Προϊόντα

Αλληλούχιση DNA/RNA – Νανοπόρος Αλληλούχισης

Αλληλούχιση DNA/RNA – Προτεινόμενη εικόνα Nanopore Sequencer

Η αλληλούχιση ONT είναι μια τεχνολογία αλληλούχισης ηλεκτρικού σήματος σε πραγματικό χρόνο ενός μορίου που βασίζεται σε νανοπόρους. Η αρχή αλληλούχισης κάθε πλατφόρμας είναι η ίδια. Το δίκλωνο DNA/RNA θα συνδεθεί με νανοπορώδη πρωτεΐνη ενσωματωμένη στο βιοφίλμ και θα ξετυλιχθεί υπό την καθοδήγηση της κινητικής πρωτεΐνης. Υπό την επίδραση της διαφοράς τάσης και από τις δύο πλευρές του βιοφίλμ, οι κλώνοι DNA/RNA διέρχονται από την πρωτεΐνη καναλιού νανοπόρων με έναν ορισμένο ρυθμό. Λόγω των διαφορών στις χημικές ιδιότητες των διαφορετικών βάσεων στην κλώνο DNA/RNA, όταν μια μεμονωμένη βάση ή μόριο DNA διέρχεται από το κανάλι νανοπόρων, θα προκαλέσει την αλλαγή διαφορετικών ηλεκτρικών σημάτων. Με την ανίχνευση και την αντιστοίχιση αυτών των σημάτων, μπορούν να υπολογιστούν οι αντίστοιχοι τύποι βάσεων και να ολοκληρωθεί η ανίχνευση της αλληλουχίας σε πραγματικό χρόνο.

Επικοινωνήστε μαζί μας

Λεπτομέρειες υπηρεσίας

Αποτέλεσμα επίδειξης

Λεπτομέρειες υπηρεσίας Χαρακτηριστικά

Πλατφόρμα	Μέγεθος βιβλιοθήκης	Θεωρητική Απόδοση Δεδομένων (Ανά Κύτταρο)	Ακρίβεια μίας βάσης	Εφαρμογές
Νανοπόρων	8Kb, 10kb, 20kb, Υπερμακρύ, cDNA-PCR	70-90Gb/κελί	85-92%	Κλήση SV, De novo, Αλληλούχιση πλήρους μήκους, Iso-Seq, Σχολιασμός γονιδίων, Ανίχνευση μεθυλίωσης DNA

Πλεονεκτήματα Υπηρεσίας

● Πάνω από 5 χρόνια εμπειρίας στην πλατφόρμα αλληλούχισης PacBio με χιλιάδες ολοκληρωμένα έργα με διάφορα είδη.
● Η BMKGENE είναι επίσημος συνεργάτης της Oxford Nanopore, με διπλή πιστοποίηση RNA/DNA πλατφόρμας.
● Υπάρχουν κυρίαρχα μοντέλα συσκευών προσδιορισμού αλληλουχίας με πλήρη εξοπλισμό και επαρκή απόδοση προσδιορισμού αλληλουχίας.
● Με βάση την πλατφόρμα Nanopore, περισσότερες από 10 έρευνες Denovo σε ζώα και φυτά έχουν δημοσιευτεί σε διεθνώς αναγνωρισμένα περιοδικά.

Απαιτήσεις Δείγματος

Τύπος δείγματος

Ποσό

Συγκέντρωση (Qubit ®)

Τόμος

Καθαρότητα

Άλλοι

Γονιδιωματικό DNA

Εξαρτάται από την απαίτηση δεδομένων

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Διαυγής κορυφή στα 260 nm, χωρίς μολύνσεις

Η συγκέντρωση πρέπει να μετράται με Qubit και Qubit/Nanopore ≤ 2

Ολικό RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; καμία μόλυνση

Τιμή RIN ≥7,5

Ροή εργασίας υπηρεσίας

Προετοιμασία δείγματος

Κατασκευή βιβλιοθήκης

Αλληλούχιση

Ανάλυση δεδομένων

Παράδοση έργου

Προηγούμενος: Προκατασκευασμένες βιβλιοθήκες Illumina

Επόμενος: Αλληλούχιση ενισχυμένων θραυσμάτων ειδικού τόπου (SLAF-Seq)

Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος DNA

Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος RNA

Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

ΌνομαΑρχείου	Αναγνωριστικό πελάτη	Αριθμός ανάγνωσης	Αριθμός βάσης	N50	Μέσο Μήκος	Μέγιστο μήκος	Μέση βαθμολογία Q
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	Ε12