccomandate
Metabolomica micca mirata UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) Campione di pianta è microbiana: ≥ 6

Campione animale: ≥ 10

Campione clinicu: ≥ 30

Tutti i campioni replicati biologichi sò stati analizzati indipindentamente.

Metabolomica à Mira Larga Acqua Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ Campione di pianta: ≥ 3
Metabolomica Mirata UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+)

 

GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977)

Campione di pianta: ≥ 3

 

Campione animale: ≥ 6

Requisiti di Campione

Vi dumandate s'è i vostri campioni rispondenu à i nostri criteri ? Cliccate quì per ottene u nostrul'ultimi requisiti di mostra.

Flussu di travagliu di serviziu

consegna di campioni

Raccolta di Campioni

Esperimentu pilotu

Estrazione di Metaboliti

Preparazione di a Biblioteca

Acquisizione di dati

Analisi di dati

Analisi di i dati

Cunsegna di dati-05

Cunsegna di dati


  • Precedente:
  • Dopu:

  • 1. Rumore di fondu è trasfurmazione di dati grezzi di bassa qualità

    2. Valutazione di a qualità di i dati

    2.1 Analisi di i cumpunenti principali

    2.2 Valutazione di a riproducibilità

    3. Annotazione di u Metabolitu

    3.1 Annotazione di a basa di dati KEGG

    3.2 Annotazione di a basa di dati HMDB

    3.3 Annotazione di a basa di dati Lipidmaps

    4. Analisi di i dati di raggruppamentu di campioni (repliche biologiche)3)

    4.1 Analisi di i cumpunenti principali di u gruppu

    4.2 Analisi discriminante di i minimi quadrati parziali ortogonali (OPLS-DA)

    4.3 Analisi di i metaboliti differenziali di u gruppu

    5. Selezzione di Metaboliti Differenziali (repliche biologiche3)

    5.1 Analisi di u cambiamentu di piega differenziale

    5.2 Graficu di u vulcanu di metaboliti differenziali

    5.3 Mappa di calore di raggruppamentu di metaboliti differenziali

    5.4 Graficu di currelazione di metaboliti differenziali

    5.5 Graficu di u puntu Z di u metabolitu differenziale

    5.6 Analisi di u graficu radar di metaboliti differenziali

    5.7 Diagramma di u viulinu di u metabolitu differenziale

    5.8 Diagramma di scatula di metaboliti differenziali

    5.9 Analisi di l'annotazione funzionale è di l'arricchimentu di u metabolitu differenziale KEGG

    5.10 Analisi di a curva ROC

    5.11 Raggruppamentu di k-means di metaboliti differenziali

    5.12 Diagramma di Venn di u metabolitu differenziale

    1. Valutazione di a qualità di i dati

    12

    Canalisi di correlazione(Campione di prova / campione di QC)

     

     34

    ↑Analisi di i cumpunenti principali                                                                                 ↑Analisi di raggruppamentu di metaboliti

     

     

    2. Annotazione di u Metabolitu

     meta_lipidmaps_anno meta_hmdb_anno

    ↑Annutazione di a basa di dati KEGG↑Annotazione di a basa di dati HMDB

     

     meta_kegg_anno

    ↑Annotazione di a basa di dati Lipidmaps

     

     

    3. Analisi di i dati di raggruppamentu di campioni (repliche biologiche)3)

    8 9

    ↑Analisi di i cumpunenti principali di u gruppu(2D/3D)

     

     10

    ↑Analisi discriminante di i minimi quadrati parziali ortogonali (OPLS-DA)

     

     

    4. Selezzione di Metaboliti Differenziali (repliche biologiche)3)

     C_vs_A_Top_20_FC_change C_vs_A.vulcanu

    ↑Analisi di u cambiamentu di piega differenziale↑Graficu di u vulcanu di u metabolitu differenziale

     

     13 anniB_vs_A.corrplot

    ↑Mappa di calore di raggruppamentu di metaboliti differenziali↑Graficu di currelazione di metaboliti differenziali

     

    C_vs_A.zscoreB_vs_A_Top_10_FC_radarchart

    ↑Graficu di u puntu Z di u metabolitu differenziale↑Analisi di u graficu radar di i metaboliti differenziali

     

     17 anni 18 anni

    ↑Trama di u viulinu di u metabolitu differenziale↑Diagramma di scatula di metaboliti differenziali

     

     19 anni

    ↑Analisi di l'annotazione funzionale è di l'arricchimentu di u metabolitu differenziale KEGG

     

     20 anni 21 anni

    ↑Analisi di a curva ROC↑Clustering di k-means di metaboliti differenziali

     

     22 anni

    ↑Diagramma di Venn di metabolite differenziale

    Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. U fattore di trascrizione omeodominiale simile à BEL1 SAWTOOTH1 (MdSAW1) in Malus domestica migliora a tolleranza di a mela transgenica è di l'Arabidopsis à u stress eccessivu di u zincu. Int J Biol Macromol. 2025 Maghju;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 Mar 10. PMID: 40074134.

    Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Effettu interattivu di nanoparticelle verdi mediate da Moringa oleifera è funghi micorrizici arbusculari nantu à a crescita, l'architettura di u sistema radicale è l'assorbimentu di nutrienti in u mais (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. Settembre 2025;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 24 di maghju 2025. PMID: 40441096.

    Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. U jasmonatu attiva un modulu simile à SlJAZ2/3-SlMYC3 chì regula l'assorbimentu di K+ in a risposta di u pumadoru à un stress di K+ bassu. J Integr Plant Biol. Agostu 2025;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 28 di maghju 2025. PMID: 40432500.

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