Αλληλουχία Μεταμεταγραφών
Χαρακτηριστικά υπηρεσίας
● Εξάντληση rRNA ακολουθούμενη από κατευθυντική προετοιμασία βιβλιοθήκης mRNA.
● Αλληλουχία στο Illumina NovaSeq.
Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης
●Μελετήστε τις αλλαγές των σύνθετων μικροβιακών κοινοτήτων:Αυτό συμβαίνει σε μεταγραφικό επίπεδο και εξερευνήστε πιθανά νέα γονίδια.
●Εξήγηση των αλληλεπιδράσεων της μικροβιακής κοινότητας με τον ξενιστή ή το περιβάλλον.
●Ολοκληρωμένη Βιοπληροφορική Ανάλυση: Αυτό παρέχει πληροφορίες σχετικά με τις ταξινομικές και λειτουργικές συνθέσεις της κοινότητας, καθώς και ανάλυση διαφορικής γονιδιακής έκφρασης.
●Εκτενής σχολιασμός γονιδίου:Χρησιμοποιώντας ενημερωμένες βάσεις δεδομένων γονιδιακών λειτουργιών για ενημερωτικές πληροφορίες γονιδιακής έκφρασης μικροβιακών κοινοτήτων.
●Υποστήριξη μετά την πώληση:Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με περίοδο εξυπηρέτησης μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση έργου, βοήθεια για την αντιμετώπιση προβλημάτων και συνεδρίες Q&A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτημάτων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα.
Προδιαγραφές Υπηρεσίας
| Πλατφόρμα αλληλουχίας | Στρατηγική Αλληλουχίας | Συνιστώμενα δεδομένα | Έλεγχος Ποιότητας Δεδομένων |
| Illumina NovaSeq | ΠΕ150 | 12 Gb | Q30≥85% |
Απαιτήσεις δειγμάτων
| Συγκέντρωση (ng/µL) | Συνολική ποσότητα (μg) | Όγκος (μL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Παράδοση δειγμάτων
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Περιλαμβάνει την ακόλουθη ανάλυση:
● Έλεγχος ποιότητας δεδομένων αλληλουχίας
● Συνέλευση μεταγραφής
● Ταξονομικός σχολιασμός και αφθονία
● Λειτουργικός σχολιασμός και αφθονία
● Ποσοτικοποίηση έκφρασης και Διαφορική Ανάλυση
Ταξινομική κατανομή κάθε δείγματος:
Ανάλυση ποικιλομορφίας βήτα: UPGMA
Λειτουργικός σχολιασμός – αφθονία GO
Αφθονία διαφορικής ταξινόμησης – ΛΕΥΣΕ
Εξερευνήστε τις προόδους που διευκολύνονται από τις υπηρεσίες μεταγραφικής αλληλουχίας της BMKGene μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Lu, Z. et αϊ. (2023) «Η ανοχή στα οξέα των βακτηρίων που χρησιμοποιούν γαλακτικό οξύ της τάξης των Bacteroidales συμβάλλει στην πρόληψη της οξέωσης των μηρυκαστικών σε κατσίκες προσαρμοσμένες σε δίαιτα υψηλής συγκέντρωσης»,Διατροφή Ζώων, 14, σσ. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) «Αποκάλυψη της λειτουργικής μικροχλωρίδας του πυρήνα στην παραδοσιακή ζύμωση στερεάς κατάστασης με αμπλικόνια υψηλής απόδοσης και αλληλουχία μετατρανγραφτομικής»,Σύνορα στη Μικροβιολογία, 8 (ΙΟΥΛΙΟΥ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et αϊ. (2022) «Νέοι μυκοϊοί που ανακαλύφθηκαν από μια μετατρανγραφική έρευνα του φυτοπαθογόνου μύκητα Alternaria»,Ιούς, 14(11), σελ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et αϊ. (2022) «Η παράλληλη ανάλυση μεταμεταγραφών αποκαλύπτει την αποικοδόμηση των δευτερογενών μεταβολιτών των φυτών από τα σκαθάρια και τα εντερικά τους συμβιώματα»,Μοριακός Οικολογία, 31(15), σελ. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
