BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Svampegenom

Biomarker Technologies leverer genomundersøgelse, fint genom og pen-komplet genom af svampe afhængigt af specifikke forskningsmål.Genomsekventering, samling og funktionel annotering kan opnås ved at kombinere næste generations sekventering + tredje generations sekventering for at opnå genomsamling på højt niveau.Hi-C-teknologi kan også anvendes til at lette genomsamling på kromosomniveau.

Platform:PacBio Sequel II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq platform


Servicedetaljer

Demo resultater

Service fordele

● Flere sekventeringsstrategier tilgængelige for forskellige forskningsmål

● Meget erfaren i svampegenomsamling med over 10.000 pene-komplette genom samlet.

● Professionelt eftersalgs teknisk supportteam, der opfylder mere specifikke forskningsbehov.

Service specifikationer

Service

Sekvenseringsstrategi

Kvalitet garanteret

Estimeret ekspeditionstid

Svampe fint kort

Illumina 50X+Nanopore 100X

Contig N50≥2 Mb

35 arbejdsdage

PacBio HiFi 30X

Svampepene-komplet kort

Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X

Kromosom forankringsforhold >90 %

45 arbejdsdage

Bioinformatiske analyser

● Rådatakvalitetskontrol

● Genomsamling

● Genomkomponentanalyse

● Genfunktionsanmærkning

● Komparativ genomisk analyse

2

Prøvekrav og levering

Prøvekrav:

TilDNA-ekstrakter:

Prøvetype

Beløb

Koncentration

Renhed

DNA-ekstrakter

> 1,2 μg

> 20 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

For vævsprøver:

Prøvetype Anbefalet prøvebehandling Prøveopbevaring og forsendelse
Encellet svamp Observer gær under mikroskop og opsaml dem i deres eksponentielle fase

Overfør kulturen (indeholdende ca. 3-4.5e9 celler) til en 1,5 eller 2 ml eppendorf.(Hold dig på is)

Centrifuger røret i 1 min ved 14000 g for at opsamle bakterier og fjern forsigtigt supernatanten

Forsegl røret og frys bakterierne i flydende nitrogen i mindst 1-3 timer.Opbevar røret i -80 ℃ køleskab.

Frys prøverne i flydende nitrogen i 3-4 timer og opbevar dem i flydende nitrogen eller -80 grader til langtidsreservation.Prøveforsendelse med tøris er påkrævet.
Makrosvamp Væv i aktivt voksende fase anbefales.

Skyl vævet med endotoksinfrit vand, derefter 70% ethonal.

Gem prøven i kryorør.

Service Work Flow

prøve levering

Prøve levering

Biblioteksforberedelse

Biblioteksbyggeri

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Eftersalgsservice

Eftersalgsservice


  • Tidligere:
  • Næste:

  • 1.Circosdiagram over svampegenomiske komponenter

    3

    2.Komparativ genomisk analyse: Fylogenetisk træ

    4

     

    få et citat

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: