-
Dilyniannu RNA cnewyllyn sengl
Mae'r cynnydd mewn cipio cell sengl a thechneg adeiladu llyfrgell unigol ynghyd â dilyniannu trwybwn uchel yn caniatáu astudiaethau mynegiant genynnau fesul cell.Mae'n galluogi dadansoddiad system dyfnach a chyflawn ar boblogaethau celloedd cymhleth, lle mae'n osgoi cuddio eu heterogenedd i raddau helaeth trwy gymryd cyfartaledd yr holl gelloedd.
Fodd bynnag, nid yw rhai celloedd yn addas i'w gwneud yn grogiant un-gell, felly mae angen dulliau paratoi sampl eraill - echdynnu cnewyllyn o feinweoedd, hynny yw, mae cnewyllyn yn cael ei dynnu'n uniongyrchol o feinweoedd neu gell a'i baratoi yn ataliad un cnewyllyn ar gyfer un-cnewyllyn. dilyniannu celloedd.
Mae BMK yn darparu gwasanaeth dilyniannu RNA un gell Genomeg ChromiumTM yn seiliedig ar un gell.Mae'r gwasanaeth hwn wedi'i ddefnyddio'n helaeth mewn astudiaethau ar astudiaethau sy'n gysylltiedig â chlefydau, megis gwahaniaethu celloedd imiwnedd, heterogenedd tiwmor, datblygu meinwe, ac ati.
Sglodyn trawsgrifio gofodol: 10 × Genomeg
Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq
-
Dilyniannu Genom Cyfan Planhigion/Anifeiliaid
Mae ail-ddilyniant genom cyfan, a elwir hefyd yn WGS, yn galluogi datgelu treigladau cyffredin a phrin ar y genom cyfan gan gynnwys Amryffurfedd Niwcleotid Sengl (SNP), Dileu Mewnosodiad (InDel), Amrywiad Strwythur (SV), ac Amrywiad Rhif Copi (CNV). ).Mae SVs yn cyfrif am gyfran fwy o'r sylfaen amrywiad nag SNPs ac yn cael mwy o effaith ar y genom, sy'n cael effaith sylweddol ar organebau byw.Mae dilyniannu darllen hir yn caniatáu ar gyfer adnabod darnau mawr ac amrywiadau cymhleth yn fwy manwl gywir oherwydd bod darlleniadau hir yn ei gwneud hi'n llawer haws croesi cromosomaidd dros ranbarthau cymhleth fel ailddarllediadau tandem, rhanbarthau cyfoethog GC / AT, a rhanbarthau gor-newidiol.
Llwyfan: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Trawsgrifiad Gofodol BMKMANU S1000
Mae trawsgrifomeg ofodol ar flaen y gad o ran arloesi gwyddonol, gan rymuso ymchwilwyr i ymchwilio i batrymau mynegiant genynnau cymhleth o fewn meinweoedd wrth gadw eu cyd-destun gofodol.Ynghanol llwyfannau amrywiol, mae BMKGene wedi datblygu'r BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, gan frolio adatrysiad gwello 5µM, yn cyrraedd yr amrediad isgellog, ac yn galluogigosodiadau cydraniad aml-lefel.Mae'r sglodyn S1000, sy'n cynnwys tua 2 filiwn o smotiau, yn defnyddio microffynnonau wedi'u haenu â gleiniau wedi'u llwytho â stilwyr dal cod bar gofodol.Mae llyfrgell cDNA, wedi'i chyfoethogi â chodau bar gofodol, yn cael ei pharatoi o'r sglodyn S1000 a'i dilyniannu wedyn ar lwyfan Illumina NovaSeq.Mae'r cyfuniad o samplau â chod bar gofodol ac UMI yn sicrhau cywirdeb a phenodoldeb y data a gynhyrchir.Mae priodoledd unigryw sglodyn BMKManu S1000 yn gorwedd yn ei amlochredd, gan gynnig gosodiadau datrysiad aml-lefel y gellir eu tiwnio'n fân i wahanol feinweoedd a lefelau manylder.Mae'r hyblygrwydd hwn yn gosod y sglodyn fel dewis rhagorol ar gyfer astudiaethau trawsgrifomeg ofodol amrywiol, gan sicrhau clystyru gofodol manwl gywir heb fawr o sŵn.
