Lange nicht-kodierende Sequenzierungs-Illumina
Servicevorteile
●Gelenkanalyse von mRNA und lncRNA: Durch Kombination der Quantifizierung von mRNA-Transkripten mit der Untersuchung von LNCRNA und ihren Zielen ist es möglich, einen eingehenden Überblick über den regulatorischen Mechanismus zu erhalten, der der zellulären Reaktion zugrunde liegt.
●Umfangreiches Fachwissen: Unser Team bringt eine Fülle von Erfahrungen in jedes Projekt mit sich, wobei jedes Projekt eine Erfolgsgeschichte bei der Verarbeitung von über 23.000 Proben bei BMK über verschiedene Stichprobentypen und lncRNA -Projekte verarbeitet hat.
●Strenge Qualitätskontrolle: Wir implementieren Kernkontrollpunkte in allen Stufen, von der Proben- und Bibliotheksvorbereitung bis hin zur Sequenzierung und Bioinformatik. Diese akribische Überwachung sorgt für die Bereitstellung konsequent hochwertiger Ergebnisse.
●Unterstützung nach dem Verkauf: Unser Engagement geht über den Abschluss des Projekts mit einem 3-monatigen Nachverkaufsdauer hinaus. Während dieser Zeit bieten wir Projekt-Follow-up, Fehlerbehebung und Q & A-Sitzungen an, um alle Abfragen im Zusammenhang mit den Ergebnissen zu beheben.
Probenanforderungen und Lieferung
| Bibliothek | Plattform | Empfohlene Daten | Daten QC |
| rRNA -abgereicherte Richtungsbibliothek | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30 ≥ 85% |
Nukleotide:
| Conc. (Ng/μl) | Menge (μg) | Reinheit | Integrität |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Begrenzte oder keine Protein- oder DNA -Kontamination auf Gel. | Rin ≥ 6,0; 5,0 ≥ 28s/18s ≥ 1,0; begrenzte oder keine Grundlinienerhebung |
● Pflanzen:
Wurzel, Stamm oder Blütenblatt: 450 mg
Blatt oder Samen: 300 mg
Frucht: 1,2 g
● Tier:
Herz oder Darm: 450 mg
Eingeweide oder Gehirn: 240 mg
Muskel: 600 mg
Knochen, Haare oder Haut: 1,5 g
● Arthropoden:
Insekten: 9g
Crustacea: 450 mg
● Vollblut:2 Röhrchen
● Zellen: 106 Zellen
● Serum und Plasma: 6 ml
Empfohlene Probenzustellung
Behälter: 2 ml Zentrifugenrohr (Zinnfolie wird nicht empfohlen)
Beispielkennzeichnung: Gruppe+Replikat zB A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lieferung:
1. Trockeneis: Proben müssen in Beutel gepackt und in Trockeneis begraben werden.
2. RNAsable -Röhrchen: RNA -Proben können in RNA -Stabilisierungsrohr (z. B. RNAsable®) getrocknet und in Raumtemperatur versendet werden.
Service Work Flow
Experimententwurf
Probenabgabe
RNA -Extraktion
Bibliothekskonstruktion
Sequenzierung
Datenanalyse
Nachverkaufsdienste
Bioinformatik
Differentialgenexpressionsanalyse (DEGS)
Quantifizierung der lncRNA -Expression - Clustering
Anreicherung von lncRNA -Zielgenen
Gemeinsame mRNA- und lncRNA -Positionsanalyse - Circos -Diagramm (Middle Circle ist mRNA und innerer cicrlce ist lncRNA)
Untersuchen Sie die Fortschritte, die durch die lncRNA -Equenzdienste von BMKgene durch eine kuratierte Sammlung von Veröffentlichungen erleichtert wurden.
Ji, H. et al. (2020) 'Identifizierung, funktionelle Vorhersage und wichtige LNCRNA-Überprüfung von kaltstressbedingten LNCRNAs bei Rattenleber', wissenschaftliche Berichte 2020 10: 1, 10 (1), S. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Integrative transkriptomische Analyse zeigt den Immunmechanismus für einen CYHV-3-resistenten Karpfenstamm', Grenzen in der Immunologie, 12, p. 687151. Doi: 10.3389/fimmu.2021.687151/bibtex.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-OMICS-Integrationsbasierte Priorisierung von konkurrierenden endogenen RNA-Regulierungsnetzen bei kleinzelligem Lungenkrebs: Molekulare Eigenschaften und Arzneimittelkandidaten ", Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xiao, L. et al. (2020) "Genetische Dissektion des Gen -Koexpressionsnetzes, die der Photosynthese in Populus zugrunde liegen", Plant Biotechnology Journal, 18 (4), S. 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Ein globales regulatorisches Netzwerk für dysregulierte Genexpression und abnormale metabolische Signalübertragung in Immunzellen in der Mikroumgebung der Krankheit von Gräbern und Hashimoto -Thyreoiditis ", Grenzen in der Immunologie, 13, p. 879824. Doi: 10.3389/fimmu.2022.879824/bibtex.
