BMKCloud Mewngofnodi

Cynhyrchion

Dilyniannu Metatranscriptome

Gan ddefnyddio technoleg dilyniannu Illumina, mae gwasanaeth dilyniannu meta-drawsgriptome BMKGENE yn datgelu mynegiant genynnau deinamig amrywiaeth amrywiol o ficrobau, sy'n rhychwantu ewcaryotau i brocaryotau a firysau, o fewn amgylcheddau naturiol fel pridd, dŵr, môr, stôl, a'r perfedd. Mae ein gwasanaeth cynhwysfawr yn grymuso ymchwilwyr i ymchwilio i broffiliau mynegiant genynnau cyflawn cymunedau microbaidd cymhleth. Y tu hwnt i ddadansoddi tacsonomig, mae ein gwasanaeth dilyniannu metatranscriptome yn hwyluso archwilio i gyfoethogi swyddogaethol, gan daflu goleuni ar enynnau a fynegir yn wahaniaethol a'u rolau. Darganfyddwch gyfoeth o fewnwelediadau biolegol wrth i chi lywio tirweddau cymhleth mynegiant genynnau, amrywiaeth tacsonomig, a dynameg swyddogaethol o fewn y cilfachau amgylcheddol amrywiol hyn.

Cysylltwch â Ni

Manylion Gwasanaeth

Biowybodeg

Canlyniadau Demo

Cyhoeddiadau dan sylw

Nodweddion Gwasanaeth

● disbyddiad rRNA ac yna paratoi llyfrgell mRNA cyfeiriadol.

● Dilyniannu ar Illumina NovaSeq.

Manteision Gwasanaeth

●Astudiwch y Newidiadau mewn Cymunedau Microbaidd Cymhleth:Mae hyn yn digwydd ar y lefel drawsgrifiadol ac yn archwilio genynnau newydd posibl.

●Egluro Rhyngweithiadau Cymunedol Microbaidd gyda'r Gwesteiwr neu'r Amgylchedd.

●Dadansoddiad Biowybodeg Cynhwysfawr: Mae hwn yn rhoi cipolwg ar gyfansoddiadau tacsonomig a swyddogaethol cymunedol, yn ogystal â dadansoddiad mynegiant genynnau gwahaniaethol.

●Anodiad Genynnol helaeth:Defnyddio cronfeydd data ffwythiannau genynnau cyfoes ar gyfer gwybodaeth mynegiant genynnau llawn gwybodaeth o gymunedau microbaidd.

●Cefnogaeth Ôl-werthu:Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.

Manylebau Gwasanaeth

Llwyfan dilyniannu	Strategaeth Dilyniant	Argymhellir data	Rheoli Ansawdd Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	C30≥85%

Gofynion Sampl

Crynodiad (ng/µL)	Cyfanswm (µg)	Cyfrol (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Llif Gwaith Gwasanaeth

Cyflwyno sampl

Adeiladu llyfrgell

Dilyniannu

Dadansoddi data

Gwasanaethau ôl-werthu

Pâr o: De novo Cynulliad Genom Ffwngaidd

Nesaf: Dilyniannu RNA procaryotig

Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:

● Dilyniannu Rheoli Ansawdd Data

● Cynulliad trawsgrifiadau

● Anodi Tacsonomaidd a Digonedd

● Anodi Swyddogaethol a Digonedd

● Meintioli Mynegiant a Dadansoddi Gwahaniaethol

Dosbarthiad tacsonomaidd pob sampl:

Dadansoddiad amrywiaeth beta: UPGMA

Anodi swyddogaethol – digonedd GO

Digonedd tacsonomeg gwahaniaethol – LEFSE

Archwiliwch y datblygiadau a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu meta trawsgrifio BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.

Lu, Z. et al. (2023) 'Goddefiad asid i facteria o'r radd flaenaf sy'n defnyddio lactad Mae Bacteroidales yn cyfrannu at atal asidosis rwminaidd mewn geifr sydd wedi addasu i ddiet â chrynodiadau uchel',Maeth Anifeiliaid, 14, tt 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Cân, Z. et al. (2017) 'Datod microbiota swyddogaethol craidd mewn eplesu cyflwr solet traddodiadol trwy ampliconau trwybwn uchel a dilyniannu metatranscriptomeg',Ffiniau mewn Microbioleg, 8(GORFFENNAF). doi: 10.3389/FMIB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Mycofeirysau Newydd a Ddarganfyddwyd o Arolwg Metatranscriptomeg o'r Ffwng Alternaria Phytopathogenig',Firysau, 14(11), t. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Mae dadansoddiad metatranscriptome cyfochrog yn datgelu diraddio metabolion eilaidd planhigion gan chwilod a'u symbiontau perfedd',Moleciwlaidd Ecoleg, 31(15), tt. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.