Pruteomica
Funziunalità
●Proteomica qualitativa: Utilizza LC-MS/MS per identificà a cumpusizione di e proteine in campioni cumplessi (strisce di gel SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down). Vantaghji: Nisun limite di numeru di campioni, rilevazione rapida, trasfurmazione simplice di i campioni, altu rendimentu è capacità di rilevà proteine à bassa abbundanza.
● Proteomica Quantitativa Senza Etichetta: Tecnulugia senza etichettatura cù rilevazione di campioni individuali. Quantifica e proteine paragunendu l'intensità di u signale peptidicu in i dati di spettrometria di massa. Vantaghji: Funzionamentu simplice, altu rendimentu (senza limite di numeru di campioni) è larga applicabilità (adatta per u paragone differenziale di proteine "presenza/assenza" trà e spezie).
● Proteomica Quantitativa DIA: Adotta a modalità di acquisizione indipendente da i dati (DIA), scansionendu tutti l'ioni in finestre segmentate per catturà l'infurmazioni cumplette nantu à l'ioni. Vantaghji: Migliore ripetibilità, maggiore copertura proteica è quantificazione più precisa chè a modalità DDA (TMT/Label Free), ideale per studii di grandi campioni.
● Proteomica Quantitativa Senza Etichette 4D/Proteomica Quantitativa 4D-DIA: Basata annantu à u spettrometru di massa Bruker timsTOF, aghjunghjendu a mobilità ionica (sezione trasversale di collisione) à a separazione 3D tradiziunale. Vantaghji: Migliore utilizzazione è precisione di l'ioni, miglioramentu cumpletu di a prufundità di cupertura, sensibilità è rendimentu; prufundità d'identificazione più alta chè u metudu 3D tradiziunale.
● Proteomica Quantitativa senza Label Astral/Proteomica Quantitativa Astral DIA: Basata nantu à u spettrometru di massa à alta risoluzione OrbitrapTM AstralTM. Vantaghji: Rendimentu più altu (più di 100 campioni/ghjornu cù gradiente di 8 minuti), cupertura più prufonda (più di 8.000 proteine rilevate in e cellule Hela in 8 minuti) è sensibilità più alta (menu campione necessariu).
● Proteomica Quantitativa TMT: Utilizza 18 etichette isotopiche per etichettà i peptidi per a rilevazione simultanea di 18 campioni. Vantaghji: Alta stabilità (interferenza minima di stabilità di u strumentu, errore di sistema chjucu) è alta sensibilità (a frazziunazione riduce a cumplessità di u campione, migliurendu a rilevazione di proteine in bassa abbundanza).
● PRM Targeted Proteomics: Tecnulugia mirata à alta risoluzione per a rilevazione selettiva di proteine/peptidi bersagli. Vantaghji: Permette a quantificazione relativa/assoluta è a verificazione di i risultati proteomichi quantitativi; nisuna restrizione di l'anticorpi, applicabilità più larga chè Western Blot è ELISA.
Vantaghji
● Attrezzatura Avanzata: Equipata sia cù piattaforme proteomiche cunvenziunali sia cù spettrometri di massa avanzati à alta prufundità (per esempiu, 4D, Astral).
● Rilevazione Stabile: Sistemi rigorosi di cuntrollu di qualità assicuranu prucessi di prova consistenti è stabili.
● Risultati affidabili: L'analisi qualitativa è quantitativa simultanea furnisce l'espressione relativa, u pesu moleculare, l'abbundanza è altri dati chjave per ogni gruppu.
● Alta automatizazione: I sistemi LC-MS automatizati permettenu analisi rapide è eccellenti prestazioni di separazione.
