Με τρεις πιθανές επιλογές για να διαλέξετε ανάλογα με τον επιθυμητό βαθμό πληρότητας γονιδιώματος:
● Πρόχειρη επιλογή γονιδιώματος: Σύντομη ανάγνωση αλληλουχίας με Illumina NovaSeq PE150.
● Επιλογή Fungal Fine Genome:
Genome Survey: Illumina NovaSeq PE150.
Συγκρότημα γονιδιώματος: PacBio Revio (διαβάζει HiFi) ή Nanopore PromethION 48.
● Μυκητιακό γονιδίωμα σε επίπεδο χρωμοσώματος:
Genome Survey: Illumina NovaSeq PE150.
Συγκρότημα γονιδιώματος: PacBio Revio (διαβάζει HiFi) ή Nanopore PromethION 48.
Συνεχίστε την αγκύρωση με συγκρότημα Hi-C.
●Διαθέσιμες στρατηγικές πολλαπλής αλληλουχίας: Για διαφορετικούς ερευνητικούς στόχους και απαιτήσεις πληρότητας γονιδιώματος
●Πλήρης ροή εργασιών Βιοπληροφορικής:Αυτό περιλαμβάνει τη συναρμολόγηση γονιδιώματος και την πρόβλεψη πολλαπλών γονιδιωματικών στοιχείων, τον σχολιασμό λειτουργικών γονιδίων και τη συνεχή αγκύρωση.
●Εκτεταμένη Τεχνογνωσία: Με περισσότερα από 12.000 μικροβιακά γονιδιώματα συγκεντρωμένα, φέρνουμε πάνω από μια δεκαετία εμπειρίας, μια ομάδα ανάλυσης υψηλής εξειδίκευσης, ολοκληρωμένο περιεχόμενο και εξαιρετική υποστήριξη μετά την πώληση.
●Υποστήριξη μετά την πώληση:Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με περίοδο εξυπηρέτησης μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση έργου, βοήθεια για την αντιμετώπιση προβλημάτων και συνεδρίες Q&A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτημάτων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα.
Υπηρεσία | Στρατηγική Αλληλουχίας | Ποιοτικός έλεγχος |
Σχέδιο Γονιδιώματος | Illumina PE150 100x | Q30≥85% |
Λεπτό γονιδίωμα | Έρευνα γονιδιώματος: Illumina PE150 50 x Συναρμολόγηση: PacBio HiFi 30x ή Nanopore 100x | contig N50 ≥1Mb (Pacbio Unicellular) contig N50 ≥2Mb (ONT Unicellular) contig N50 ≥500kb (Άλλα) |
Γονιδίωμα σε επίπεδο χρωμοσώματος | Έρευνα γονιδιώματος: Illumina PE150 50 x Συναρμολόγηση: PacBio HiFi 30x ή Nanopore 100x Συγκρότημα Hi-C 100x | Συνεχής αναλογία αγκύρωσης>90%
|
Συγκέντρωση (ng/µL) | Συνολική ποσότητα (μg) | Όγκος (μL) | OD260/280 | OD260/230 | |
PacBio | ≥20 | ≥2 | ≥20 | 1,7-2,2 | ≥1,6 |
Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1,7-2,2 | 1,0-3,0 |
Illumina | ≥1 | ≥0,06 | ≥20 | - | - |
Μονοκύτταρος μύκητας: ≥3,5x1010 κύτταρα
Μακρομύκητας: ≥10 γρ
Περιλαμβάνει την ακόλουθη ανάλυση:
Έρευνα Γονιδιώματος:
Λεπτή συναρμολόγηση γονιδιώματος:
Συνέλευση Hi-C:
Έρευνα γονιδιώματος: κατανομή k-mer
Συγκρότημα γονιδιώματος: γονιδιακός ομόλογος σχολιασμός (βάση δεδομένων NR)
Συγκρότημα γονιδιώματος: σχολιασμός λειτουργικού γονιδίου (GO)
Εξερευνήστε τις εξελίξεις που διευκολύνονται από τις υπηρεσίες συναρμολόγησης γονιδιώματος μυκήτων της BMKGene μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Hao, J. et αϊ. (2023) «Ολοκληρωμένο ωμικό προφίλ του φαρμακευτικού μανιταριού Inonotus obliquus υπό συνθήκες βύθισης»,BMC Genomics, 24(1), σελ. 1–12. doi: 10.1186/S12864-023-09656-Z/FIGURES/3.
Lu, L. et αϊ. (2023) «Η αλληλουχία του γονιδιώματος αποκαλύπτει την εξέλιξη και τους παθογόνους μηχανισμούς του παθογόνου Rhizoctonia cerealis των αιχμηρών οφθαλμών του σίτου»,The Crop Journal, 11(2), σσ. 405–416. doi: 10.1016/J.CJ.2022.07.024.
Zhang, Η. et αϊ. (2023) «Πόροι γονιδιώματος για τέσσερα είδη Clarireedia που προκαλούν κηλίδα δολαρίου σε διάφορα χλοοτάπητα»,Ασθένεια των φυτών, 107(3), σελ. 929–934. doi: 10.1094/ΠΔΙΣ-08-22-1921-Α
Zhang, SS et αϊ. (2023) «Γενετική και μοριακή απόδειξη ενός τετραπολικού συστήματος ζευγαρώματος στο βρώσιμο μανιτάρι Grifola frondosa»,Journal of Fungi, 9(10), σελ. 959. doi: 10.3390/JOF9100959/S1.