Dilyniant mRNA ewcaryotig-Illumina
Manteision
ØProfiadol iawn: Mae dros 200,000 o samplau wedi'u prosesu yn BMK sy'n cwmpasu mathau amrywiol o samplau, gan gynnwys meithriniad celloedd, meinwe, hylif y corff, ac ati, a chaewyd dros 7,000 o brosiectau mRNA-Seq sy'n cwmpasu amrywiol feysydd ymchwil.
ØSystem rheoli ansawdd llym: Mae pwyntiau rheoli ansawdd craidd trwy bob cam gan gynnwys paratoi sampl, paratoi llyfrgell, dilyniannu a biowybodeg yn cael eu monitro'n agos er mwyn sicrhau canlyniadau o ansawdd uchel.
ØCronfeydd data lluosog ar gael ar gyfer anodi swyddogaeth ac astudiaethau cyfoethogi i gyflawni nodau ymchwil amrywiol.
ØGwasanaethau ôl-werthu: Gwasanaethau ôl-werthu sy'n ddilys am 3 mis ar ôl cwblhau'r prosiect, gan gynnwys dilyniant prosiectau, datrys problemau, Holi ac Ateb canlyniadau, ac ati.
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Strategaeth ddilyniannu | Argymhellir data | Rheoli Ansawdd |
| Poly A cyfoethogi | Illumina PE150 | 6 Gb | C30≥85% |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Purdeb | Uniondeb | Swm |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Dangosir halogiad protein neu DNA cyfyngedig neu ddim o gwbl ar y gel. | Ar gyfer planhigion: RIN≥6.5; Ar gyfer anifeiliaid: RIN≥7; 28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim | Conc.≥30 ng/μl;Cyfrol ≥ 10 μl;Cyfanswm ≥ 1.5 μg |
Meinwe: Pwysau (sych):≥1 g
* Ar gyfer meinwe llai na 5 mg, rydym yn argymell anfon sampl meinwe wedi'i rewi â fflach (mewn nitrogen hylifol).
Ataliad cell:Cyfrif celloedd = 3×106- 1×107
* Rydym yn argymell llongio lysate cell wedi'i rewi.Rhag ofn bod y gell honno'n cyfrif llai na 5 × 105, argymhellir fflach wedi'i rewi mewn nitrogen hylifol, sy'n well ar gyfer echdynnu micro.
Samplau gwaed:Cyfrol≥1 ml
Micro-organeb:Màs ≥ 1 g
Cyflwyno Sampl a Argymhellir
Cynhwysydd: tiwb centrifuge 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu enghreifftiol: Grŵp+ at ei gilydd ee A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Cludo:
- Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
- Tiwbiau RNAstable: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee RNAstable®) a'u cludo yn nhymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
Ewcaryotig llif gwaith dadansoddi dilyniannu mRNA
Biowybodeg
ØRheoli ansawdd data crai
ØAliniad genom cyfeirio
ØDadansoddiad strwythur trawsgrifiad
ØMeintioli mynegiant
ØDadansoddiad mynegiant gwahaniaethol
ØAnodi swyddogaeth a chyfoethogi
1.mRNA Cromlin dirlawnder Data
2.Dadansoddiad mynegiant gwahaniaethol - plot llosgfynydd
3.Anodiad KEGG ar DEGs
4.Dosbarthiad GO ar DEGs
