-
PacBio-Πλήρης μεταγραφή (Μη Αναφορά)
Η πλατφόρμα Amplicon (16S/18S/ITS) έχει αναπτυχθεί με πολυετή εμπειρία στην ανάλυση έργων μικροβιακής ποικιλότητας, η οποία περιέχει τυποποιημένη βασική ανάλυση και εξατομικευμένη ανάλυση: η βασική ανάλυση καλύπτει το κύριο περιεχόμενο ανάλυσης της τρέχουσας μικροβιακής έρευνας, το περιεχόμενο ανάλυσης είναι πλούσιο και περιεκτικό. και τα αποτελέσματα της ανάλυσης παρουσιάζονται με τη μορφή εκθέσεων έργου.Το περιεχόμενο της εξατομικευμένης ανάλυσης είναι ποικίλο.Τα δείγματα μπορούν να επιλεγούν και οι παράμετροι μπορούν να ρυθμιστούν με ευελιξία σύμφωνα με τη βασική αναφορά ανάλυσης και τον ερευνητικό σκοπό, για την πραγματοποίηση εξατομικευμένων απαιτήσεων.Λειτουργικό σύστημα Windows, απλό και γρήγορο.
-
PacBio-Πλήρης μεταγραφή (Μη Αναφορά)
Λαμβάνοντας ως είσοδο δεδομένα αλληλουχίας ισομορφών Pacific Biosciences (PacBio), αυτή η εφαρμογή είναι σε θέση να αναγνωρίσει αλληλουχίες μεταγραφής πλήρους μήκους (χωρίς συναρμολόγηση).Χαρτογραφώντας αλληλουχίες πλήρους μήκους έναντι του γονιδιώματος αναφοράς, τα μεταγραφήματα μπορούν να βελτιστοποιηθούν από γνωστά γονίδια, μεταγραφές, περιοχές κωδικοποίησης, κ.λπ.Η κοινή ανάλυση με δεδομένα αλληλουχίας μεταγραφής NGS επιτρέπει πιο ολοκληρωμένο σχολιασμό και ακριβέστερη ποσοτικοποίηση στην έκφραση σε επίπεδο μεταγραφής, κάτι που ωφελεί σε μεγάλο βαθμό τη διαφορική έκφραση και τη λειτουργική ανάλυση κατάντη.
-
Εργαλειοθήκες
Το BMKCloud είναι μια κορυφαία βιοπληροφορική πλατφόρμα που παρέχει ενιαία λύση για γονιδιωματικά προγράμματα, την οποία εμπιστεύονται ευρέως ερευνητές σε διάφορους τομείς, συμπεριλαμβανομένων των ιατρικών, γεωργικών, περιβαλλοντικών κ.λπ. , υπολογιστικούς πόρους, δημόσια βάση δεδομένων, διαδικτυακά μαθήματα βιοπληροφορικής κ.λπ. Το BMKCloud διαθέτει διάφορα συχνά χρησιμοποιούμενα βιοπληροφορικά εργαλεία που περιλαμβάνουν σχολιασμό γονιδίων, εξελικτικά γενετικά εργαλεία, ncRNA, έλεγχο ποιότητας δεδομένων, συναρμολόγηση, ευθυγράμμιση, εξαγωγή δεδομένων, μεταλλάξεις, στατιστικά στοιχεία, γεννήτρια ψηφίων, ακολουθία ανάλυση κ.λπ.
