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Chromatin-Immunpräzipitationssequenzierung (ChIP-seq)

ChIP-Seq ermöglicht die genomweite Profilierung von DNA-Zielen für Histonmodifikationen, Transkriptionsfaktoren und andere DNA-assoziierte Proteine.Es kombiniert die Selektivität der Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP) zur Gewinnung spezifischer Protein-DNA-Komplexe mit der Leistungsfähigkeit des Next-Generation-Sequencing (NGS) zur Hochdurchsatzsequenzierung der gewonnenen DNA.Da die Protein-DNA-Komplexe außerdem aus lebenden Zellen gewonnen werden, können Bindungsstellen in verschiedenen Zelltypen und Geweben oder unter verschiedenen Bedingungen verglichen werden.Die Anwendungen reichen von der Transkriptionsregulation über Entwicklungspfade bis hin zu Krankheitsmechanismen und darüber hinaus.

Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform


Servicedetails

Bioinformatik

Demo-Ergebnisse

Servicevorteile

● Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform, PE150

● Bibliothekstyp: 100-500-bp-Insert-DNA-Bibliothek (abhängig von der Peakverteilung)

● Sequenzierungsstrategie: Paired-End 150 bp

● Empfohlene Datenausgabe: 6 GB Rohdaten/Probe.

Beispielanforderungen

DNA-Menge: ≥ 70 ng, Hauptpeak 100 bis 500 bp

Probenvolumen: ≥ 10 μl

OD260/280 = 1,8 bis 2,0 ohne Abbau oder RNA-Kontamination

Experimenteller Arbeitsablauf

Bild 1

Service-Workflow

Musterlieferung

Musterlieferung

Bibliotheksvorbereitung

Bibliotheksbau

Sequenzierung

Sequenzierung

Datenanalyse

Datenanalyse

Kundendienst

Kundendienst


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  • Nächste:

  • 表观-01

    1. Spitzenanreicherungsverteilung

    官网图1

     

    2. MA-Diagramm des Differenzpeaks

    官网图2

     

    3.KEGG-Anmerkung

    官网图3

     

    4. GO-Klassifizierung

    官网图4

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