Předpřipravené knihovny DNBSEQ
Funkce
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Režimy sekvencování:PE150
●Převod knihoven Illuminy doMGI:umožňuje sekvenování velkých objemů dat za nízké náklady.
●Kontrola kvality knihoven před sekvenováním.
●Kontrola kvality a dodání sekvenčních dat:Dodání zprávy o kontrole kvality a nezpracovaných dat ve formátu fastq po demultiplexování a filtrování čtení Q30.
Výhody
●Všestrannost sekvenčních služeb:Zákazník si může zvolit řazení podle jízdního pruhu nebo množství dat.
●Vysoký datový výstup:1500 Gb/pruh
●Dodání zprávy o kontrole kvality sekvenování:s metrikami kvality, přesností dat a celkovým výkonem sekvenčního projektu.
●Proces sekvenování pro dospělé:s krátkou dobou obratu.
●Přísná kontrola kvalityZavádíme přísné požadavky na kontrolu kvality, abychom zaručili dosažení konzistentně vysoce kvalitních výsledků.
Požadavky na vzorek
| Množství dat (X) | Koncentrace (qPCR/nM) | Objem | |
| Částečný pruh
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 GB < X ≤ 50 GB | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 GB < X ≤ 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4 nM | ||
| Jeden pruh | Per Lane | ≥ 1,5 nM / soubor knihovny | ≥ 25 μl / soubor knihovny |
Kromě koncentrace a celkového množství je také vyžadován vhodný profil píku.
Poznámka: Sekvenování drah knihoven s nízkou diverzitou vyžaduje přidání PhiX spike-in pro zajištění robustního vyhledávání bází.
Doporučujeme odeslat předem sdružené knihovny jako vzorky. Pokud požadujete, aby BMKGENE prováděl sdružování knihoven, podívejte se prosím na
požadavky knihovny pro částečné řazení jízdních pruhů.
Velikost knihovny (mapa vrcholů)
Hlavní vrchol by měl být v rozmezí 300-450 bp.
Knihovny by měly mít jeden hlavní pík, žádnou kontaminaci adaptéry a žádné dimery primerů.
Pracovní postup služby
Zpráva o kontrole kvality knihovny
Před sekvenováním, posouzením množství knihovny a fragmentace je poskytnuta zpráva o kvalitě knihovny.
Zpráva o kontrole kvality sekvenování
Tabulka 1. Statistiky sekvenčních dat.
| ID vzorku | BMKID | Nezpracované čtení | Nezpracovaná data (bp) | Čisté přečtení (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Obrázek 1. Distribuce kvality podél čtení v každém vzorku
Obrázek 2. Distribuce základního obsahu
Obrázek 3. Distribuce obsahu čtení v sekvenčních datech
