条形 Banner-03

Produkter

DNA/RNA -sekventering - Nanopore Sequencer

ONT-sekventering er et enkelt molekyle realtids elektrisk signalsekventeringsteknologi baseret på nanoporer, sekventeringsprincippet for hver platform er det samme. Dobbeltstrenget DNA/RNA vil binde til nanoporøst protein indlejret i biofilmen og slappe af under føringen af ​​motorisk protein under virkning af spændingsforskel fra begge sider af biofilmen, DNA/RNA-strenge passerer gennem nanopore-kanalproteinet ved en vis bestemt sats. På grund af forskellene i de kemiske egenskaber af de forskellige baser på DNA/RNA -strengen, når en enkelt base eller DNA -molekyle passerer gennem nanopore -kanalen, vil det forårsage ændring af forskellige elektriske signaler. Ved at detektere og svare til disse signaler kan de tilsvarende basetyper beregnes, og realtidsdetektionen af ​​sekvensen kan afsluttes.


Serviceoplysninger

Demo -resultat

Serviceoplysninger

Platform

Bibliotekstørrelse

Teoretiske dataudbytte (pr. Celle)

Enkeltbaseret nøjagtighed

Applikationer

Nanopore

8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralong, cDNA-PCR

70-90 GB/celle

85-92%

SV-opkald, de novo, sekventering i fuld længde, iso-seq, gennotation, påvisning af DNA-methylering

Servicefordele

● Over 5 års erfaring på Pacbio -sekventeringsplatform med tusinder af lukkede projekter med forskellige arter.
● BMKGENE er en officiel partner i Oxford Nanopore med dobbelt platform RNA/DNA -certificering.
● Der er mainstream -modeller af sequencere med komplet udstyr og tilstrækkelig sekventeringsgennemstrømning.
● Baseret på nanopore -platformen er der blevet offentliggjort mere end 10 dyre- og plante -Denovo -undersøgelser i internationalt anerkendte tidsskrifter.

Prøvebehov


Prøvetype

Beløb

Koncentrion (Qubit ®)

Bind

Renhed

Andre

Genomisk DNA

Afhænger af datakrav

 ≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5 ;

Klar top ved 260 nm , ingen forureninger

Koncentration skal måles ved qubit og qubit/nanopore ≤ 2

Total RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Ingen forureninger

RIN -værdi ≥7,5

 

Service Workflow

Prøveforberedelse

Prøveforberedelse

Biblioteksforberedelse

Bibliotekskonstruktion

Sekventering

Sekventering

Dataanalyse

Dataanalyse

Prøve QC

Projektlevering


  • Tidligere:
  • Næste:

  • Vurdering af datakvalitet af DNA -prøve

    Tabel 1. Statistik om rene data.

    Bmkid

    Rawseqnum

    Rawsumbase

    Cleanseqnum

    CleanSumbase

    Cleann50Len

    Cleann90Len

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Datakvalitetsvurdering af RNA -prøve

    Tabel 1. Statistik om rene data.

    Filnavn

    ClientId

    Readnum

    Basenum

    N50

    Middelængde

    Maxlength

    Middelværdi

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figur 1. Læs længdefordeling

    A3

    Figur 2. Kvalitetsresultatfordeling af rene data

    A4

    Figur 3. Længde og kvalitetsresultatfordeling af rene data

    A5

    Få et tilbud

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: