Imunoprecipitační sekvenování chromatinu (ChIP-seq)
Výhody služby
●Pokročilá bioinformatická analýza a komplexní anotace:Využíváme několik databází k funkční anotaci genů spojených s oblastmi vazby protein-DNA, což poskytuje poznatky o buněčných a molekulárních procesech, které jsou základem této interakce.
●Poprodejní podpora:Náš závazek sahá i nad rámec dokončení projektu a zahrnuje 3měsíční poprodejní servis. Během této doby nabízíme následnou péči o projekt, pomoc s řešením problémů a diskuze s otázkami a odpověďmi, kde zodpovíme veškeré dotazy týkající se výsledků.
●Rozsáhlé zkušenosti:Naše společnost má za sebou úspěšné dokončení řady projektů ChIP-Seq a přináší více než desetileté zkušenosti. Náš vysoce kvalifikovaný analytický tým spolu s komplexní obsahovou a poprodejní podporou zaručuje úspěch vašich projektů.
● Přísná kontrola kvalityVe všech fázích, od přípravy vzorků a knihoven až po sekvenování a bioinformatiku, implementujeme klíčové kontrolní body. Toto pečlivé monitorování zajišťuje konzistentně vysoce kvalitní výsledky.
Specifikace služby
| Knihovna | Strategie sekvenování | Doporučený výstup dat | Kontrola kvality |
| Purifikovaná DNA po imunoprecipitaci | Illumina PE150 | 10 GB | Q30≥85% |
Požadavky na vzorek
Celkové množství: ≥10 ng
Distribuce velikosti fragmentů: 100–750 bps
Pracovní postup služby
Dodání vzorku
Výstavba knihovny
Sekvenování
Analýza dat
Poprodejní služby
Zahrnuje následující analýzu:
● Kontrola kvality nezpracovaných dat
● Vyhodnocování vrcholů na základě mapování referenčního genomu
● Anotace genů asociovaných s vrcholy
● Analýza motivů: identifikace vazebných míst transkripčních faktorů (TFBS)
● Analýza diferenciálních píků a anotace
Vyhodnocení obohacení v blízkosti míst zahájení transkripce (TSS)
Distribuce vrcholů CHIP v celém genomu
Klasifikace oblastí píků
Funkční obohacení genů souvisejících s vrcholy (KEGG)
