Trascrittoma cumpletu di Pacbio

U Sequenziamentu di Trascrittoma à Lunghezza Completa di PacBio, Isoseq, permette l'identificazione precisa di l'isoformi di trascritti, mettendu in luce a poliadenilazione è u splicing alternativi, è cunducendu à un'analisi di l'espressione genica più precisa. A pipeline BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome hè cuncipita per analizà e librerie di cDNA sequenziate in modalità Circular Consensus Sequencing (CCS) è identifica e sequenze Full-Length Non-Chimeriche (FLNC), chì sò poi raggruppate in trascritti non ridondanti. Una successiva analisi BUSCO valuta a cumpletezza di l'assemblaggio di u trascrittoma. Da u trascrittoma assemblatu, sò realizate parechje analisi: splicing alternativu, ripetizione di sequenza simplice (SSR), previsione di lncRNA è di i geni bersaglio currispondenti, previsione di novi geni, analisi di a famiglia di geni, analisi di i fattori di trascrizione è annotazione funzionale di i trascritti.