Gan ddefnyddio sglodyn BMKManu S1000 a thechnolegau trawsgrifio gofodol eraill, gall ymchwilwyr gael gwell dealltwriaeth o drefniadaeth ofodol celloedd a'r rhyngweithiadau moleciwlaidd cymhleth sy'n digwydd o fewn meinweoedd, gan ddarparu mewnwelediadau amhrisiadwy i'r mecanweithiau sy'n sail i brosesau biolegol mewn ystod eang o feysydd, gan gynnwys oncoleg, niwrowyddoniaeth, bioleg ddatblygiadol, imiwnoleg ac astudiaethau botanegol.
Llwyfan: sglodion BMKManu S1000 a Illumina NovaSeq
-
Trawsgrifiad Gofodol Visium Genomeg 10x
Mae transcriptomeg ofodol yn dechnoleg flaengar sy'n caniatáu i ymchwilwyr ymchwilio i batrymau mynegiant genynnau o fewn meinweoedd wrth gadw eu cyd-destun gofodol.Un platfform pwerus yn y parth hwn yw Genomeg Visium 10x ynghyd â dilyniannu Illumina.Mae egwyddor 10X Visium yn gorwedd ar sglodyn arbenigol gydag ardal ddal ddynodedig lle gosodir adrannau meinwe.Mae'r ardal ddal hon yn cynnwys smotiau cod bar, pob un yn cyfateb i leoliad gofodol unigryw o fewn y meinwe.Yna caiff y moleciwlau RNA a ddaliwyd o'r meinwe eu labelu â dynodwyr moleciwlaidd unigryw (UMIs) yn ystod y broses drawsgrifio o'r chwith.Mae'r smotiau cod bar hyn a'r UMIs yn galluogi mapio gofodol manwl gywir a meintioli mynegiant genynnau ar gydraniad un gell.Mae'r cyfuniad o samplau â chod bar gofodol ac UMI yn sicrhau cywirdeb a phenodoldeb y data a gynhyrchir.Trwy ddefnyddio'r dechnoleg Trawsgrifiad Gofodol hon, gall ymchwilwyr gael dealltwriaeth ddyfnach o drefniadaeth ofodol celloedd a'r rhyngweithiadau moleciwlaidd cymhleth sy'n digwydd o fewn meinweoedd, gan gynnig mewnwelediad amhrisiadwy i'r mecanweithiau sy'n sail i brosesau biolegol mewn meysydd lluosog, gan gynnwys oncoleg, niwrowyddoniaeth, bioleg ddatblygiadol, imiwnoleg. , ac astudiaethau botanegol.
Llwyfan: 10X Genomeg Visium ac Illumina NovaSeq
-
Dilyniannu mRNA Hyd Llawn-Nanopor
Er bod dilyniannu mRNA yn seiliedig ar NGS yn arf amlbwrpas ar gyfer meintioli mynegiant genynnau, mae ei ddibyniaeth ar ddarlleniadau byr yn cyfyngu ar ei effeithiolrwydd mewn dadansoddiadau trawsgrifomig cymhleth.Mae dilyniannu Nanopore, ar y llaw arall, yn defnyddio technoleg darllen hir, gan alluogi dilyniannu trawsgrifiadau mRNA hyd llawn.Mae'r dull hwn yn hwyluso archwiliad cynhwysfawr o splicing amgen, ymasiadau genynnau, poly-adenylation, a meintioli isoformau mRNA.
