Genom ffwngaidd
Manteision Gwasanaeth
● Strategaethau dilyniannu lluosog ar gael ar gyfer gwahanol nodau ymchwil
● Profiadol iawn mewn cydosod genomau ffyngau gyda dros 10,000 o genom pene-cyflawn wedi'i ymgynnull.
● Tîm cymorth technegol ôl-werthu proffesiynol yn cyflawni anghenion ymchwil mwy penodol.
Manylebau Gwasanaeth
| Gwasanaeth | Strategaeth Dilyniannu | Ansawdd wedi'i warantu | Amcangyfrif o amser troi o gwmpas |
| Map cain ffwngaidd | Illumina 50X + Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 diwrnod gwaith |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Map pene-cyflawn ffwngaidd | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Cymhareb angori cromosom >90% | 45 diwrnod gwaith |
Dadansoddiadau biowybodeg
● Rheoli ansawdd data crai
● Cynulliad genom
● Dadansoddiad cydran genom
● Anodi ffwythiant genynnol
● Dadansoddiad genomig cymharol
Gofynion Sampl a Chyflenwi
Gofynion Sampl:
CanysEchdynion DNA:
| Math Sampl | Swm | Crynodiad | Purdeb |
| Echdynion DNA | ＞ 1.2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Ar gyfer samplau meinwe:
| Math o sampl | Triniaeth sampl a argymhellir | Sampl storio a chludo |
| Ffwng Ungellog | Arsylwi burum o dan ficrosgop a'u casglu yn eu cyfnod esbonyddol Trosglwyddwch y diwylliant (sy'n cynnwys tua 3-4.5e9 o gelloedd) i mewn i eppendorf 1.5 neu 2 ml.(Cadwch ar rew) Allgyrchwch y tiwb am 1 munud ar 14000 g i gasglu bacteria a chael gwared ar y supernatant yn ofalus Seliwch y tiwb a rhewi'r bacteria mewn nitrogen hylifol am o leiaf 1-3 h.Storiwch y tiwb mewn oergell -80 ℃. | Rhewi'r samplau mewn nitrogen hylifol am 3-4 awr a'u storio mewn nitrogen hylifol neu -80 gradd i archeb hirdymor.Mae angen cludo sampl gyda rhew sych. |
| Ffwng Macro | Argymhellir meinwe yn y cyfnod tyfu'n weithredol. Rinsiwch y meinwe â dŵr heb endotocsin, yna 70% ethonol. Arbedwch y sampl mewn cryo-diwbiau. |
Llif Gwaith Gwasanaeth
Cyflwyno sampl
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Diagram 1.Circos ar gydrannau genomig ffwngaidd
Dadansoddiad genomeg 2.Comparative: coeden Phylogenetic
