-
Integrace ATAC-seq a RNA-seq k odhalení regulačních mechanismů genové exprese
Integrace ATAC-seq a RNA-seq k odhalení regulačních mechanismů genové exprese Od genové exprese k genové regulaci Pochopení toho, jak se genová exprese mění za různých biologických podmínek, je základním cílem moderní genomiky. Sekvenování RNA (RNA-seq) poskytuje mocný...Číst dále -
Multi-omické aplikace v biotechnologii: Od biologických objevů k technickým řešením
Multi-omické aplikace v biotechnologii: Od biologických objevů k technickým řešením Biotechnologie využívá živé organismy, buňky, biologická společenstva a biomolekuly k vývoji cenných produktů, rozvoji technologií a řešení průmyslových, environmentálních a zdravotních výzev...Číst dále -
SLAF-seq: Nástroj pro odhalení genetické variability napříč populacemi
SLAF-seq: Flexibilní přístup ke genetickým studiím v populačním měřítku Co je SLAF-seq? Sekvenování amplifikovaných fragmentů se specifickým lokusem (SLAF-seq) je technika sekvenování genomu s redukovanou reprezentací používaná k objevování genetických markerů napříč genomem, aniž by nutně vyžadovala referenční geno...Číst dále -
Odemykání rostlinných vlastností prostřednictvím epigenomiky v šlechtění polyploidních plodin
Odemykání rostlinných vlastností prostřednictvím epigenomiky v šlechtění polyploidních plodin 1. Úvod: Polyploidní paradox a další informace Sekvence DNA Mnoho z nejdůležitějších plodin na světě, včetně chlebové pšenice (Triticum aestivum), bavlny (Gossypium hirsutum), řepky (Brassica napus) a brambor (Solanum t...Číst dále -
Zkreslení referenčního genomu: Proč je důležitý výběr správného referenčního genomu
Zkreslení referenčního genomu: Proč je důležitý výběr správného referenčního genomu Ať už provádíte sekvenování celého genomu (WGS), sekvenování RNA (RNA-seq) nebo sekvenování s redukovanou reprezentací, jako je SLAF-seq, jedním z prvních kroků v analýze dat je zarovnání sekvenčních čtení s referenčním genomem...Číst dále -
Omikové strategie ve výzkumu vodních živočichů
Omické strategie ve výzkumu vodních živočichů Vodní živočichové zahrnují ryby, měkkýše, korýše, bentické bezobratlé a mořské obratlovce. Vyznačují se pozoruhodnou druhovou rozmanitostí, jedinečnými genomickými rysy a silnou fenotypovou plasticitou v reakci na změny prostředí...Číst dále -
Od markerových genů k DNA celého společenství: Komplexní srovnání metagenomického sekvenování amplikonů a brokovnic
Od markerových genů k DNA celého společenství: Komplexní srovnání metagenomického sekvenování amplikonů a brokovnic. Výzkum mikrobiálních společenstev poskytuje základní základ pro odhalení skrytých interakcí v půdních, vodních, střevních a dalších ekosystémech životního prostředí. K dekódování...Číst dále -
Epigenetika v reálném čase: Odemykání modifikací RNA pomocí přímého sekvenování s nanopóry
Epigenetika v reálném čase: Odemykání modifikací RNA pomocí přímého sekvenování s nanopóry Abychom plně pochopili buněčné funkce, vývoj a progresi onemocnění, musíme se podívat za samotnou sekvenci DNA a prozkoumat další vrstvy biologické informace, které regulují genovou aktivitu...Číst dále -
Propojení taxonomie, funkce a metabolismu prostřednictvím integrace multi-omiky
Propojení taxonomie, funkce a metabolismu prostřednictvím integrace multi-omiky Rostoucí využívání technologií multi-omiky ke studiu nemocí a environmentálních systémů vytvořilo rostoucí potřebu integrace datových sad napříč různými vrstvami biologie. Ve studiích mikrobiomu je tato integrace...Číst dále -
Od vzorku k sekvenci: Nejlepší postupy pro přípravu vzorků z prostředí v mikrobiomovém výzkumu
Od vzorku k sekvenci: Nejlepší postupy pro přípravu environmentálních vzorků ve výzkumu mikrobiomu Environmentální mikrobiologie transformovala naše chápání mikrobiálních ekosystémů – od půdy a vody až po lidské tělo. V osvědčených postupech ve výzkumu mikrobiomu však jedna pravda zůstává konzistentní...Číst dále -
Případová studie: Konstrukce největšího a geneticky nejrozmanitějšího pangenomu grafu bavlníku z horských oblastí
Případová studie: Konstrukce největšího a geneticky nejrozmanitějšího pangenomu grafu bavlníku z horských oblastí 2026 Průlom: Byl zkonstruován největší a geneticky nejrozmanitější pangenom bavlníku z horských oblastí (Gossypium hirsutum) na světě. BMKGENE spolupracoval na sekvenování genomu (PacBio...Číst dále -
Sekvenování s ultra dlouhým čtením: klíčový nástroj pro vysoce kvalitní sestavení genomu na úrovni T2T
Sekvenování ultra dlouhých čtecích cyklů: klíčový nástroj pro vysoce kvalitní sestavení genomu na úrovni T2T. Neustálý pokrok v referenčních genomech. Referenční genomy slouží jako základní páteř pro genomickou a multi-omickou analýzu dat a vysoce kvalitní referenční genomy jsou klíčové pro hloubkovou analýzu druhů...Číst dále -
Jak pokročilá analýza hWGS/WES podporuje výzkum v precizní onkologii
Jak pokročilá analýza hWGS/WES podporuje výzkum v přesné onkologii Nádorové genomy jsou jedinečně složité. Na rozdíl od vzorků zárodečné linie mohou rakovinné tkáně nést somatické mutace, změny počtu kopií, strukturální přeskupení, klonální heterogenitu a odlišné mutační signatury, které odrážejí...Číst dále
