Blatfform | Maint llyfrgell | Cynnyrch Data Damcaniaethol (y gell) | Cywirdeb un sylfaen | Ngheisiadau |
Nanopore | 8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cDNA-PCR | 70-90GB/Cell | 85-92% | Galw sv, de novo, dilyniant hyd llawn, iso-seq, anodi genynnau, canfod methylation DNA |
● Dros 5 mlynedd o brofiad ar blatfform dilyniannu Pacbio gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda rhywogaethau amrywiol.
● Mae BMKGENE yn bartner swyddogol yn Oxford Nanopore, gydag ardystiad RNA/DNA platfform deuol.
● Mae modelau prif ffrwd o ddilynwyr gydag offer cyflawn a thrwybwn dilyniant digonol.
● Yn seiliedig ar blatfform Nanopore, mae mwy na 10 o ymchwiliadau Denovo anifeiliaid a phlanhigion wedi'u cyhoeddi mewn cyfnodolion o fri rhyngwladol.
Math o sampl | Swm | Canolbwynt (qubit ®) | Nghyfrol | Burdeb | Eraill |
DNA Genomig | Dibynnu ar ofyniad data | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5 ; Copa clir ar 260 nm , dim halogiadau | Mae angen mesur crynodiad yn ôl qubit a qubit/nanopore ≤ 2 |
Cyfanswm yr RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ; Dim halogiadau | Gwerth rin ≥7.5 |
Asesiad ansawdd data o sampl DNA
Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.
Bmkid | rawseqnum | rawsumbase | CleanSeqnum | Cleansumbase | gleasn50len | glein90len | glân | CleanMaxlen | glân |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Asesiad ansawdd data o sampl RNA
Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.
Enw ffeil | Clientid | Readol | Basenum | N50 | MeanLength | MaxLength | MeanqScore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | C12 |
Ffigur 1. Darllenwch ddosbarthiad hyd
Ffigur 2. Dosbarthiad sgôr ansawdd data glân
Ffigur 3. Dosbarthiad Sgôr Hyd ac Ansawdd Data Glân