Specifiche di serviziu
| Paragone di Tecniche Proteomiche Non Mirate | ||||
| Senza etichetta | DIA | TMT | ||
| Etichettatura | NO | NO | IÈ | |
| Modu di scansione di dati | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Riproducibilità | Più bassu | Altu | Altu | |
| Sensibilità | Più bassu | Altu | Altu | |
| Multiplexazione | NO | IÈ | NO | IÈ |
| Applicazione | Cunfruntà a prisenza/assenza di proteine | Campioni à grande scala | Analisi di diversi lotti di campioni | Cunfruntendu l'espressione differenziale di e proteine in a listessa spezia è tissutu |
| Precisione | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Conte di rilevazione | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Requisiti di Campione
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Flussu di travagliu di serviziu
Raccolta di Campioni
Estrazione di Metaboliti
Digestione enzimatica
Separazione
Acquisizione di dati
Analisi di i dati
Cunsegna di dati
Proteomica Qualitativa
1. Soluzione/gel di proteine: tabella di risultati qualitativi
2. Risultati di a ricerca in a basa di dati
2.1 Lista di segmenti peptidici currispondenti à a ricerca in a basa di dati
2.2 Lista di proteine currispondenti à a ricerca di a basa di dati
2.3 Lista di mudificazioni currispundenti à a ricerca in a basa di dati (fosforilazione, ubiquitinazione, ecc.)
3. Dati grezzi
Proteomica Quantitativa(Senza Etichetta/DIA/TMT)
1. Preelaborazione di dati
1.1 Ricerca in a basa di dati di proteine
2. Analisi di l'espressione di e proteine
2.1 Analisi di i cumpunenti principali (PCA)
2.2 Deviazione Standard Relativa (RSD)
2.3 Distribuzione di tendenza di K-means
2.4 Valutazione di a riproducibilità
2.5 Mappa di calore di l'espressione di e proteine
3. Annotazione Funzionale
3.1 Annotazione Funzionale GO
3.2 Annotazione Funzionale KEGG
3.3 Annotazione Funzionale COG
3.4 Annotazione Funzionale GOslim
3.5 Annotazione di u duminiu di a struttura di a proteina Pfam
4. Analisi Differenziale di e Proteine (repliche biologiche ≥ 3)
4.1 Risultati di l'analisi differenziale di e proteine
4.2 Distribuzione di i cambiamenti di piegamentu differenziale di e proteine (FC)
4.3 Analisi statistica di a quantità differenziale di proteine
4.4 Graficu di u vulcanu di proteine differenziali
4.5 Mappa di calore di raggruppamentu di proteine differenziali
4.6 Analisi di l'Annotazione Funzionale è di l'Arricchimentu di e Proteine Differenziali GO
4.7 Analisi di l'Annotazione Funzionale è di l'Arricchimentu di e Proteine KEGG Differenziali
4.8 Annotazione Funzionale COG di Proteine Differenziali
4.9 Analisi di l'Annotazione è di l'Arricchimentu Differenziale di e Proteine GOslim
4.10 Annotazione di u Dominiu di a Struttura Differenziale di e Proteine è Analisi di l'Arricchimentu
5. Analisi di l'interazione di a rete di proteine
6. Annotazione di a Via di u Reattomu di e Proteine
7. Previsione di Peptidi di Segnale
8. Localizazione subcellulare di e proteine
Proteomica Quantitativa(PRM)
1. Risultati di a quantificazione di e proteine PRM
1.1 Panoramica di i risultati di quantificazione
1.2 Distribuzione di e zone di piccu di ioni di frammenti per i segmenti di peptidi
Proteomica Quantitativa
1.Analisi di l'Espressione di e Proteine
↑Analisi di i cumpunenti principali (PCA)↑Deviazione Standard Relativa (RSD)
↑Distribuzione di tendenza di K-means ↑CorrelazioneAanalisi diPproteinaEespressioneLlivelli
↑ Mappa di calore di l'espressione di e proteine
2. Annotazione Funzionale
↑Annotazione Funzionale GO↑Annotazione Funzionale KEGG
↑ Annotazione Funziunale COG ↑ Annotazione Funziunale GOslim
↑ Annotazione di u duminiu di a struttura di e proteine Pfam
3.Analisi di l'Interazione di a Rete di Proteine
↑ Analisi di l'interazione di a rete di proteine
4.Previsione di Peptidi di Segnale
↑ Previsione di Peptidi di Segnale
5. Localizazione subcellulare di e proteine
↑Localizazione subcellulare di e proteine
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