Dilyniant trawsgrifio cyfan – Illumina
Nodweddion
● Llyfrgell ddeuol i ddilyniannu'r trawsgrifiad cyflawn: disbyddiad rRNA wedi'i ddilyn gan baratoi llyfrgell PE150 a dewis maint ac yna paratoi llyfrgell SE50
● Cwblhau dadansoddiad biowybodeg o mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA mewn adroddiadau biowybodeg ar wahân
● Dadansoddiad ar y cyd o'r holl fynegiant RNA mewn adroddiad cyfun, gan gynnwys dadansoddiad rhwydweithiau ceRNA.
Manteision Gwasanaeth
●Dadansoddiad manwl o rwydweithiau rheoleiddio: mae dadansoddiad rhwydwaith ceRNA yn cael ei alluogi gan ddilyniannu mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA ar y cyd a thrwy lif gwaith biowybodus cynhwysfawr.
●Anodiad Cynhwysfawr: rydym yn defnyddio cronfeydd data lluosog i anodi'r Genynnau a Fynegwyd yn Wahanol (DEGs) yn swyddogaethol a pherfformio'r dadansoddiad cyfoethogi cyfatebol, gan ddarparu mewnwelediad ar y prosesau cellog a moleciwlaidd sy'n sail i'r ymateb trawsgrifiad.
●Arbenigedd helaeth: gyda hanes o lwyddo i gau dros 2000 o brosiectau trawsgrifio cyfan mewn meysydd ymchwil amrywiol, mae ein tîm yn dod â chyfoeth o brofiad i bob prosiect.
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: rydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi sampl a llyfrgell i ddilyniannu a biowybodeg.Mae'r monitro manwl hwn yn sicrhau y cyflwynir canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.
● Anodi Cynhwysfawr: rydym yn defnyddio cronfeydd data lluosog i anodi'r Genynnau a Fynegwyd yn Wahanol (DEGs) yn swyddogaethol a pherfformio'r dadansoddiad cyfoethogi cyfatebol, gan ddarparu mewnwelediad ar y prosesau cellog a moleciwlaidd sy'n sail i'r ymateb trawsgrifiad.
●Cefnogaeth Ôl-werthu: Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis.Yn ystod yr amser hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Strategaeth ddilyniannu | Argymhellir data | Rheoli Ansawdd |
| rRNA wedi disbyddu | Illumina PE150 | 16 Gb | C30≥85% |
| Maint wedi'i ddewis | Illumina SE50 | 10-20M yn darllen |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Conc.(ng/μl) | Swm (μg) | Purdeb | Uniondeb |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Dangosir halogiad protein neu DNA cyfyngedig neu ddim o gwbl ar y gel. | Planhigion: RIN≥6.5 Anifeiliaid: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim drychiad gwaelodlin |
Cyflwyno Sampl a Argymhellir
Cynhwysydd:
Tiwb centrifuge 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu enghreifftiol: Grŵp+ at ei gilydd ee A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Cludo:
1.Dry-iâ: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
Tiwbiau 2.RNAstable: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee RNAstable®) a'u cludo yn nhymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
Trosolwg mynegiant RNA
Genynnau a fynegwyd yn wahaniaethol
dadansoddiad ceRNA
miRNAs a fynegwyd yn wahaniaethol a RNAS cysylltiedig
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu trawsgrifiad cyfan BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.
Dai, Y. et al.(2022) 'Proffiliau mynegiant cynhwysfawr o mRNAs, lncRNAs a miRNAs mewn clefyd Kashin-Beck a nodwyd gan RNA-dilyniannu', Molecular Omics, 18(2), tt. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Dadansoddiad trawsgrifio hyd llawn o wrthsefyll oerfel Apis cerana ym Mynydd Changbai yn ystod y cyfnod gaeafu.', Gene, 830, tt. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Blaenoriaethu Aml-Omics Seiliedig ar Integreiddio Rhwydweithiau Rheoleiddio RNA Mewndarddol Cystadleuol mewn Canser yr Ysgyfaint Celloedd Bach: Nodweddion Moleciwlaidd ac Ymgeiswyr Cyffuriau', Ffiniau mewn Oncoleg, 12, t.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Mae dadansoddiad integredig o broffiliau mynegiant lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA yn datgelu mewnwelediadau newydd i fecanweithiau posibl mewn ymateb i nematodau gwraidd-gwlwm mewn cnau daear', BMC Genomeg, 23(1), tt. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FFIGURAU/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Mae dilyniannu RNA trawsgrifiad cyfan yn amlygu'r mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â chynnal ansawdd ôl-gynhaeaf mewn brocoli trwy arbelydru LED coch', Postharvest Biology and Technology, 188, t.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
