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Sequenziamentu di Picculi RNA-Illumina

L'ARN chjucu hè un gruppu di molecule d'ARN chì includenu microARN (miARN), picculi ARN interferenti (siARN) è ARN chì interagiscenu cù i piwi (piARN). Trà questi, i miARN, longhi circa 18-25 nucleotidi, sò particularmente degni di nota per i so roli regulatori chjave in diversi prucessi cellulari. Cù mudelli d'espressione specifichi di i tessuti è di u stadiu, i miARN mostranu una alta cunservazione in diverse spezie.

Piattaforma: Illumina NovaSeq


Dettagli di u serviziu

Bioinformatica

Risultati di a Dimostrazione

Publicazioni in evidenza

Funziunalità

● Preparazione di a biblioteca di selezzione di e dimensioni.

● Analisi bioinformatica centrata nantu à a predizione è i bersagli di miRNA.

Vantaghji di u serviziu

Una vasta cumpetenzaAvemu trattatu più di 300 campioni, chì abbraccianu diversi tipi di campioni. Purtemu a ricchezza di a nostra cumpetenza à ogni prughjettu.

Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di i campioni à a preparazione di e biblioteche, u sequenziamentu è a bioinformatica. U nostru monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.

Analisi bioinformatica cumpleta:Permette l'identificazione di miRNA cunnisciuti è novi, l'identificazione di miRNA bersagli, è l'annotazione funzionale currispundente è l'arricchimentu cù parechje basi di dati (KEGG, GO).

Assistenza post-venditaCapimu quantu hè impurtante esse presente, hè per quessa chì u nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.

 

Requisiti di Campione è Cunsegna

Biblioteca

Piattaforma

Dati cunsigliati

QC di i dati

Taglia selezziunata

Illumina SE50

10M-20M letture

Q30≥85%

Requisiti di u campione:

Nucleotidi:

Cunc. (ng/μl)

Quantità (μg)

Purezza

Integrità

≥ 80

≥ 0,8

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Cuntaminazione limitata o assente di proteine ​​o DNA mostrata nantu à u gel.

RIN≥6.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

elevazione di basa limitata o inesistente

● Piante:

Radice, fustu o petalu: 450 mg

Foglia o Seme: 300 mg

Frutta: 1,2 g

● Animale:

Core o Intestinu: 450 mg

Viscera o Cervellu: 240 mg

Musculu: 600 mg

Ossa, Capelli o Pelle: 1,5 g

● Artropodi:

Insetti: 9g

Crustacei: 450 mg

● Sangue interu2 tubi

● Cellule: 106 cellule

● Serumu è Plasma:6 mL

Cunsegna di Campioni Raccomandata

Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)

Etichettatura di mostra: Raggruppamentu + replicazione per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Spedizioni:

1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.

2. Tubi RNAstabili: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.

Flussu di travagliu di serviziu

Campione di QC

Cuncepimentu di l'esperimentu

consegna di campioni

Cunsegna di campioni

Esperimentu pilotu

Estrazione di ARN

Preparazione di a Biblioteca

Custruzzione di a biblioteca

Sequenziamentu

Sequenziamentu

Analisi di dati

Analisi di dati

Servizii dopu a vendita

Servizii dopu a vendita


  • Precedente:
  • Dopu:

  • Bioinformatica

    wps_doc_14● Cuntrollu di a qualità di i dati grezzi

    ● Classificazione di i picculi ARN

    ● Espressione di miRNA è analisi di espressione differenziale

    ● Gene di destinazione di miRNA è annotazione di u genu di destinazione di miRNA espressu differenzialmente

    ● Annotazione di u genu bersagliu è arricchimentu di a funzione di u genu miRNA espressu differenzialmente

    Identificazione di miRNA: struttura è prufundità

     

     

     struttura-precursore-miRNA-è-prufundità-di-sequenziamentu

     

    Espressione differenziale di miRNA - raggruppamentu gerarchicu

     

     

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    Annotazione funzionale di u bersagliu di miRNA espressi in modu differenziale

     

     

    图片35

    Esplora i progressi di a ricerca facilitati da i servizii di sequenziamentu di sRNA di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.

      

    Chen, H. et al. (2023) 'L'infezioni virali inibiscenu a biosintesi di a saponina è a fotosintesi in Panax notoginseng',Fisiologia Vegetale è Biochimica, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.

    Li, H. et al. (2023) 'A proteina FREE1 chì cuntene u duminiu FYVE di a pianta s'associa cù i cumpunenti di u microprocessore per reprimere a biogenesi di i miRNA',Rapporti EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.

    Yu, J. et al. (2023) 'U MicroRNA Ame-Bantam-3p cuntrolla u sviluppu di a pupa larvale mirendu u genu 8 (megf8) di i duminii multipli simili à u fattore di crescita epidermica in l'ape, Apis mellifera',Rivista Internaziunale di Scienze Moleculari, 24(6), p. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.

    Zhang, M. et al. (2018) 'L'analisi integrata di MiRNA è geni assuciati à a qualità di a carne rivela chì Gga-MiR-140-5p influenza a deposizione di grassu intramusculare in i polli',Fisiologia Cellulare è Biochimica, 46 (6), pp. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.

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