Mae dilyniannu nanopor yn dibynnu ar signalau trydanol amser real un-moleciwl nanopor.Wedi'i arwain gan broteinau modur, mae DNA llinyn dwbl yn rhwymo i broteinau nanopor sydd wedi'u hymgorffori mewn bioffilm, gan ddad-ddirwyn wrth iddo fynd trwy'r sianel nanopore o dan wahaniaeth foltedd.Mae'r signalau trydanol nodedig a gynhyrchir gan wahanol seiliau ar y llinyn DNA yn cael eu canfod a'u dosbarthu mewn amser real, gan hwyluso dilyniannu niwcleotid cywir a pharhaus.Mae'r dull arloesol hwn yn goresgyn cyfyngiadau darllen byr ac yn darparu llwyfan deinamig ar gyfer dadansoddi genomig cymhleth, gan gynnwys astudiaethau trawsgrifomig cymhleth.
Llwyfan: Nanopore Promethion P48
-
Dilyniant mRNA hyd llawn -PacBio
Er bod dilyniannu mRNA yn seiliedig ar NGS yn arf amlbwrpas ar gyfer mesur mynegiant genynnau, mae ei ddibyniaeth ar ddarlleniadau byr yn cyfyngu ar ei ddefnydd mewn dadansoddiadau trawsgrifio cymhleth.Ar y llaw arall, mae dilyniannu PacBio (Iso-Seq), yn defnyddio technoleg darllen hir, gan alluogi dilyniannu trawsgrifiadau mRNA hyd llawn.Mae'r dull hwn yn hwyluso archwiliad cynhwysfawr o splicing amgen, ymasiadau genynnau ac aml-adynyliad er nad dyma'r prif ddewis ar gyfer meintioli mynegiant genynnau, oherwydd y swm uchel o ddata sydd ei angen.
Mae technoleg dilyniannu PacBio yn dibynnu ar ddilyniant moleciwlaidd sengl, amser real (SMRT), gan ddarparu mantais amlwg wrth ddal trawsgrifiadau mRNA hyd llawn.Mae'r dull arloesol hwn yn cynnwys defnyddio canllawiau tonnau dim modd (ZMWs), ffynhonnau micro-ffurf sy'n galluogi arsylwi amser real ar weithgaredd DNA polymeras yn ystod dilyniannu.O fewn y ZMWs hyn, mae polymeras DNA PacBio yn syntheseiddio llinyn cyflenwol o DNA, gan gynhyrchu darlleniadau hir sy'n rhychwantu trawsgrifiadau mRNA yn eu cyfanrwydd.Mae gweithrediad PacBio yn y modd dilyniannu Consensws Cylchlythyr (CCS) yn gwella cywirdeb trwy ddilyniannu'r un moleciwl dro ar ôl tro.Mae cywirdeb y darlleniadau HiFi a gynhyrchir yn debyg i NGS, gan gyfrannu ymhellach at ddadansoddiad cynhwysfawr a dibynadwy o nodweddion trawsgrifio cymhleth.Llwyfan: PacBio Sequel II
-
mRNA ewcaryotig Dilyniannu-Illumina
Mae dilyniannu mRNA yn grymuso proffilio cynhwysfawr yr holl drawsgrifiadau mRNA o fewn celloedd o dan amodau penodol.Mae'r dechnoleg flaengar hon yn arf pwerus, gan ddadorchuddio proffiliau mynegiant genynnau cymhleth, strwythurau genynnau, a mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â phrosesau biolegol amrywiol.Wedi'i fabwysiadu'n eang mewn ymchwil sylfaenol, diagnosteg glinigol, a datblygu cyffuriau, mae dilyniannu mRNA yn cynnig mewnwelediad i gymhlethdodau dynameg cellog a rheoleiddio genetig.
Llwyfan: Illumina NovaSeq X
-
Dilyniannu-Illumina mRNA nad yw'n seiliedig ar gyfeiriadau
Mae dilyniannu mRNA yn grymuso proffilio cynhwysfawr yr holl drawsgrifiadau mRNA o fewn celloedd o dan amodau penodol.Mae'r dechnoleg flaengar hon yn arf pwerus, gan ddadorchuddio proffiliau mynegiant genynnau cymhleth, strwythurau genynnau, a mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â phrosesau biolegol amrywiol.Wedi'i fabwysiadu'n eang mewn ymchwil sylfaenol, diagnosteg glinigol, a datblygu cyffuriau, mae dilyniannu mRNA yn cynnig mewnwelediad i gymhlethdodau dynameg cellog a rheoleiddio genetig.