-
μικρό RNA
Τα μικρά RNA είναι τύπος μικρού μη κωδικοποιητικού RNA με μέσο μήκος 18-30 nt, συμπεριλαμβανομένων των miRNA, siRNA και piRNA.Αυτά τα μικρά RNA έχουν μαζικά αναφερθεί ότι εμπλέκονται σε διάφορες βιολογικές διεργασίες όπως η αποικοδόμηση του mRNA, η αναστολή μετάφρασης, ο σχηματισμός ετεροχρωματίνης κ.λπ. Η ανάλυση αλληλουχίας μικρού RNA έχει εφαρμοστεί ευρέως σε μελέτες για την ανάπτυξη ζώων/φυτών, ασθένειας, ιού κ.λπ. Μικρό RNA Η πλατφόρμα ανάλυσης αλληλουχίας αποτελείται από τυπική ανάλυση και προηγμένη εξόρυξη δεδομένων.Με βάση τα δεδομένα RNA-seq, η τυπική ανάλυση μπορεί να επιτύχει ταυτοποίηση και πρόβλεψη miRNA, πρόβλεψη γονιδίου στόχου miRNA, σχολιασμό και ανάλυση έκφρασης.Η προηγμένη ανάλυση επιτρέπει την προσαρμοσμένη αναζήτηση και εξαγωγή miRNA, τη δημιουργία διαγραμμάτων Venn, τη δημιουργία δικτύου miRNA και γονιδίου στόχου.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Το NGS-WGS είναι μια πλατφόρμα ανάλυσης ανα-αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος, η οποία έχει αναπτυχθεί με βάση την πλούσια εμπειρία στις Τεχνολογίες Biomarker.Αυτή η εύχρηστη πλατφόρμα επιτρέπει τη γρήγορη υποβολή μιας ολοκληρωμένης ροής εργασιών ανάλυσης ορίζοντας απλώς μερικές βασικές παραμέτρους, οι οποίες ταιριάζουν στα δεδομένα αλληλουχίας DNA που παράγονται τόσο από την πλατφόρμα Illumina όσο και από την πλατφόρμα αλληλουχίας BGI.Αυτή η πλατφόρμα έχει αναπτυχθεί σε υπολογιστικό διακομιστή υψηλής απόδοσης, ο οποίος παρέχει εξαιρετικά αποτελεσματική ανάλυση δεδομένων σε πολύ περιορισμένο χρόνο.Η εξατομικευμένη εξόρυξη δεδομένων είναι διαθέσιμη βάσει τυπικής ανάλυσης, συμπεριλαμβανομένης της ερώτησης μεταλλαγμένου γονιδίου, του σχεδιασμού εκκινητών PCR κ.λπ.
-
mRNA (Αναφορά)
Το μεταγραφικό είναι ο σύνδεσμος μεταξύ της γονιδιωματικής γενετικής πληροφορίας και του πρωτεώματος της βιολογικής λειτουργίας.Η ρύθμιση μεταγραφικού επιπέδου είναι ο πιο σημαντικός και ο πιο ευρέως μελετημένος τρόπος ρύθμισης των οργανισμών.Η αλληλουχία μεταγραφωμάτων μπορεί να προσδιορίσει την αλληλουχία του μεταγραφώματος σε οποιαδήποτε χρονική στιγμή ή υπό οποιεσδήποτε συνθήκες, με ανάλυση ακριβή σε ένα μεμονωμένο νουκλεοτίδιο. Μπορεί να αντικατοπτρίζει δυναμικά το επίπεδο μεταγραφής γονιδίων, ταυτοχρόνως να αναγνωρίζει και να ποσοτικοποιεί σπάνια και φυσιολογικά μεταγραφήματα και να παρέχει τις δομικές πληροφορίες του δείγμα συγκεκριμένων μεταγραφών.
Επί του παρόντος, η τεχνολογία αλληλουχίας μεταγραφομένων έχει χρησιμοποιηθεί ευρέως στη γεωπονία, την ιατρική και άλλα ερευνητικά πεδία, συμπεριλαμβανομένης της ρύθμισης ανάπτυξης ζώων και φυτών, περιβαλλοντικής προσαρμογής, ανοσολογικής αλληλεπίδρασης, εντοπισμού γονιδίων, γενετικής εξέλιξης ειδών και ανίχνευσης όγκων και γενετικών ασθενειών.
-
Μεταγονιδιωματική (NGS)
Αυτή η πλατφόρμα ανάλυσης έχει σχεδιαστεί για ανάλυση μεταγονιδιωματικών δεδομένων κυνηγετικών όπλων με βάση πολυετή εμπειρία.Αποτελείται από ολοκληρωμένη ροή εργασιών που περιέχει διάφορες συνήθως απαραίτητες αναλύσεις μεταγονιδιωματικής, συμπεριλαμβανομένης της επεξεργασίας δεδομένων, μελετών σε επίπεδο είδους, μελετών σε επίπεδο γονιδιακής λειτουργίας, σύνδεσης μεταγονιδιώματος κ.λπ. , ρύθμιση παραμέτρων, εξατομικευμένη δημιουργία ψηφίων κ.λπ.
