Dlouhé nekódující sekvenční-ilumina
Výhody služeb
●Společná analýza mRNA a lncRNA: Kombinací kvantifikace transkriptů mRNA se studiem lncRNA a jejich cílů je možné získat hloubkový přehled regulačního mechanismu, který je základem buněčné odpovědi.
●Rozsáhlé odborné znalosti: Náš tým přináší do každého projektu bohaté zkušenosti, s výsledkem zpracování více než 23 000 vzorků v BMK zahrnující rozmanité typy vzorků a projektů lncRNA.
●Přísná kontrola kvality: Implementujeme základní kontrolní body ve všech fázích, od přípravy vzorku a knihovny po sekvenování a bioinformatiku. Toto pečlivé monitorování zajišťuje dodávání trvale vysoce kvalitních výsledků.
●Podpora po prodeji: Náš závazek přesahuje dokončení projektu s 3měsíční obdobím servisního období. Během této doby nabízíme sledování projektů, pomoc při řešení problémů a sezení otázek a odpovědí k řešení jakýchkoli dotazů souvisejících s výsledky.
Ukázkové požadavky a doručení
| Knihovna | Platforma | Doporučená data | Data QC |
| RRNA vyčerpaná směrová knihovna | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nukleotidy:
| Konc. (Ng/μl) | Částka (μg) | Čistota | Integrita |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Omezená nebo žádná kontaminace proteinu nebo DNA na gelu. | Rin≥6.0; 5,0≥28s/18s≥1,0; omezená nebo žádná výška výchozího linie |
● Rostliny:
Kořen, stonek nebo okvětní lístek: 450 mg
List nebo semeno: 300 mg
Ovoce: 1,2 g
● Zvíře:
Srdce nebo střevo: 450 mg
Viscera nebo mozek: 240 mg
Sval: 600 mg
Kosti, vlasy nebo kůže: 1,5 g
● Artropody:
Hmyz: 9G
Crustacea: 450 mg
● Celá krev:2 trubice
● Buňky: 106 buňky
● Sérum a plazma: 6 ml
Doporučené doručení vzorku
Kontejner: 2 ml odstředivé trubice (cínová fólie se nedoporučuje)
Značení vzorků: skupina+replikujte EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Zásilka:
1. Suchý led: Vzorky musí být zabaleny do pytlů a pohřbeny do suchého ledu.
2. Rnastabilní zkumavky: Vzorky RNA mohou být vysušeny ve stabilizační trubici RNA (např. RNASTABLE®) a dodávány v pokojové teplotě.
Tok servisní práce
Návrh experimentu
Ukázka doručení
Extrakce RNA
Knihovna konstrukce
Sekvenování
Analýza dat
Poprodejní služby
Bioinformatika
Analýza diferenciální exprese genu (DEGS)
Kvantifikace exprese lncRNA - shlukování
Obohacení cílových genů lncRNA
Analýza polohy kloubní mRNA a lncRNA - graf cirs (střední kruh je mRNA a vnitřní cicrlce je lncRNA)
Prozkoumejte pokroky usnadněné společností BMKGENE LNCRNA Equencing Services prostřednictvím kurátorské sbírky publikací.
Ji, H. a kol. (2020) „Identifikace, funkční predikce a klíčové ověření lncRNA ověření lncRNA souvisejících s chladným stresem u potkanů“, vědecké zprávy 2020 10: 1, 10 (1), s. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. a kol. (2021) „Integrativní transkriptomická analýza odhaluje imunitní mechanismus pro CYHV-3-rezistentní kmen kapry“, hranice v imunologii, 12, s. 687151. Doi: 10,3389/fimmu.2021.687151/bibtex.
Wang, XJ et al. (2022) „Prioritizace konkurenčních endogenních sítí regulace RNA v rakovině plic s malými buňkami: Molekulární charakteristiky a kandidáti na léky“, hranice v onkologii, 12, s. 904865. Doi: 10,3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xiao, L. a kol. (2020) „Genetická disekce sítě genové koexprese, která je základem fotosyntézy v populus“, Plant Biotechnology Journal, 18 (4), s. 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. a kol. (2022) „Globální regulační síť pro dysregulovanou expresi genu a abnormální metabolickou signalizaci v imunitních buňkách v mikroprostředí Gravesovy choroby a Hashimotovy tyreoiditidy“, hranice v imunologii, 13, s. 879824. Doi: 10,3389/fimmu.2022.879824/bibtex.
