条形banner-03

Produkter

Eukaryot mRNA-sekventering-NGS

mRNA-sekventering, en alsidig teknologi, giver mulighed for den omfattende profilering af alle mRNA-transkripter i celler under specifikke forhold. Med sine vidtspændende applikationer afslører dette banebrydende værktøj indviklede genekspressionsprofiler, genstrukturer og molekylære mekanismer forbundet med forskellige biologiske processer. MRNA-sekventering, der er bredt udbredt inden for grundforskning, klinisk diagnostik og lægemiddeludvikling, giver indsigt i forviklingerne af cellulær dynamik og genetisk regulering, hvilket vækker nysgerrighed om dets potentiale på forskellige områder.

Platform: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7


Servicedetaljer

Bioinformatik

Demo resultater

Udvalgte publikationer

Funktioner

● Indfangning af poly-mRNA før biblioteksfremstilling

● Valgfri forberedelse af retningsbestemt mRNA-bibliotek for at muliggøre opnåelse af strengspecifikke sekventeringsdata

● Bioinformatisk analyse af genekspression og transskriptionsstruktur

 

Fordele

Omfattende ekspertise: Vores team har behandlet over 600.000 prøver hos BMKgene, der spænder over forskellige prøvetyper såsom cellekulturer, væv og kropsvæsker. Vi bringer et væld af erfaring til hvert projekt og har med succes gennemført over 100.000 mRNA-Seq-projekter inden for forskellige forskningsdomæner.

Strenge kvalitetskontrol: Vi implementerer centrale kontrolpunkter på tværs af alle stadier, fra prøve- og biblioteksforberedelse til sekventering og bioinformatik. Denne omhyggelige overvågning sikrer levering af konsekvent højkvalitetsresultater, hvilket sikrer dig, at dit projekt er i pålidelige hænder.

Omfattende anmærkning: Vi bruger flere databaser til funktionelt at annotere de differentielt udtrykte gener (DEG'er) og udføre tilsvarende berigelsesanalyser. Denne omfattende tilgang giver indsigt i de cellulære og molekylære processer, der ligger til grund for transkriptomresponset, og sikrer, at du er fuldt informeret om dit projekts resultater.

Support efter salg: Vores engagement strækker sig ud over projektafslutning med en 3-måneders eftersalgsserviceperiode. I løbet af denne tid tilbyder vi projektopfølgning, fejlfindingshjælp og Q&A-sessioner for at løse eventuelle spørgsmål relateret til resultaterne.

Prøvekrav og levering

Bibliotek Sekvenseringsstrategi Data anbefales Kvalitetskontrol
Poly A beriget

Illumina PE150

DNBSEQ-T7

6 -10 Gb

Q30≥85 %

Prøvekrav:

Nukleotider:

 

Konc.(ng/μl)

Mængde (μg)

Renhed

Integritet

Standard bibliotek

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrænset eller ingen protein- eller DNA-kontamination vist på gel.

For planter: RIN≥4,0;

For dyr: RIN≥4,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrænset eller ingen basislinjestigning

Retningsbestemt bibliotek

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrænset eller ingen protein- eller DNA-kontamination vist på gel.

For planter: RIN≥4,0;

For dyr: RIN≥4,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrænset eller ingen basislinjestigning

● Planter:

Rod, stilk eller kronblad: 450 mg

Blad eller frø: 300 mg

Frugt: 1,2 g

Dyr:

Hjerte eller tarm: 300 mg

Indvolde eller hjerne: 240 mg

Muskel: 450 mg

Knogler, hår eller hud: 1g

● Leddyr:

Insekter: 6g

Krebsdyr: 300 mg

● Fuldblod: 1 rør

● Celler: 106 celler

Anbefalet prøvelevering

Beholder: 2 ml centrifugerør (stanniol anbefales ikke)

Prøvemærkning: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...

Forsendelse:

1. Tøris: Prøver skal pakkes i poser og begraves i tøris.

2. RNA-bordrør: RNA-prøver kan tørres i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i stuetemperatur.

Service Work Flow

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøve levering

Prøve levering

Piloteksperiment

RNA-ekstraktion

Biblioteksforberedelse

Biblioteksbyggeri

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Eftersalgsservice

Eftersalgsservice


  • Tidligere:
  • Næste:

  • Bioinformatik

    wps_doc_10

    Eukaryot mRNA-sekventeringsanalyse arbejdsgang

    Bioinformatik

    ØKvalitetskontrol af rådata

    ØReferencegenomjustering

    ØTransskriptionsstrukturanalyse

    ØKvantificering af udtryk

    ØDifferentiel ekspressionsanalyse

    ØFunktionsanmærkning og berigelse

    Reference Genome Alignment

     

    图片1

     

    Datamætning

     

    3(1)

     

     

    Prøvekorrelation og vurdering af biologiske replikater

     

    图片2

     

    Differentielt udtrykte gener (DEG'er)

     

    4(1)

     

     

    Funktionel annotering af DEG'er

     

    6(1)

     

     

     

    Funktionel berigelse af DEG'er

     

    图片4

     

    Udforsk de fremskridt, der er lettet af BMKGenes eukaryote NGS mRNA-sekventeringstjenester gennem en kurateret samling af publikationer.

     

    Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan og triclocarban svækker guldfiskens lugtekapacitet ved at begrænse lugtgenkendelse, forstyrre lugtsignaltransduktion og forstyrre lugtinformationsbehandling', Water Research, 233, s. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.

    Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus kaprer human p11 for at omdirigere svampeholdige fagosomer til ikke-nedbrydende vej', Cell Host & Microbe, 31(3), s. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.

    Jin, K. et al. (2022) 'TCP Transcription Factors Involved in Shoot Development of Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, s. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.

    Wen, X. et al. (2022) 'Chrysanthemum lavandulifolium-genomet og den molekylære mekanisme, der ligger til grund for forskellige capitulum-typer', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.

    Zhang, Yujie et al. (2023) 'En kaskade nanoreaktor til forbedring af sonodynamisk terapi på kolorektal cancer via synergistisk ROS-forstærkning og autofagiblokering', Nano Today, 49, s. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.

    få et tilbud

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: