Dilyniannu Trawsgrifiad Cyfan – Illumina
Nodweddion
● Cynhyrchu llyfrgell ddeuol i ddilyniannu'r trawsgriftom cyflawn: llyfrgell disbyddu rRNA a pharatoi llyfrgell RNA fach.
● Dadansoddiad biowybodeg cyflawn o mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA mewn adroddiadau biowybodeg ar wahân, ynghyd â dadansoddiad ar y cyd gyda'r holl fynegiant RNA wedi'i gyfuno, gan gynnwys dadansoddiad rhwydweithiau ceRNA.
Manteision Gwasanaeth
●Arbenigedd helaethRydym wedi prosesu dros 2100 o brosiectau trawsgriftom cyfan, yn cwmpasu gwahanol fathau o samplau. Rydym yn dod â'r cyfoeth o arbenigedd i bob prosiect.
●Rheoli Ansawdd TrylwyrRydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi samplau i baratoi llyfrgell, dilyniannu a biowybodeg. Mae ein monitro manwl yn sicrhau bod canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson yn cael eu darparu.
●Anodiad CynhwysfawrRydym yn defnyddio cronfeydd data lluosog i anodi'r Genynnau a Fynegir yn Wahaniaethol (DEGs) yn swyddogaethol a chynnal dadansoddiadau cyfoethogi cyfatebol. Mae'r dull cynhwysfawr hwn yn rhoi cipolwg ar y prosesau cellog a moleciwlaidd sy'n sail i'r ymateb trawsgriftom, gan sicrhau eich bod yn cael yr holl wybodaeth bosibl am ddata eich arbrawf.
●Dadansoddiad Manwl o Rwydweithiau RheoleiddioMae dadansoddiad rhwydwaith ceRNA yn cael ei alluogi gan ddilyniannu mRNA, lncRNA, circRNA, a miRNA ar y cyd a chan lif gwaith biowybodeg cynhwysfawr.
●Cymorth Ôl-WerthuRydym yn deall pa mor bwysig yw bod yn bresennol, dyna pam mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod yr amser hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Strategaeth dilyniannu | Data a argymhellir | Rheoli Ansawdd |
| rRNA wedi'i ddihysbyddu | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Maint wedi'i ddewis | Illumina SE50 | 10-20M o ddarlleniadau |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Crynodiad (ng/μl) | Swm (μg) | Purdeb | Uniondeb |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Halogiad protein na DNA cyfyngedig neu ddim halogiad o gwbl i'w weld ar y gel. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; uchder gwaelodlin cyfyngedig neu ddim uchder gwaelodlin |
Dosbarthu Sampl Argymhellir
Cynhwysydd: tiwb allgyrchu 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu sampl: Grŵp+atgynhyrchu e.e. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Cludo:
1. Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn iâ sych.
2. Tiwbiau RNAstable: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (e.e. RNAstable®) a'u cludo ar dymheredd ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Dosbarthu sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
Ar ben yr holl ddadansoddiad ar bob un gwahanol, mae'r 4 math o RNA wedi'u cyfuno yn ein dadansoddiad ar y cyd:
- Dadansoddiad cyd-fynegiant rhwng yr holl wahanol fathau o ddata RNA
- Trosolwg o fynegiant RNA
- Trosolwg o fynegiant gwahaniaethol
- Rhwydwaith CeRNA
- Genynnau allweddol wedi'u hintegreiddio yn y llwybr
- Dadansoddiad cadwraeth
- Targedu cysylltiadau
Trosolwg o fynegiant RNA
Genynnau a Fynegir yn Wahaniaethol
dadansoddiad ceRNA
miRNAs wedi'u mynegi'n wahanol ac RNAs cysylltiedig
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwylusir gan wasanaethau dilyniannu trawsgriftom cyfan BMKGene trwy gasgliad wedi'i guradu o gyhoeddiadau.
Dai, Y. et al. (2022) 'Proffiliau mynegiant cynhwysfawr mRNAs, lncRNAs a miRNAs mewn clefyd Kashin-Beck a nodwyd trwy ddilyniannu RNA',Omeg Moleciwlaidd, 18(2), tt. 154–166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'Dadansoddiad trawsgrifiadau llawn o wrthwynebiad oerfel Apis cerana ym Mynydd Changbai yn ystod y cyfnod gaeafu.'Genyn, 830, tt. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Blaenoriaethu Rhwydweithiau Rheoleiddio RNA Endogenaidd Cystadleuol mewn Canser yr Ysgyfaint Celloedd Bach yn Seiliedig ar Integreiddio Aml-Omigau: Nodweddion Moleciwlaidd ac Ymgeiswyr Cyffuriau',Ffiniau mewn Oncoleg, 12, t. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'Mae dadansoddiad integredig o broffiliau mynegiant lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA yn datgelu mewnwelediadau newydd i fecanweithiau posibl mewn ymateb i nematodau cwlwm gwreiddiau mewn cnau daear',Genomeg BMC, 23(1), tt. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FFIGUREAU/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Mae dilyniannu RNA trawsgrifiad cyfan yn tynnu sylw at y mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â chynnal ansawdd ôl-gynaeafu mewn brocoli trwy arbelydru LED coch',Bioleg a Thechnoleg Ôl-Gynhaeaf, 188, t. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
