10x prostorový transkriptom Genomics Visium
Výhody služby
1) Komplexní služba integruje všechny kroky založené na zkušenostech a dovednostech, včetně kryořezů,HE barvení, optimalizace tkání, prostorové čárové kódování, příprava knihoven, sekvenování a bioinformatika
2) Vysoce kvalifikovaná technická skupina se zkušenostmi s více než 250 typy tkání, více než 50 druhy včetně lidí, myší, savců, ryb a rostlin
3) Aktualizace celého projektu v reálném čase s plnou kontrolou průběhu experimentu
4) Komplexní standardní bioinformatický balíček s 29 analýzami, 100+ vysoce kvalitními čísly
5) Vlastní analýza dat a vizualizace dostupné pro různé výzkumné požadavkys
Specifikace služby
| Knihovna | Strategie sekvenování | Doporučené údaje | Vzorové požadavky |
| Knihovna cDNA 10X Visium | 10x Visium-Illumina PE150 | 60 Gb/vzorek | OCT vložené kryo vzorky; FFPE vzorky (Optimální průměr: cca 6x6x6 mm3) |
Chcete-li získat další podrobnosti o pokynech pro přípravu vzorků a pracovním postupu služeb, neváhejte se obrátit na aExpert BMKGENE
Tok servisní práce
Návrh experimentu
Vzorová dodávka
Předexperiment
Prostorové čárové kódování
Stavba knihovny
Sekvenování
Analýza dat
Poprodejní služby
1)Kontrola kvality dat
Výstup dat a distribuce skóre kvality
Detekce genů na místě
Pokrytí tkání
2)Analýza vnitřního vzorku
Detekce genů
Bodové shlukování
Diferenciální analýza mezi shluky
3)Meziskupinová analýza
Kombinace dat
Bodové shlukování společných dat
Diferenciální analýza mezi skupinami
1.Shlukování skvrn
2.Prostorová distribucemarkerových genů
3. Tepelná mapa shlukování výrazu markerů
4.Mezivzorková analýza dat
