Re-sekventering af hele genomet af bakterier og svampe
Bakterie- og svampe-hel-genom-gensekventeringsprojekter er afgørende for at fremme mikrobiel genomik ved at muliggøre færdiggørelse og sammenligning af mikrobielle genomer. Dette letter fermenteringsteknik, optimering af industrielle processer og udforskning af sekundære metabolismeveje. Ydermere er svampe- og bakteriel re-sekventering afgørende for forståelsen af miljøtilpasning, optimering af stammer og afsløring af genetisk evolutionsdynamik, med brede implikationer inden for medicin, landbrug og miljøvidenskab.
Service fordele
●Bioinformatisk analyse inkluderer variantkald:Giver funktionel indsigt i de gensekventerede genomer.
● Omfattende ekspertise: Med tusindvis af mikrobielle re-sekventeringsprojekter, der udføres årligt, bringer vi over ti års erfaring, et højt kvalificeret analyseteam, omfattende indhold og fremragende post-salg support.
●Support efter salg:Vores engagement strækker sig ud over projektafslutning med en 3-måneders eftersalgsserviceperiode. I løbet af denne tid tilbyder vi projektopfølgning, fejlfindingshjælp og Q&A-sessioner for at løse eventuelle spørgsmål relateret til resultaterne.
Service specifikationer
| Sekvenseringsplatform | Sekvenseringsstrategi | Data anbefales | Kvalitetskontrol |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Dybde på 100x | Q30≥85 % |
Prøvekrav
| Koncentration (ng/µL) | Samlet beløb (ng) | Volumen (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterier: ≥1x107 celler
Encellede svampe: ≥5x106-1x107 celler
Makrosvampe: ≥4g
Service Work Flow
Prøve levering
Biblioteksbyggeri
Sekvensering
Dataanalyse
Eftersalgsservice
Indeholder følgende analyse:
- Sekventering af datakvalitetskontrol
- Tilpasning til referencegenomet
- Variantkald: SNP og InDel
- Variantanmærkning
Variantkald: SNP-typer
Variantkald: InDel længdefordeling
Udforsk de fremskridt, der er lettet af BMKGenes mikrobielle genom-gensekventeringstjenester gennem en kurateret samling af publikationer.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kombinering af transkriptom og helgenom-resekventering for at screene gener for sygdomsresistens for hvede-dværgbunt',Internationalt tidsskrift for molekylære videnskaber24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-kontrolleret glukosemetabolisme manipulerer overgangen fra tolerance til resistens i bakterier',Videnskabens fremskridt9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., en haloalkalifil bakterie isoleret fra en sodavandssø i den autonome region Indre Mongoliet, Kina', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, s. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. og Wang, G.-H. (2024) 'Genomsekvens af Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, isoleret fra Nasonia vitripennis',Meddelelser om mikrobiologiressourcer. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
