BMKCloud Log in
条形 banner-03

produkty

Analýza asociací v celém genomu

Genomová asociační studie (GWAS) se zaměřuje na identifikaci genetických variant (genotypů), které jsou spojeny se specifickými vlastnostmi (fenotyp).Studie GWAS zkoumá genetické markery napříč celým genomem velkého počtu jedinců a předpovídá asociace genotyp-fenotyp statistickou analýzou na úrovni populace.Široce se používá při výzkumu lidských nemocí a funkční těžbě genů na komplexních vlastnostech zvířat nebo rostlin.


Podrobnosti o službě

Demo výsledek

Doporučená publikace

obrázek3

1. Výhody služby

● Abundant Project Cases: od svého založení v roce 2009 dokončila BMKGENE stovky druhů projektů v populačním výzkumu GWAS, pomohla výzkumníkům publikovat více než 100 článků a kumulativní impakt faktor dosáhl 500.
● Profesionální analytici.
● Krátký cyklus analýzy.
● Přesné dolování dat.

2. Specifikace služby

Typ

Populační měřítko

Strategie sekvenování a hloubka

SLAF-GWAS Číslo vzorku ≥200 Velikost genomu < 400M, s referenčním genomem, doporučuje se WGS

Velikost genomu ≤ 1G, 100K tagů a 10X

1G ≤ Velikost genomu ≤ 2G, 200 000 tagů a 10X

Velikost genomu > 2G, 300K tagů a 10X

WGS-GWAS

Číslo vzorku ≥200

10X za každý vzorek

3. Výběr materiálu

动物1
动物2
obrázek7

Různé variety, poddruhy, krajové rasy/genové banky/smíšené rodiny/divoké zdroje

Různé odrůdy, poddruhy, krajové rasy

Rodina polovičního sourozence/rodina úplného sourozence/divoké zdroje

4. Bioinformační analýza

● Analýza asociací v rámci celého genomu
● Analýza a screening významného SNP
● Funkční anotace kandidátního genu

5. Tok servisních prací

Ukázka kontroly kvality

Návrh experimentu

dodání vzorku

Vzorová dodávka

Pilotní experiment

Extrakce RNA

Příprava knihovny

Stavba knihovny

Sekvenování

Sekvenování

Analýza dat

Analýza dat

Poprodejní služby

Poprodejní služby


  • Předchozí:
  • Další:

  • A.Fenotyp QC

    Histogram rozdělení frekvencí

    obrázek9

    Statistika fenotypů

    obrázek 10

    b.Asociační analýza (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    Zápletka QQ

    obrázek 11

    Spiknutí na Manhattanu

    Amonia_emmax_manhattan_00

    Rok

    Časopis

    IF

    Titul

    2022

    NC

    17,69

    Genomický základ giga-chromozomů a giga-genomu stromové pivoňky Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Stopy domestikace ukotvují genomické oblasti agronomického významu v sójových bobech

    2018

    MP

    9.32

    Resekvenování celého genomu celosvětové sbírky přírůstků řepky odhaluje genetický základ jejich ekotypové divergence

    2022

    HR

    7.29

    Analýza asociací v rámci celého genomu poskytuje molekulární pohledy na přirozené variace velikosti semen melounu

    získat cenovou nabídku

    Zde napište svou zprávu a pošlete nám ji

    Pošlete nám svou zprávu: