produkty

Sekvenování DNA/RNA – Nanopore Sequencer

Sekvenování DNA/RNA – obrázek doporučený sekvenátorem nanoporů

ONT sekvenování je technologie sekvenování elektrických signálů v reálném čase s jednou molekulou založená na nanopórech, princip sekvenování každé platformy je stejný.Dvouřetězcová DNA/RNA se naváže na nanoporézní protein uložený v biofilmu a odvíjí se pod vedením motorického proteinu, působením rozdílu napětí z obou stran biofilmu procházejí řetězce DNA/RNA proteinem nanopórového kanálu v určitém čase. hodnotit.Vzhledem k rozdílům v chemických vlastnostech různých bází na řetězci DNA/RNA, když jedna báze nebo molekula DNA prochází nanopórovým kanálem, způsobí změnu různých elektrických signálů.Detekcí a odpovídajícím těmto signálům lze vypočítat odpovídající typy bází a dokončit detekci sekvence v reálném čase.

Kontaktujte nás

Podrobnosti o službě

Demo výsledek

Detaily služby Vlastnosti

Plošina	Velikost knihovny	Teoretický datový výtěžek (na buňku)	Jednobázová přesnost	Aplikace
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 Gb/buňka	85–92 %	Volání SV, De novo, Sekvenování v plné délce, Iso-Seq, Anotace genu, Detekce metylace DNA

Výhody služby

● Více než 5 let zkušeností se sekvenační platformou PacBio s tisíci uzavřených projektů s různými druhy.
● BMKGENE je oficiálním partnerem Oxford Nanopore s certifikací duální platformy RNA/DNA.
● Existují mainstreamové modely sekvencerů s kompletní výbavou a dostatečnou propustností sekvenování.
● Na základě platformy Nanopore bylo v mezinárodně uznávaných časopisech publikováno více než 10 zvířecích a rostlinných výzkumů Denovo.

Vzorové požadavky

Typ vzorku

Množství

Koncentrace (Qubit ®)

Hlasitost

Čistota

Ostatní

Genomová DNA

Závisí na požadavcích na data

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Jasný pík při 260 nm, žádné kontaminace

Koncentraci je třeba měřit pomocí Qubit a Qubit/Nanopore ≤ 2

Celková RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；žádné znečištění

Hodnota RIN ≥7,5

Pracovní postup služby

příprava vzorků

Stavba knihovny

Sekvenování

Analýza dat

Dodání projektu

Předchozí: Sekvenování DNA/RNA – Illumina Sequencer

Další: Sekvence zesíleného fragmentu specifického lokusu (SLAF-Seq)

Posouzení kvality dat vzorku DNA

Tabulka 1. Statistika čistých dat.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26,37	1,121,736	25,90	28 014	15,764	23 090	143,181	9