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Sequenza metagenomica -NGS
Un metagenome hè una cullizzioni di u materiale geneticu tutale di una cumunità mista d'organisimi, cum'è metagenomi ambientali è umani. Contene genomi di i microorganisimi cultivabili è incultivabili. A sequenza metagenomica di Shotgun cù NGS permette u studiu di sti paisaghji genomici intricati incrustati in campioni ambientali furnisce più cà prufilu tassonomichi, dendu ancu insights granulari in a diversità di e spezie, a dinamica di abbundanza è e strutture cumplesse di pupulazioni. Al di là di i studii tassonomichi, a metagenomica di fucile offre ancu una perspettiva di genomica funzionale, chì permette l'esplorazione di geni codificati è i so roli putativi in i prucessi ecologichi. Infine, a creazione di rete di correlazione trà elementi genetichi è fatturi ambientali cuntribuisci à una cunniscenza olistica di l'intricata interazione trà e cumunità microbiche è u so fondu ecologicu. In cunclusione, a sequenza metagenomica hè un strumentu pivotale per svelà l'intricacies genomiche di diverse comunità microbiche, illuminando e relazioni multifacciali trà genetica è ecologia in questi ecosistemi cumplessi.
Piattaforme: Illumina NovaSeq è DNBSEQ-T7
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Sequenza metagenomica-TGS
Un metagenome hè una cullizzioni di u materiale geneticu di una cumunità mista d'organisimi, cum'è metagenomi ambientali è umani. Contene genomi di i microorganisimi cultivabili è incultivabili. A sequenza metagenomica permette u studiu di sti paisaghji genomici intricati incrustati in campioni ecologichi fornendu più di prufilu tassonomichi. Offre ancu una perspettiva di genomica funzionale esplorendu i geni codificati è i so roli putativi in i prucessi ambientali. Mentre chì l'avvicinamenti tradiziunali di fucile cù sequencing Illumina sò stati largamente utilizati in studii metagenomici, l'avventu di Nanopore è PacBio sequencing longu di leghje anu cambiatu u campu. A tecnulugia Nanopore è PacBio migliora l'analisi bioinformatiche in a valle, in particulare l'assemblea di metagenoma, assicurendu assemblei più cuntinui. I rapporti indicanu chì a metagenomica basata in Nanopore è PacBio hà generatu cun successu genomi batterichi cumpleti è chjusi da microbiomi cumplessi (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). L'integrazione di letture Nanopore cù letture Illumina furnisce un approcciu strategicu per a correzione di l'errore, mitigendu a bassa precisione inerente di Nanopore. Questa cumminazione sinergica sfrutta i punti di forza di ogni piattaforma di sequenza, offre una soluzione robusta per superà e limitazioni potenziali è avanzendu a precisione è l'affidabilità di l'analisi metagenomiche.
Piattaforma: Nanopore PromethION 48, Illumia è PacBio Revio
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16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
I geni 16S è 18S rRNA, inseme cù a regione Internal Transcribed Spacer (ITS), servenu cum'è marcatori di impronte molekulari pivotali per via di a so cumminazione di regioni altamente conservate è ipervariabili, chì li facenu strumenti preziosi per caratterizà l'organismi procarioti è eucarioti. L'amplificazione è a sequenza di queste regioni offrenu un approcciu senza isolamentu per investigà a cumpusizioni microbica è a diversità in diversi ecosistemi. Mentre chì a sequenza di Illumina tipicamente mira à e regioni ipervariabili brevi cum'è V3-V4 di 16S è ITS1, hè statu dimustratu chì l'annotazione tassonomica superiore hè ottenibile sequenzendu a lunghezza completa di 16S, 18S è ITS. Stu approcciu cumpletu si traduce in percentualità più altu di sequenze classificate accuratamente, ottenendu un livellu di risuluzione chì si estende à l'identificazione di e spezie. A piattaforma di sequencing Single-Molecule Real-Time (SMRT) di PacBio si distingue per furnisce letture lunghe (HiFi) altamente precise chì coprenu l'ampliconi à tutta a lunghezza, rivalitendu cù a precisione di sequencing Illumina. Sta capacità permette à i circadori di ottene un vantaghju senza pari - una vista panoramica di u paisaghju geneticu. A cobertura estesa eleva significativamente a risoluzione in l'annotazione di spezie, in particulare in e cumunità batteriche o fungine, chì permette una cunniscenza più profonda di e intricacies di e pupulazioni microbiche.
