Zvýraznění
V tomto dvouhodinovém webináři je naší velkou ctí pozvat šest odborníků na arénu genomiky plodin.Naši řečníci poskytnou hloubkový výklad dvou Ryeových genomických studií, které byly nedávno publikoványGenetika přírody:
1. Sestavení genomu na úrovni chromozomů poskytuje pohled na biologii, evoluci a agronomický potenciál žita
2. Vysoce kvalitní sestava genomu zvýrazňuje genomové vlastnosti žita a agronomicky důležité geny
Jsme také rádi, že máme Senior R&D Scientist of Biomarker Technologies, který se podělí o své zkušenosti s de novo sestavováním genomu.
Denní program
09:00 SEČ
Uvítací poznámky
Zheng Hong-kun
Zakladatel a CEO Biomarker Technologies
Teng Xing-wang
Prezident Školy pokročilých zemědělských věd Pekingské univerzity
09:15
Zlepšení zlepšení žita, tritikale a pšenice pomocí vysoce kvalitní referenční genomové sekvence
V tomto webináři nám Prof. Wang podal souhrnné informace o současném stavu genomického výzkumu triticeae a ukázal úspěch a průlom dvou vynikajících prací o studiích genomu Rye, které byly nedávno publikovány na Nature Genetics a představují celý výzkum. skupiny vedoucí a přispívající k práci.
09:25
Obilná genomika @ IPK Gatersleben
Obilné trávy kmene Triticeae byly hlavním zdrojem potravy v oblastech mírného pásma, které byly dlouho považovány za ohnisko při zlepšování plodin a šlechtění.Mezi všemi pěstovanými druhy je tento kmen známý svými extrémně složitými genomovými rysy včetně velkých velikostí genomu, vysokého obsahu TE, polyploidie atd. V této sekci nám prof. Nils Stein poskytl celkový úvod o IPK Gatersleben a aktuálním stavu obilovin genomický výzkum@IPK Gatersleben.
09:35
Sestavení genomu na úrovni chromozomů poskytuje pohled na biologii žita, evoluci a agronomický potenciál
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Žito (Secale cereale L.) je obilnina s výjimečně odolnou vůči klimatickým podmínkám, hojně využívaná k produkci vylepšených odrůd pšenice prostřednictvím introgresivní hybridizace, která disponuje celým repertoárem genů nezbytných pro hybridní šlechtění.Žito je alogamní a teprve nedávno domestikované, což umožňuje pěstovanému žitu přístup k rozmanitému a využitelnému divokému genofondu.Abychom dále zvýšili agronomický potenciál žita, vytvořili jsme anotovanou sestavu 7,9 Mbp žitného genomu v měřítku chromozomů a rozsáhle jsme ověřili jeho kvalitu pomocí sady molekulárních genetických zdrojů.Demonstrujeme aplikace tohoto zdroje pomocí široké škály vyšetřování.Prezentujeme poznatky o neúplné genetické izolaci kultivovaného žita od divokých příbuzných, mechanismy strukturální evoluce genomu, rezistenci vůči patogenům, toleranci vůči nízkým teplotám, systémy kontroly plodnosti pro hybridní šlechtění a výnosové přínosy introgresí žita a pšenice.
10:05
Vysoce kvalitní sestava genomu zvýrazňuje genomové vlastnosti žita a agronomicky důležité geny
Žito je cenná potravinářská a krmná plodina, důležitý genetický zdroj pro zlepšení pšenice a tritikale a nepostradatelný materiál pro efektivní srovnávací genomické studie trav.Zde jsme sekvenovali genom žita Weining, elitní odrůdy čínského žita.Sestavené kontigy (7,74 Gb) představovaly 98,47 % odhadované velikosti genomu (7,86 Gb), přičemž 93,67 % kontigů (7,25 Gb) bylo přiřazeno sedmi chromozomům.Opakující se prvky tvořily 90,31 % sestaveného genomu.Ve srovnání s dříve sekvenovanými genomy Triticeae vykazovaly retrotranspozony Daniela, Sumaya a Sumana silnou expanzi u žita.Další analýzy Weiningova sestavení vrhají nové světlo na genové duplikace v celém genomu a jejich dopad na geny biosyntézy škrobu, fyzikální organizace komplexních lokusů prolaminu, rysy genové exprese, které jsou základem znaku časného záhlaví, a domnělé chromozomální oblasti a lokusy v žitě spojené s domestikací.Tato sekvence genomu slibuje urychlení genomiky a šlechtitelských studií žita a příbuzných obilných plodin.
10:35
Výzvy, řešení a budoucnost pro sestavení genomu de novo
Genom vysoké kvality je základem genomického studia.Přestože rychlý vývoj v sekvenování a algoritmech umožnil mnohem jednodušší a efektivnější sestavení genomu, požadavky na přesnost a úplnost sestavení také rostou s prohlubujícími se výzkumnými cíli.V tomto příspěvku proberu současné populární technologie v sestavování genomu s několika úspěšnými případy a nahlédnu do budoucího vývoje.
Čas odeslání: leden-08-2022