-
LncRNA
Τα μακρά μη κωδικοποιητικά RNA (lncRNA) είναι ένας τύπος μεταγραφών με μήκος μεγαλύτερο από 200 nt, που δεν μπορούν να κωδικοποιήσουν πρωτεΐνες.Σωρευτικά στοιχεία υποδηλώνουν ότι τα περισσότερα lncRNA είναι πολύ πιθανό να είναι λειτουργικά.Οι τεχνολογίες αλληλουχίας υψηλής απόδοσης και τα εργαλεία βιοπληροφορικής ανάλυσης μας δίνουν τη δυνατότητα να αποκαλύπτουμε αλληλουχίες lncRNA και πληροφορίες θέσης πιο αποτελεσματικά και μας οδηγούν στην ανακάλυψη lncRNA με κρίσιμες ρυθμιστικές λειτουργίες.Η BMKCloud είναι περήφανη που παρέχει στους πελάτες μας πλατφόρμα ανάλυσης αλληλουχίας lncRNA για την επίτευξη γρήγορης, αξιόπιστης και ευέλικτης ανάλυσης lncRNA.
-
GWAS
Η μελέτη συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος (GWAS) στοχεύει στον εντοπισμό γενετικών παραλλαγών (γονότυπος) που σχετίζονται με συγκεκριμένα χαρακτηριστικά (φαινότυπος).Οι μελέτες GWA διερευνούν γενετικούς δείκτες που διασχίζουν ολόκληρο το γονιδίωμα μεγάλου αριθμού ατόμων και προβλέπει συσχετίσεις γονότυπου-φαινοτύπου με στατιστική ανάλυση σε επίπεδο πληθυσμού.Η αναδιάταξη ολόκληρου του γονιδιώματος μπορεί ενδεχομένως να ανακαλύψει όλες τις γενετικές παραλλαγές.Σε συνδυασμό με φαινοτυπικά δεδομένα, το GWAS μπορεί να υποβληθεί σε επεξεργασία για τον εντοπισμό SNP που σχετίζονται με φαινότυπο, QTL και υποψήφια γονίδια, τα οποία υποστηρίζουν σθεναρά τη σύγχρονη αναπαραγωγή ζώων/φυτών.Το SLAF είναι μια απλοποιημένη στρατηγική αλληλουχίας γονιδιώματος που αναπτύχθηκε μόνος του, η οποία ανακαλύπτει κατανεμημένους δείκτες σε όλο το γονιδίωμα, SNP.Αυτά τα SNP, ως μοριακούς γενετικούς δείκτες, μπορούν να υποβληθούν σε επεξεργασία για μελέτες συσχέτισης με στοχευμένα χαρακτηριστικά.Είναι μια οικονομικά αποδοτική στρατηγική για τον εντοπισμό σύνθετων χαρακτηριστικών που σχετίζονται με γενετικές παραλλαγές.
-
Νανοπορική Μεταγραφική πλήρους μήκους
Οι σύνθετες και μεταβλητές εναλλακτικές ισομορφές σε οργανισμούς είναι σημαντικοί γενετικοί μηχανισμοί για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης και της ποικιλότητας των πρωτεϊνών.Η ακριβής αναγνώριση των δομών μεταγραφής είναι η βάση για τη σε βάθος μελέτη των μοτίβων ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης.Η πλατφόρμα προσδιορισμού αλληλουχίας νανοπόρου έχει φέρει με επιτυχία τη μεταγραφική μελέτη σε επίπεδο ισομορφής.Αυτή η πλατφόρμα ανάλυσης έχει σχεδιαστεί για να αναλύει δεδομένα RNA-Seq που παράγονται στην πλατφόρμα Nanopore με βάση το γονιδίωμα αναφοράς, το οποίο επιτυγχάνει ποιοτικές και ποσοτικές αναλύσεις τόσο σε επίπεδο γονιδίου όσο και σε επίπεδο μεταγραφών.