Llwyfan: Illumina NovaSeq X
-
Dilyniant hir di-godio-Illumina
Mae RNAs di-godio hir (lncRNAs) yn RNAs sy'n hwy na 200 niwcleotidau sydd â photensial codio lleiaf posibl ac sy'n elfennau canolog o fewn RNA nad yw'n godio.Wedi'i ganfod yn y cnewyllyn a'r cytoplasm, mae'r RNAs hyn yn chwarae rhan hanfodol mewn rheoleiddio epigenetig, trawsgrifiadol ac ôl-drawsysgrifol, gan danlinellu eu harwyddocâd wrth lunio prosesau cellog a moleciwlaidd.Mae dilyniannu LncRNA yn arf pwerus mewn Gwahaniaethu Celloedd, Ontogenesis, a Chlefydau Dynol.
Llwyfan: Illumina NovaSeq
-
Dilyniant RNA bach-Illumina
Mae moleciwlau RNA bach (sRNA), sydd fel arfer yn llai na 200 o niwcleotidau o hyd, yn cynnwys microRNAs (miRNAs), RNAs ymyrrol bach (siRNAs), a RNAs rhyngweithiol piwi (piRNAs).Ymhlith y rhain, mae miRNAs, tua 20-24 niwcleotidau o hyd, yn arbennig o nodedig am eu rolau rheoleiddio canolog mewn amrywiol brosesau cellog.Gyda phatrymau mynegiant meinwe-benodol a chyfnod-benodol, mae miRNAs yn arddangos cadwraeth uchel ar draws gwahanol rywogaethau.
Llwyfan: Illumina NovaSeq
-
dilyniannu circRNA-Illumina
Dilyniant RNA cylchol (circRNA-seq) yw proffilio a dadansoddi RNAs cylchol, dosbarth o foleciwlau RNA sy'n ffurfio dolennau caeedig oherwydd digwyddiadau splicing anganonaidd, gan roi mwy o sefydlogrwydd i'r RNA hyn.Er y dangoswyd bod rhai circRNAs yn gweithredu fel sbyngau microRNA, gan atafaelu microRNAs a'u hatal rhag rheoleiddio eu mRNAs targed, gall circRNAs eraill ryngweithio â phroteinau, modiwleiddio mynegiant genynnau, neu fod â rolau mewn prosesau cellog.Mae dadansoddiad mynegiant circRNA yn rhoi mewnwelediad i rolau rheoleiddiol y moleciwlau hyn a'u harwyddocâd mewn amrywiol brosesau cellog, cyfnodau datblygiadol, a chyflyrau afiechyd, gan gyfrannu at ddealltwriaeth ddyfnach o gymhlethdod rheoleiddio RNA yng nghyd-destun mynegiant genynnau.
-
Dilyniant trawsgrifio cyfan – Illumina
Mae dilyniannu trawsgrifiad cyfan yn cynnig dull cynhwysfawr o broffilio moleciwlau RNA amrywiol, gan gwmpasu RNAs codio (mRNA) a RNA di-godio (lncRNA, circRNA, a miRNA).Mae'r dechneg hon yn dal y trawsgrifiad llawn o gelloedd penodol ar adeg benodol, gan ganiatáu ar gyfer dealltwriaeth gyfannol o brosesau cellog.Fe'i gelwir hefyd yn “dilyniant RNA cyflawn,” ei nod yw dadorchuddio rhwydweithiau rheoleiddio cymhleth ar y lefel trawsgrifio, gan alluogi dadansoddiad manwl fel RNA mewndarddol cystadleuol (ceRNA) a dadansoddiad RNA ar y cyd.Mae hyn yn nodi'r cam cychwynnol tuag at nodweddu swyddogaethol, yn enwedig wrth ddatrys y rhwydweithiau rheoleiddio sy'n cynnwys rhyngweithiadau ceRNA sy'n seiliedig ar circRNA-miRNA-mRNA.
