BMKCloud Log in
条形 banner-03

Προϊόντα

DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer

Η αλληλουχία ONT είναι μια τεχνολογία αλληλουχίας ηλεκτρικών σημάτων σε πραγματικό χρόνο ενός μορίου που βασίζεται σε νανοπόρους, η αρχή της αλληλουχίας κάθε πλατφόρμας είναι η ίδια.Το δίκλωνο DNA/RNA θα συνδεθεί με τη νανοπορώδη πρωτεΐνη που είναι ενσωματωμένη στο βιοφίλμ και θα ξετυλίγεται κάτω από το μόλυβδο της πρωτεΐνης κινητήρα, υπό τη δράση της διαφοράς τάσης και από τις δύο πλευρές του βιοφίλμ, οι κλώνοι DNA/RNA περνούν μέσω της πρωτεΐνης καναλιού νανοπόρου σε ορισμένο τιμή.Λόγω των διαφορών στις χημικές ιδιότητες των διαφορετικών βάσεων στον κλώνο DNA/RNA, όταν μια μεμονωμένη βάση ή μόριο DNA διέρχεται από το κανάλι νανοπόρου, θα προκαλέσει την αλλαγή διαφορετικών ηλεκτρικών σημάτων.Ανιχνεύοντας και αντιστοιχώντας σε αυτά τα σήματα, μπορούν να υπολογιστούν οι αντίστοιχοι τύποι βάσεων και να ολοκληρωθεί η ανίχνευση της ακολουθίας σε πραγματικό χρόνο.


Στοιχεία υπηρεσίας

Αποτέλεσμα επίδειξης

Στοιχεία υπηρεσίας Χαρακτηριστικά

Πλατφόρμα

Μέγεθος βιβλιοθήκης

Θεωρητική απόδοση δεδομένων (ανά κελί)

Ακρίβεια μίας βάσης

Εφαρμογές

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Κυψέλη

85-92%

Κλήση SV, De novo, Αλληλουχία πλήρους μήκους, Iso-Seq, Σχολιασμός γονιδίου, Ανίχνευση μεθυλίωσης DNA

Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης

● Πάνω από 5 χρόνια εμπειρίας στην πλατφόρμα αλληλούχισης PacBio με χιλιάδες κλειστά έργα με διάφορα είδη.
● Η BMKGENE είναι επίσημος συνεργάτης της Oxford Nanopore, με πιστοποίηση διπλής πλατφόρμας RNA/DNA.
● Υπάρχουν κύρια μοντέλα ακολουθιών με πλήρη εξοπλισμό και επαρκή απόδοση αλληλουχίας.
● Με βάση την πλατφόρμα Nanopore, περισσότερες από 10 έρευνες σε ζώα και φυτά της Denovo έχουν δημοσιευθεί σε διεθνούς φήμης περιοδικά.

Απαιτήσεις δειγμάτων


Τύπος δείγματος

Ποσό

Συγκέντρωση (Qubit ®)

Ενταση ΗΧΟΥ

Καθαρότητα

Οι υπολοιποι

Γονιδιωματικό DNA

Εξαρτήστε από την Απαίτηση Δεδομένων

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Καθαρή κορυφή στα 260 nm, χωρίς μολύνσεις

Η συγκέντρωση πρέπει να μετρηθεί με Qubit και Qubit/Nanopore ≤ 2

Ολικό RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;καμία μόλυνση

Τιμή RIN ≥7,5

 

Ροή εργασιών εξυπηρέτησης

Η προετοιμασία των δειγμάτων

Η προετοιμασία των δειγμάτων

Προετοιμασία Βιβλιοθήκης

Κατασκευή βιβλιοθήκης

Αλληλουχία

Αλληλουχία

Ανάλυση δεδομένων

Ανάλυση δεδομένων

Δείγμα QC

παράδοση έργου


  • Προηγούμενος:
  • Επόμενο:

  • Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος DNA

    Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    καθαρόN50Len

    καθαρόN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος RNA

    Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

    Ονομα αρχείου

    Ταυτότητα πελάτη

    ReadNum

    Αριθμός βάσης

    N50

    Μέσο Μήκος

    Μέγιστο μήκος

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Ε12

    Εικόνα 1. Ανάγνωση κατανομής μήκους

    Α3

    Εικόνα 2. Κατανομή βαθμού ποιότητας καθαρών δεδομένων

    Α4

    Σχήμα 3. Κατανομή μήκους και βαθμολογίας ποιότητας καθαρών δεδομένων

    Α5

    λάβετε μια προσφορά

    Γράψτε το μήνυμά σας εδώ και στείλτε το σε εμάς

    Στείλτε μας το μήνυμά σας: