BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Prokaryot RNA-sekventering

Prokaryot RNA-sekventering bruger næste generations sekventering (NGS) til at afsløre tilstedeværelsen og mængden af ​​RNA på et givet tidspunkt ved at analysere det skiftende cellulære transkriptom.Vores virksomheds prokaryote RNA-sekventering retter sig specifikt mod prokaryoter med referencegenomer, hvilket giver dig transkriptomprofilering, genstrukturanalyse osv. Det er blevet brugt bredt til grundlæggende videnskabelig forskning, lægemiddelforskning og -udvikling og mere.

Platform: Illumina NovaSeq Platform


Servicedetaljer

Service specifikationer

Platform: Illumina NovaSeq platform, PE150

Bibliotekstype: 350bp insert cDNA-bibliotek (afhænger af peak distribution)

Sekvenseringsstrategi: Paired-End 150 bp

Anbefalet datamængde: 2 Gb rådata/sample

Bioinformatik

(1) Sekventeringsdatakvalitetskontrol: Nukleotidfordeling, Basekvalitetsfordeling, rRNA-forholdsvurdering;

(2) Sekvensjusteringsanalyse: Opstillingsresultatstatistik, Mætning af sekventering, Dækning af sekventering;

(3) Referencegenomannotation (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Ekspressionsanalyse: Ekspressionsfordeling (Med to eller flere prøver), Analyse af ekspression mellem prøver (Venn-analyse, Korrelationsanalyse, PCA-analyse);

(5) Differentiel ekspressionsanalyse (med to eller flere prøver);

(6) Gensætanalyse: Venn-analyse, Cluster-analyse, Funktionsannotationsanalyse (COG, GO, KEGG), Funktionsberigelsesanalyse (GO, KEGG), Funktionsberigelse akkordgraf, Ipath-analyse;

(7) sRNA-analyse: sRNA-forudsigelse, sRNA-annotering (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), forudsigelse af sekundær sRNA-struktur, forudsigelse af sRNA-målgen;

(8) Transskriptionsstrukturanalyse: operonanalyse, forudsigelse af transkriptionsstart- og slutsteder, UTR-annotering og -analyse, promotorsekvensforudsigelse, SNP/InDel-analyse (SNP/InDel-annotering, SNP/InDel-regional fordeling, SNP-statistik).

Service Work Flow

prøve levering

Prøve levering

Biblioteksforberedelse

Biblioteksbyggeri

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Eftersalgsservice

Eftersalgsservice


  • Tidligere:
  • Næste:

  • få et citat

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: