Transkriptom er forbindelsen mellem genomisk genetisk information og proteomet af biologisk funktion.Transskriptionsniveauregulering er den vigtigste og mest undersøgte reguleringsmetode for organismer.Transkriptomsekventering kan sekventere transkriptomet på et hvilket som helst tidspunkt eller under enhver tilstand med en opløsning, der er nøjagtig i forhold til et enkelt nukleotid. Den kan dynamisk afspejle niveauet af gentranskription, samtidig identificere og kvantificere sjældne og normale transkripter og give den strukturelle information af prøve specifikke transskriptioner.
På nuværende tidspunkt er transkriptomsekventeringsteknologi blevet brugt i vid udstrækning inden for agronomi, medicin og andre forskningsområder, herunder dyre- og planteudviklingsregulering, miljøtilpasning, immuninteraktion, genlokalisering, artsgenetisk udvikling og påvisning af tumorer og genetiske sygdomme.
