Illumina a BGI
Funkce
●Platformy:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten a BGI-DNB-T7
●Režimy sekvenování:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrola kvality knihoven před sekvenováním
●Doručování sekvenačních dat a kontrola kvality:dodání zprávy o kontrole kvality a nezpracovaných dat ve formátu fastq po demultiplexování a filtrování čtení Q30.
Výhody služby
●Všestrannost sekvenačních služeb:zákazník si může vybrat řazení podle pruhu, průtokové buňky nebo množství dat.
●Všestrannost platforem:Knihovny DNB lze přenést na platformy Illumina
●Rozsáhlé zkušenosti se sekvenační platformou Illumina:s tisíci uzavřenými projekty s různými druhy.
●Doručení zprávy o sekvenování kontroly kvality:s metrikami kvality, přesností dat a celkovou výkonností projektu sekvenování.
●Zralý proces sekvenování:s krátkou dobou obratu.
●Přísná kontrola kvality: zavádíme přísné požadavky na kontrolu kvality, abychom zaručili poskytování trvale vysoce kvalitních výsledků.
Vzorové požadavky*
Částečné řazení jízdních pruhů
| Množství dat (X) | Koncentrace (qPCR/nM) | Hlasitost |
| X ≤ 50 Gb | > 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | > 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | > 4 nM | ≥ 20 μl |
Jeden pruh (Illumina)
| Plošina | Koncentrace (qPCR/nM) | Hlasitost |
| HiSeq X Ten | > 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | > 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | > 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Kromě koncentrace a celkového množství je také vyžadován vhodný vzor píku.
Pokud vaše vzorky nesplňují požadavky na výchozí materiál, kontaktujte nás.
Pracovní postup služby
Kontrola kvality knihovny
Sekvenování
Kontrola kvality dat
Dodání projektu
Zpráva QC knihovny
Zpráva o kvalitě knihovny je poskytnuta před sekvenováním, posouzením množství knihovny a fragmentací.
Sekvenční QC zpráva
Tabulka 1. Statistika údajů o sekvenování.
| ID vzorku | BMKID | Syrové čtení | Nezpracovaná data (bp) | Čisté čtení (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Obrázek 1. Distribuce kvality podél odečtů v každém vzorku
Obrázek 2. Základní distribuce obsahu
Obrázek 3. Rozložení čteného obsahu v sekvenčních datech
