● Mae angen genom cyfeirio.
● Defnyddir DNA Lambda i fonitro effeithlonrwydd trosi bisulfite.
● Mae effeithlonrwydd treuliad MspI hefyd yn cael ei fonitro.
● Treulio ensym dwbl ar gyfer samplau planhigion.
● Dilyniannu ar Illumina NovaSeq.
●Dewis Amgen Cost-effeithiol ac Effeithlon i WGBS: galluogi'r dadansoddiad i gael ei wneud am gost is a chyda gofynion sampl is.
●Llwyfan Cyflawn:darparu gwasanaeth rhagorol un-stop o brosesu samplau, adeiladu llyfrgelloedd, a dilyniannu i ddadansoddi biowybodeg.
●Arbenigedd helaeth: gyda phrosiectau dilyniannu RRBS wedi'u cwblhau'n llwyddiannus ar draws ystod amrywiol o rywogaethau, mae BMKGENE yn dod â dros ddegawd o brofiad, tîm dadansoddi medrus iawn, cynnwys cynhwysfawr, a chymorth ôl-werthu rhagorol.
Llyfrgell | Strategaeth Dilyniant | Allbwn data a argymhellir | Rheoli ansawdd |
MspI wedi'i dreulio a llyfrgell wedi'i thrin â Bisulfite | Illumina PE150 | 8 Gb | C30 ≥ 85% Trosi bisulfite > 99% Effeithlonrwydd torri MspI > 95% |
Crynodiad (ng/µL) | Cyfanswm (µg) |
| |
DNA genomig | ≥ 30 | ≥ 1 | Diraddio neu halogi cyfyngedig |
Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:
● Rheoli ansawdd dilyniannu amrwd;
● Mapio i gyfeirio at genom;
● Canfod gwaelodion methylated 5mC ac adnabod motiffau;
● Dadansoddiad o ddosbarthiad methylation a chymharu sampl;
● Dadansoddiad o Ranbarthau Methyledig Gwahaniaethol (DMRs);
● Anodi gweithredol genynnau sy'n gysylltiedig â DMRs.
Rheoli ansawdd: effeithlonrwydd treuliad (mewn mapio genom)
Rheoli ansawdd: trosi bisulfite (mewn echdynnu gwybodaeth methylation)
Map methylation: dosbarthiad genom-eang methylation 5mC
Cymhariaeth sampl: Dadansoddiad o'r Prif Gydran
Dadansoddiad Rhanbarthau Methylaidd Gwahaniaethol (DMRs): map gwres
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu genom bisulfite cyfan BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.
Li, Z. et al. (2022) 'Ailraglennu ffyddlondeb uchel i gelloedd tebyg i Leydig trwy actifadu CRISPR a ffactorau paracrine',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Dadansoddiad methylation DNA genom-eang o gyfansoddiad y corff mewn efeilliaid monosygotig Tsieineaidd',European Journal of Clinical Investigation, 53(11), t. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'methylation DNA a chymhareb gwasg-i-glun: astudiaeth cysylltiad epigenom-eang mewn efeilliaid monosygotig Tsieineaidd',Journal of Endocrinological Investigation, 45(12), tt. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.