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16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A sequenza di Amplicon cù a tecnulugia Illumina, specificamente destinata à i marcatori genetichi 16S, 18S è ITS, hè un metudu putente per svelà a filogenesia, a tassonomia è l'abbundanza di spezie in e cumunità microbiche. Stu approcciu implica a sequenza di e regioni ipervariabili di i marcatori genetichi di a casa. Originariamente introduttu cum'è una impronta digitale moleculare daWoeses et alin u 1977, sta tecnica hà rivoluzionatu u prufilu di u microbioma permettendu analisi senza isolamentu. Attraversu u sequencing di 16S (bacteria), 18S (fungi), è Internal Transcribed Spacer (ITS, fungi), circadori ponu identificà micca solu spezie abbundanti, ma ancu raru è micca identificatu. Ampiamente aduttatu cum'è un strumentu pivotale, a sequenza di l'ampliconu hè diventata strumentale per discernisce cumpusizioni microbiche differenziali in diversi ambienti, cumprese a bocca umana, l'intestini, e feci, è oltre.
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Re-Sequencing di u genoma tutale di batteri è fungi
I prughjetti di re-sequenza di u genoma sanu di batteri è fungi sò pivotali per l'avanzamentu di a genomica microbica, permettendu a cumpiimentu è a comparazione di genomi microbiali. Questu facilita l'ingegneria di fermentazione, l'ottimisazione di i prucessi industriali è l'esplorazione di camini di metabolismu secundariu. Inoltre, a re-sequenza di fungi è batterichi hè cruciale per capiscenu l'adattazione ambientale, ottimizendu i ceppi, è revelà a dinamica di l'evoluzione genetica, cù ampie implicazioni in medicina, agricultura è scienza ambientale.
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Sequenza di RNA procariota
A sequenza di l'RNA permette a profilazione cumpleta di tutte e trascrizioni di RNA in e cellule in cundizioni specifiche. Sta tecnulugia d'avanguardia serve cum'è un strumentu putente, svelendu profili intricati di espressione genica, strutture genetiche è meccanismi molecolari assuciati à diversi prucessi biologichi. Ampiamente aduttatu in a ricerca fundamentale, a diagnostica clinica è u sviluppu di droghe, a sequenza di RNA offre una visione di l'intricacies di a dinamica cellulare è a regulazione genetica. A nostra elaborazione di campioni di RNA procarioticu hè adattatu per i trascrittomi procarioti, chì implica l'esaurimentu di l'rRNA è a preparazione di libreria direzionale.
Piattaforma: Illumina NovaSeq
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Sequenza di metatrascriptome
Sfruttandu a tecnulugia di sequenza Illumina, u serviziu di sequencing metatrascriptome di BMKGENE rivela l'espressione genica dinamica di una varietà diversa di microbi, da eucarioti à procarioti è virus, in ambienti naturali cum'è terra, acqua, mare, feci è intestini. U nostru serviziu cumpletu permette à i ricercatori di sfondà in i profili cumpleti di l'espressione genica di e cumunità microbiche cumplette. Al di là di l'analisi tassonomica, u nostru serviziu di sequencing metatrascriptome facilita l'esplorazione in l'arricchimentu funzionale, mettendu luce nantu à i geni espressi di manera differenziale è i so roli. Scopre una ricchezza di insights biologichi mentre navighi in i paisaghji cumplessi di l'espressione genica, a diversità tassonomica è a dinamica funzionale in queste diverse nicchie ambientali.
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Assemblea de novo di u genoma fungicu
BMKGENE offre soluzioni versatili per i genomi fungi, rispondendo a diverse esigenze di ricerca e completezza desiderata del genoma. L'usu di a sequenza di Illumina di lettura corta permette solu a generazione di un genoma di draft. Lecture brevi è sequenza di lettura longa cù Nanopore o Pacbio sò cumminati per un genoma fungicu più raffinatu cù contigs più longu. Inoltre, l'integrazione di a sequenza Hi-C aumenta ancu e capacità, chì permette di ottene un genoma cumpletu à livellu di cromosomi.
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Assemblea di Genomu Bacterial De novo
Offriamu un serviziu cumpletu di assemblea di genomu batterica, guarantisci 0 lacune. Questu hè pussibule integrendu tecnulugii di sequenza di lettura longa, cum'è Nanopore è PacBio per l'assemblea è a sequenza di lettura corta cù Illumina per a validazione di l'assemblea è a correzione d'errore di leghje ONT. U nostru serviziu furnisce u flussu di travagliu bioinformaticu cumpletu da l'assemblea, l'annotazione funzionale è l'analisi bioinformatica avanzata, cumpiendu scopi di ricerca specifichi. Stu serviziu permette u sviluppu di genomi di riferimentu precisi per diversi studii genetichi è genomici. Inoltre, costituisce a basa per l'applicazioni cum'è l'ottimisazione di ceppi, l'ingegneria genetica è u sviluppu di a tecnulugia microbiana, assicurendu dati genomici affidabili è senza gap cruciali per avanzà a cunniscenza scientifica è l'innuvazione biotecnologica.
