Bakteriel og svampe hele genom-re-sekventering
Bakterielle og svampe-helgenome-re-sekventeringsprojekter er afgørende til fremme af mikrobiel genomik ved at muliggøre færdiggørelse og sammenligning af mikrobielle genomer. Dette letter fermenteringsteknik, optimering af industrielle processer og udforskning af sekundære metabolismeveje. Endvidere er svampe og bakteriel re-sekventering afgørende for at forstå miljøtilpasning, optimering af stammer og afslørende genetisk udviklingsdynamik med brede konsekvenser i medicin, landbrug og miljøvidenskab.
Servicefordele
●Bioinformatisk analyse inkluderer variantopkald:Tilvejebringelse af funktionel indsigt i de re-sekventerede genomer.
● Omfattende ekspertise: Med tusinder af mikrobielle re-sekventeringsprojekter, der udføres årligt, bringer vi over et årti med erfaring, et meget dygtigt analyseteam, omfattende indhold og fremragende support efter salget.
●Support efter salg:Vores forpligtelse strækker sig ud over projektets afslutning med en 3-måneders serviceperiode efter salg. I løbet af denne tid tilbyder vi projektopfølgning, fejlfinding af hjælp og Q & A-sessioner til at tackle eventuelle forespørgsler relateret til resultaterne.
Servicespecifikationer
| Sekventeringsplatform | Sekventeringsstrategi | Anbefalet data | Kvalitetskontrol |
| Illumina Novaseq | PE150 | Dybde på 100x | Q30≥85% |
Prøvebehov
| Koncentration (ng/µl) | Samlet beløb (NG) | Volumen (µl) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterier: ≥1x107 celler
Unicellular Fungi: ≥5x106-1x107 celler
Macro Fungi: ≥4g
Service Work Flow
Eksempel på levering
Bibliotekskonstruktion
Sekventering
Dataanalyse
Eftersalg tjenester
Inkluderer følgende analyse:
- Sekventering af datakvalitetskontrol
- Tilpasning til referencegenomet
- Variant Calling: SNP og Indel
- Variant Annotation
Variant Calling: SNP -typer
Variant Calling: Indel -længde distribution
Udforsk de fremskridt, der er lettet af BMKGENEs mikrobielle genome-sekventeringstjenester gennem en kurateret samling af publikationer.
Jia, Y. et al. )International Journal of Molecular Sciences, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-kontrolleret glukosemetabolisme manipulerer overgangen fra tolerance til resistens i bakterier',Videnskab fremmer, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina Halalkaliphila sp. Nov., En haloalkaliphilisk bakterie isoleret fra en sodavand i den indre Mongoliet autonome region, Kina ', int. J. Syst. EVOL.Mikrobiol, 72, s. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. og Wang, G.-H. (2024) 'Genomsekvens af Staphylococcus nepalensis ZZ-2023A, isoleret fra Nasonia vitripennis',Mikrobiologiske ressourcemeddelelser. doi: 10.1128/mra.00802-23.
