条形 baner-03

Chynhyrchion

Dilyniant DNA/RNA - Dilyniant Nanopore

Mae dilyniant ONT yn dechnoleg dilyniannu signal trydanol amser real moleciwl sengl yn seiliedig ar nanoporau, mae egwyddor dilyniannu pob platfform yr un peth. Bydd DNA/RNA â haen ddwbl yn rhwymo i brotein nanoporous wedi'i ymgorffori yn y biofilm ac yn dadflino o dan blwm protein modur, o dan weithred gwahaniaeth foltedd o ddwy ochr y biofilm, mae llinynnau DNA/RNA yn pasio trwy'r protein sianel nanopore ar rywfaint cyfradd. Oherwydd gwahaniaethau priodweddau cemegol y gwahanol seiliau ar y llinyn DNA/RNA, pan fydd un sylfaen neu foleciwl DNA yn mynd trwy'r sianel nanopore, bydd yn achosi newid gwahanol signalau trydanol. Trwy ganfod a chyfateb i'r signalau hyn, gellir cyfrifo'r mathau sylfaen cyfatebol, a gellir cwblhau canfod amser real y dilyniant.


Manylion y Gwasanaeth

Canlyniad Demo

Nodweddion Manylion y Gwasanaeth

Blatfform

Maint llyfrgell

Cynnyrch Data Damcaniaethol (y gell)

Cywirdeb un sylfaen

Ngheisiadau

Nanopore

8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cDNA-PCR

70-90GB/Cell

85-92%

Galw sv, de novo, dilyniant hyd llawn, iso-seq, anodi genynnau, canfod methylation DNA

Manteision gwasanaeth

● Dros 5 mlynedd o brofiad ar blatfform dilyniannu Pacbio gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda rhywogaethau amrywiol.
● Mae BMKGENE yn bartner swyddogol yn Oxford Nanopore, gydag ardystiad RNA/DNA platfform deuol.
● Mae modelau prif ffrwd o ddilynwyr gydag offer cyflawn a thrwybwn dilyniant digonol.
● Yn seiliedig ar blatfform Nanopore, mae mwy na 10 o ymchwiliadau Denovo anifeiliaid a phlanhigion wedi'u cyhoeddi mewn cyfnodolion o fri rhyngwladol.

Gofynion Sampl


Math o sampl

Swm

Canolbwynt (qubit ®)

Nghyfrol

Burdeb

Eraill

DNA Genomig

Dibynnu ar ofyniad data

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5 ;

Copa clir ar 260 nm , dim halogiadau

Mae angen mesur crynodiad yn ôl qubit a qubit/nanopore ≤ 2

Cyfanswm yr RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5 ; Dim halogiadau

Gwerth rin ≥7.5

 

Llif Gwaith Gwasanaeth

Paratoi sampl

Paratoi sampl

Paratoi Llyfrgell

Adeiladu Llyfrgell

Dilyniant

Dilyniant

Dadansoddiad Data

Dadansoddiad Data

Sampl QC

Cyflenwi Prosiect


  • Blaenorol:
  • Nesaf:

  • Asesiad ansawdd data o sampl DNA

    Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.

    Bmkid

    rawseqnum

    rawsumbase

    CleanSeqnum

    Cleansumbase

    gleasn50len

    glein90len

    glân

    CleanMaxlen

    glân

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Asesiad ansawdd data o sampl RNA

    Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.

    Enw ffeil

    Clientid

    Readol

    Basenum

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanqScore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    C12

    Ffigur 1. Darllenwch ddosbarthiad hyd

    A3

    Ffigur 2. Dosbarthiad sgôr ansawdd data glân

    A4

    Ffigur 3. Dosbarthiad Sgôr Hyd ac Ansawdd Data Glân

    A5

    Cael Dyfyniad

    Ysgrifennwch eich neges yma a'i hanfon atom

    Anfonwch eich neges atom: