Přihlaste se bmkcloud

Produkty

DNA/RNA sekvenování - sekvencer nanoporu

Sekvenování DNA/RNA - sekvencer Nanopore uváděný na obrázku

Sekvenování ONT je technologie sekvenování elektrického signálu v reálném čase založená na nanoporech v reálném čase, princip sekvenování každé platformy je stejný. Dvouřetězcová DNA/RNA se váže na nanoporézní protein zabudovaný do biofilmu a odvíjí se pod vedením motorického proteinu, pod účinkem rozdílu napětí od obou stran biofilmu, prameny DNA/RNA procházejí proteinem nanopore v jistém hodnotit. V důsledku rozdílů chemických vlastností různých bází na řetězci DNA/RNA, když jedna báze nebo molekula DNA prochází kanálem nanopore, způsobí změnu různých elektrických signálů. Detekcí a odpovídajícím těmto signálům lze vypočítat odpovídající typy bází a detekci sekvence v reálném čase lze dokončit.

Kontaktujte nás

Podrobnosti o službě

Výsledek demo

Funkce podrobností o službě

Platforma	Velikost knihovny	Teoretický výnos dat (na buňku)	Přesnost jedné základny	Aplikace
Nanopore	8 kB, 10 kB, 20 kB, ultraloga, cDNA-PCR	70-90GB/buňka	85-92%	SV volání, de novo, sekvenování plné délky, iso-seq, anotace genu, detekce methylace DNA

Výhody služeb

● Více než 5 let zkušeností na sekvenční platformě Pacbio s tisíci uzavřených projektů s různými druhy.
● BMKGENE je oficiálním partnerem Oxford Nanopore s duální certifikací RNA/DNA s dvojitou platformou.
● Existují hlavní modely sekvencerů s kompletním vybavením a dostatečným propustností sekvenování.
● Na základě platformy Nanopore bylo v mezinárodních renomovaných časopisech publikováno více než 10 výzkumů pro zvířata a rostliny.

Vzorkové požadavky

Typ vzorku

Množství

Koncentrace (Qubit ®)

Objem

Čistota

Ostatní

Genomická DNA

Závisí na požadavcích na data

≥20NG/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5 ；

Jasný vrchol při 260 nm ， žádné kontaminace

Koncentrace je třeba měřit qubit a qubit/nanopore ≤ 2

Celková RNA

≥1,2 μg

≥ 100 μg/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Žádné kontaminace

Hodnota RIN ≥ 7,5

Pracovní postup služeb

Příprava vzorku

Knihovna konstrukce

Sekvenování

Analýza dat

Dodávka projektu

Předchozí: Illumina předem vyrobené knihovny

Další: Specifické sekvenování fragmentu zesilované specifické lokus (SLAF-seq)

Posouzení kvality dat vzorku DNA

Tabulka 1. Statistiky čistých dat.

BMKID	Rawseqnum	Rawsumbase	Cleanseqnum	CleanSumbase	Cleann50Len	Cleann90Len	CleanMeanlen	Cleamaxlen	Cleanmeanqual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143,181	9