Mewngofnodi BMKCloud

Cynhyrchion

Dilyniannu Metatranscriptome

Gan fanteisio ar dechnoleg dilyniannu Illumina, mae gwasanaeth dilyniannu metatranscriptome BMKGENE yn datgelu mynegiant genynnau deinamig amrywiaeth eang o ficrobau, gan ymestyn o ewcaryotau i brocaryotau a firysau, o fewn amgylcheddau naturiol fel pridd, dŵr, môr, carthion, a'r coluddyn. Mae ein gwasanaeth cynhwysfawr yn grymuso ymchwilwyr i ymchwilio i broffiliau mynegiant genynnau cyflawn cymunedau microbaidd cymhleth. Y tu hwnt i ddadansoddiad tacsonomig, mae ein gwasanaeth dilyniannu metatranscriptome yn hwyluso archwiliad i gyfoethogi swyddogaethol, gan daflu goleuni ar enynnau a fynegir yn wahanol a'u rolau. Datgelwch gyfoeth o fewnwelediadau biolegol wrth i chi lywio tirweddau cymhleth mynegiant genynnau, amrywiaeth tacsonomig, a dynameg swyddogaethol o fewn y cilfachau amgylcheddol amrywiol hyn.

Cysylltwch â Ni

Manylion y Gwasanaeth

Biowybodeg

Canlyniadau Demo

Cyhoeddiadau dan sylw

Nodweddion y Gwasanaeth

● disbyddu rRNA ac yna paratoi llyfrgell mRNA cyfeiriadol.

● Dilyniannu ar Illumina NovaSeq.

Manteision Gwasanaeth

●Astudiwch y Newidiadau mewn Cymunedau Microbaidd Cymhleth:Mae hyn yn digwydd ar y lefel drawsgrifio ac yn archwilio genynnau newydd posibl.

●Esbonio Rhyngweithiadau Cymuned Microbaidd â'r Gwesteiwr neu'r Amgylchedd.

●Dadansoddiad Biowybodeg CynhwysfawrMae hyn yn rhoi cipolwg ar gyfansoddiadau tacsonomig a swyddogaethol cymunedau, yn ogystal â dadansoddiad mynegiant genynnau gwahaniaethol.

●Anodiad Genynnau Helaeth:Defnyddio cronfeydd data swyddogaeth genynnau cyfoes ar gyfer gwybodaeth addysgiadol am fynegiant genynnau cymunedau microbaidd.

●Cymorth Ôl-Werthu:Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod yr amser hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.

Manylebau Gwasanaeth

Platfform dilyniannu	Strategaeth Dilyniannu	Data a argymhellir	Rheoli Ansawdd Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Gofynion Sampl

Crynodiad (ng/µL)	Cyfanswm (µg)	Cyfaint (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Llif Gwaith Gwasanaeth

Dosbarthu sampl

Adeiladu llyfrgell

Dilyniannu

Dadansoddi data

Gwasanaethau ôl-werthu

Blaenorol: De novo Cynulliad Genom Ffwngaidd

Nesaf: Dilyniannu RNA Procariotig

Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:

● Rheoli Ansawdd Data Dilyniannu

● Cynulliad Trawsgrifiadau

● Anodiad Tacsonomig a Digonedd

● Anodiad Swyddogaethol a Digonedd

● Mesur Mynegiant a Dadansoddiad Gwahaniaethol

Dosbarthiad tacsonomig pob sampl:

Dadansoddiad amrywiaeth beta: UPGMA

Anodiad swyddogaethol – digonedd GO

Digonedd tacsonomeg gwahaniaethol – LEFSE

Archwiliwch y datblygiadau a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu meta-dranscriptomics BMKGene trwy gasgliad wedi'i guradu o gyhoeddiadau.

Lu, Z. et al. (2023) 'Mae goddefgarwch asid bacteria o'r urdd Bacteroidales sy'n defnyddio lactad yn cyfrannu at atal asidosis rwmen mewn geifr sydd wedi addasu i ddeiet crynodedig uchel',Maeth Anifeiliaid, 14, tt 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. et al. (2017) 'Datod microbiota swyddogaethol craidd mewn eplesu cyflwr solid traddodiadol trwy ampliconau trwybwn uchel a dilyniannu metadrasgrifiomeg',Ffiniau mewn Microbioleg, 8(GORFF). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/LLAWN.

Wang, W. et al. (2022) 'Mycofeirysau Newydd a Ddarganfuwyd o Arolwg Metatranscriptomeg o'r Ffwng Alternaria Ffytopathogenig',Firysau, 14(11), t. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Mae dadansoddiad metatranscriptome cyfochrog yn datgelu diraddio metabolion eilaidd planhigion gan chwilod a'u symbiontiaid perfedd',Moleciwlaidd Ecoleg, 31(15), tt. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.