Γονιδίωμα μυκήτων
Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης
● Πολλαπλές στρατηγικές αλληλουχίας διαθέσιμες για διαφορετικούς ερευνητικούς στόχους
● Εξαιρετική εμπειρία στη συναρμολόγηση γονιδιώματος μυκήτων με πάνω από 10.000 συναρμολογημένο γονιδίωμα πλήρους πενών.
● Επαγγελματική ομάδα τεχνικής υποστήριξης μετά την πώληση που εκπληρώνει πιο συγκεκριμένες ερευνητικές ανάγκες.
Προδιαγραφές Υπηρεσίας
| Υπηρεσία | Στρατηγική Αλληλουχίας | Εγγυημένη ποιότητα | Εκτιμώμενος χρόνος περιστροφής |
| Μυκητιακός λεπτός χάρτης | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 εργάσιμες ημέρες |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Χάρτης μύκητα-πλήρης πενών | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Αναλογία αγκύρωσης χρωμοσωμάτων >90% | 45 εργάσιμες ημέρες |
Βιοπληροφορικές αναλύσεις
● Έλεγχος ποιότητας ακατέργαστων δεδομένων
● Συναρμολόγηση γονιδιώματος
● Ανάλυση συστατικών γονιδιώματος
● Σχολιασμός συνάρτησης γονιδίου
● Συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση
Απαιτήσεις δειγμάτων και παράδοση
Απαιτήσεις δειγμάτων:
ΓιαΕκχυλίσματα DNA:
| Τύπος δείγματος | Ποσό | Συγκέντρωση | Καθαρότητα |
| Εκχυλίσματα DNA | ＞ 1,2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Για δείγματα ιστού:
| Τύπος δείγματος | Συνιστώμενη επεξεργασία δείγματος | Αποθήκευση και αποστολή δειγμάτων |
| Μονοκύτταρος Μύκητας | Παρατηρήστε τη μαγιά στο μικροσκόπιο και συλλέξτε την στην εκθετική της φάση Μεταφέρετε την καλλιέργεια (που περιέχει περίπου 3-4,5e9 κύτταρα) σε eppendorf 1,5 ή 2 ml.(Διατηρήστε τον πάγο) Φυγοκεντρήστε το σωληνάριο για 1 λεπτό στα 14000 g για να συλλέξετε βακτήρια και να αφαιρέσετε προσεκτικά το υπερκείμενο Σφραγίστε το σωληνάριο και παγώστε τα βακτήρια σε υγρό άζωτο για τουλάχιστον 1-3 ώρες.Αποθηκεύστε το σωληνάριο στο ψυγείο -80 ℃. | Καταψύξτε τα δείγματα σε υγρό άζωτο για 3-4 ώρες και αποθηκεύστε σε υγρό άζωτο ή -80 βαθμούς έως μακροχρόνια κράτηση.Απαιτείται αποστολή δειγμάτων με ξηρό πάγο. |
| Μακρο Μύκητας | Συνιστάται ο ιστός σε φάση ενεργού ανάπτυξης. Ξεπλύνετε τον ιστό με νερό χωρίς ενδοτοξίνες και μετά 70% αιθονικό. Αποθηκεύστε το δείγμα σε κρυοσωλήνες. |
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Παράδοση δειγμάτων
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
1.Διάγραμμα Circos σε γονιδιωματικά συστατικά μυκήτων
2. Συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση: Φυλογενετικό δέντρο
