Αλληλούχιση Μεταμεταγραφώματος
Χαρακτηριστικά υπηρεσίας
● εξάντληση του rRNA ακολουθούμενη από κατευθυνόμενη προετοιμασία της βιβλιοθήκης mRNA.
● Αλληλούχιση σε Illumina NovaSeq.
Πλεονεκτήματα Υπηρεσίας
●Μελετήστε τις αλλαγές στις σύνθετες μικροβιακές κοινότητες:Αυτό συμβαίνει σε μεταγραφικό επίπεδο και διερευνά πιθανά νέα γονίδια.
●Εξήγηση των αλληλεπιδράσεων της μικροβιακής κοινότητας με τον ξενιστή ή το περιβάλλον.
●Ολοκληρωμένη Βιοπληροφορική ΑνάλυσηΑυτό παρέχει πληροφορίες σχετικά με τις ταξινομικές και λειτουργικές συνθέσεις της κοινότητας, καθώς και την ανάλυση διαφορικής γονιδιακής έκφρασης.
●Εκτεταμένη σχολιασμός γονιδίων:Χρήση ενημερωμένων βάσεων δεδομένων γονιδιακής λειτουργίας για ενημερωτικές πληροφορίες γονιδιακής έκφρασης μικροβιακών κοινοτήτων.
●Υποστήριξη μετά την πώληση:Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με μια περίοδο εξυπηρέτησης μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση του έργου, βοήθεια στην αντιμετώπιση προβλημάτων και συνεδρίες ερωτήσεων και απαντήσεων για να απαντήσουμε σε τυχόν απορίες σχετικά με τα αποτελέσματα.
Προδιαγραφές υπηρεσίας
| Πλατφόρμα αλληλούχισης | Στρατηγική αλληλούχισης | Συνιστώμενα δεδομένα | Έλεγχος Ποιότητας Δεδομένων |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Απαιτήσεις Δείγματος
| Συγκέντρωση (ng/µL) | Συνολική ποσότητα (μg) | Όγκος (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Ροή εργασίας εξυπηρέτησης
Παράδοση δειγμάτων
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλούχιση
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Περιλαμβάνει την ακόλουθη ανάλυση:
● Έλεγχος Ποιότητας Δεδομένων Αλληλουχίας
● Συγκέντρωση Απομαγνητοφώνησης
● Ταξινομική Σχολιασμός και Αφθονία
● Λειτουργική Σχολιασμός και Αφθονία
● Ποσοτικοποίηση Εκφράσεων και Διαφορική Ανάλυση
Ταξινομική κατανομή κάθε δείγματος:
Ανάλυση ποικιλομορφίας Beta: UPGMA
Λειτουργική σχολίαση – GO abundance (αφθονία GO)
Διαφορική ταξινόμηση αφθονίας – LEFSE
Εξερευνήστε τις εξελίξεις που διευκολύνονται από τις υπηρεσίες αλληλούχισης μετα-μεταγραφομικής του BMKGene μέσα από μια επιμελημένη συλλογή δημοσιεύσεων.
Lu, Z. et al. (2023) «Η ανοχή στα οξέα των βακτηρίων της τάξης Bacteroidales που χρησιμοποιούν γαλακτικό οξύ συμβάλλει στην πρόληψη της οξέωσης του στομάχου σε αίγες που έχουν προσαρμοστεί σε δίαιτα υψηλής συγκέντρωσης».Διατροφή των ζώων, 14, σσ. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) «Αποσπίλωση της λειτουργικής μικροχλωρίδας του πυρήνα σε παραδοσιακή ζύμωση στερεάς κατάστασης με αμπλικόνια υψηλής απόδοσης και αλληλούχιση μεταμεταγραφωμικής»,Σύνορα στη Μικροβιολογία, 8 (ΙΟΥΛ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) «Νέοι Μυκοϊοί που Ανακαλύφθηκαν από Μεταμεταγραφωμική Έρευνα του Φυτοπαθογόνου Μύκητα Alternaria»,Ιοί, 14(11), σελ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) «Παράλληλη ανάλυση μεταμεταγραφώματος αποκαλύπτει αποικοδόμηση δευτερογενών μεταβολιτών των φυτών από σκαθάρια και τα έντερα συμβιωτικά τους»,Μοριακός Οικολογία, 31(15), σελ. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
