Dadansoddiad Cymdeithas Genom-gyfan
Llif gwaith
Manteision Gwasanaeth
●Arbenigedd helaeth a chofnodion cyhoeddiGyda phrofiad cronedig mewn Systemau Gwledig a Chyffredinol (GWAS), mae BMKGene wedi cwblhau cannoedd o brosiectau rhywogaethau mewn ymchwil i boblogaethau GWAS, wedi cynorthwyo ymchwilwyr i gyhoeddi mwy na 100 o erthyglau, ac mae'r ffactor effaith cronnus wedi cyrraedd 500.
● Dadansoddiad biowybodeg cynhwysfawr: mae'r llif gwaith yn cynnwys dadansoddiad cysylltiad nodwedd-SNP, gan gyflwyno set o enynnau ymgeisydd a'u hanodiad swyddogaethol cyfatebol.
●Tîm biowybodeg medrus iawn a chylch dadansoddi byrGyda phrofiad helaeth mewn dadansoddi genomig uwch, mae tîm BMKGene yn darparu dadansoddiadau cynhwysfawr gydag amser troi cyflym.
●Cymorth Ôl-Werthu:Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod yr amser hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
Manylebau a gofynion gwasanaeth
| Math o ddilyniannu | Graddfa boblogaeth a argymhellir | Strategaeth dilyniannu | Gofynion niwcleotid |
| Dilyniannu'r Genom Cyfan | 200 o samplau | 10x | Crynodiad: ≥ 1 ng/ µL Cyfanswm y swm ≥ 30ng Diraddio neu halogiad cyfyngedig neu ddim |
| Darn Mwyhadur Locws Penodol (SLAF) | Dyfnder tag: 10x Nifer y tagiau: < 400 Mb: Argymhellir WGS < 1Gb: 100K o dagiau 1Gb > 2Gb: 300K o dagiau Uchafswm o 500k o dagiau | Crynodiad ≥ 5 ng/µL Cyfanswm ≥ 80 ng Gel agarose: dim diraddio na halogiad neu ddiraddio cyfyngedig
|
Dewis Deunydd
Gwahanol amrywiaethau, isrywogaethau, tirrasau/banciau genynnau/teuluoedd cymysg/adnoddau gwyllt
Gwahanol amrywiaethau, isrywogaethau, tirrasau
Teulu hanner brodyr a chwiorydd/teulu brodyr a chwiorydd llawn/adnoddau gwyllt
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Dosbarthu sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:
- Dadansoddiad cysylltiad genom-gyfan: model LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Anodiad swyddogaethol genynnau ymgeisydd
Dadansoddiad cysylltiad nodwedd-SNP – plot Manhattan
Dadansoddiad cysylltiad nodwedd-SNP – plot QQ
Archwiliwch y datblygiadau a hwyluswyd gan wasanaethau de GWAS BMKGene trwy gasgliad wedi'i guradu o gyhoeddiadau:
Lv, L. et al. (2023) 'Mewnwelediad i sail enetig goddefgarwch amonia mewn cregyn bylchog Sinonovacula constricta trwy astudiaeth gysylltiad genom-gyfan',Dyframaethu, 569, t. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Mae dadansoddiadau aml-omig o 398 o dderbyniadau miled cynffonog yn datgelu rhanbarthau genomig sy'n gysylltiedig â dofi, nodweddion metabolyn, ac effeithiau gwrthlidiol',Planhigion Moleciwlaidd, 15(8), tt. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Mapio Cymdeithas Genom-Eang o Ffenoteipiau Hulless Barely mewn Amgylchedd Sychder',Ffiniau mewn Gwyddor Planhigion, 13, t. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Mae GmST1, sy'n amgodio sylffotransferas, yn rhoi ymwrthedd i straeniau firws mosaig ffa soia G2 a G3',Planhigion, Celloedd a'r Amgylchedd, 44(8), tt. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
