Ganze Transkriptomsequenzierung - Illumina
Merkmale
Ur
● Vollständige Bioinformatikanalyse von mRNA, lncRNA, circRNA und miRNA in separaten Bioinformatikberichten
● gemeinsame Analyse aller RNA -Expression in einem kombinierten Bericht, einschließlich der Analyse von CERNA -Netzwerken.
Servicevorteile
●Eingehende Analyse der regulatorischen Netzwerke: Die CERNA -Netzwerkanalyse wird durch die gemeinsame Sequenzierung von mRNA, lncRNA, circRNA und miRNA und durch einen erschöpfenden bioinformatischen Workflow.
●Umfassende Annotation: Wir verwenden mehrere Datenbanken, um die differentiell exprimierten Gene (DEGs) funktional zu kommentieren und die entsprechende Anreicherungsanalyse durchzuführen, um Einblicke in die zellulären und molekularen Prozesse zu geben, die der Transkriptomantwort zugrunde liegen.
●Umfangreiches Fachwissen: Mit einer Erfolgsgeschichte, die über 2100 gesamte Transkriptomprojekte in verschiedenen Forschungsdomäne erfolgreich geschlossen wurde, bringt unser Team jedes Projekt eine Fülle von Erfahrungen mit sich.
●Strenge Qualitätskontrolle: Wir implementieren Kernkontrollpunkte in allen Stufen, von der Proben- und Bibliotheksvorbereitung bis hin zur Sequenzierung und Bioinformatik. Diese akribische Überwachung sorgt für die Bereitstellung konsequent hochwertiger Ergebnisse.
●Unterstützung nach dem Verkauf: Unser Engagement geht über den Abschluss des Projekts mit einem 3-monatigen Nachverkaufsdauer hinaus. Während dieser Zeit bieten wir Projekt-Follow-up, Fehlerbehebung und Q & A-Sitzungen an, um alle Abfragen im Zusammenhang mit den Ergebnissen zu behandeln
Probenanforderungen und Lieferung
| Bibliothek | Sequenzierungsstrategie | Daten empfohlen | Qualitätskontrolle |
| rRNA erschöpft | Illumina PE150 | 16 GB | Q30 ≥ 85% |
| Größe ausgewählt | Illumina SE50 | 10-20m liest sich |
Beispielanforderungen:
Nukleotide:
| Conc. (Ng/μl) | Menge (μg) | Reinheit | Integrität |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Begrenzte oder keine Protein- oder DNA -Kontamination auf Gel. | Rin ≥ 6,0 5,0 ≥ 28s/18s ≥ 1,0; begrenzte oder keine Grundlinienerhebung |
Empfohlene Probenzustellung
Behälter: 2 ml Zentrifugenrohr (Zinnfolie wird nicht empfohlen)
Beispielkennzeichnung: Gruppe+Replikat zB A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lieferung:
1. Trockeneis: Proben müssen in Beutel gepackt und in Trockeneis begraben werden.
2. RNAsable -Röhrchen: RNA -Proben können in RNA -Stabilisierungsrohr (z. B. RNAsable®) getrocknet und bei Raumtemperatur versendet werden.
Service Work Flow
Experimententwurf
Probenabgabe
RNA -Extraktion
Bibliothekskonstruktion
Sequenzierung
Datenanalyse
Nachverkaufsdienste
Bioinformatik
RNA -Expressionsübersicht
Differentiell exprimierte Gene
CERNA -Analyse
Differentiell exprimierte miRNAs und verwandte RNAs
Untersuchen Sie die Forschungsergebnisse, die durch die gesamten Transkriptom -Sequenzierungsdienste von BMKgene durch eine kuratierte Sammlung von Veröffentlichungen erleichtert wurden.
Dai, Y. et al. (2022) 'umfassende Expressionsprofile von mRNAs, LNCRNAs und miRNAs bei Kashin-Beck-Erkrankungen, die durch RNA-Sequenzierung identifiziert wurden', Molekular Omics, 18 (2), S. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. (2022) 'Analyse der Transkriptome in voller Länge der Kälteresistenz von APIs Cerana im Changbai-Berg während des Überwinterungszeitraums.', Gene, 830, S. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-OMICS-Integrationsbasierte Priorisierung von konkurrierenden endogenen RNA-Regulierungsnetzen bei kleinzelligem Lungenkrebs: Molekulare Eigenschaften und Arzneimittelkandidaten ", Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. (2022) 'Integrierte Analyse der Expressionsprofile von lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA zeigt neue Einblicke in mögliche Mechanismen als Reaktion auf Wurzelknoten-Nematoden in Erdnuss, BMC-Genomik, 23 (1), S. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/figures/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Volltranskriptom-RNA-Sequenzierung unterstreicht die molekularen Mechanismen, die mit der Aufrechterhaltung der Nachervest-Qualität in Brokkoli durch rote LED-Bestrahlung verbunden sind. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
