Illumina antaŭfaritaj bibliotekoj
Trajtoj
●Platformoj:Illumina NovaSeq 6000 kaj NovaSeq X Plus
●Sekvencaj reĝimoj:PE150 kaj PE250
●Kvalitkontrolo de bibliotekoj antaŭ sekvencado
●Sekvencdatuma kvalitkontrolo kaj liverado:livero de kvalitkontrola raporto kaj krudaj datumoj en fastq-formato post demultipleksado kaj filtrado de Q30-legadoj
Servaj Avantaĝoj
●Ĉiuflankeco de Sekvencaj servoj:la kliento povas elekti sekvenci laŭ leno, fluoĉelo, aŭ laŭ kvanto de bezonataj datumoj (parta lena sekvencado).
●Vasta sperto pri la sekvenca platformo Illumina:kun miloj da finitaj projektoj kun diversaj specioj.
●Livero de sekvenciga kvalitkontrola raporto:kun kvalitmetrikoj, datenprecizeco kaj ĝenerala elfaro de la sekvenca projekto.
●Matura sekvenca procezo:kun mallonga livertempo.
●Rigora Kvalitkontroloni efektivigas striktajn postulojn pri kvalitkontrolo por garantii la liveradon de konstante altkvalitaj rezultoj.
Specimenaj Platformoj
| Platformo | Flua Ĉelo | Sekvenca reĝimo | Unuo | Laŭtaksa produktaĵo |
| NovaSeq X | 10B (8 lenoj) | PE150 | Ununura Leno Parta Leno | 375Gb / Leno |
| 25B (8 lenoj) | PE150 | Ununura Leno Parta Leno | 1000 Gb/Leno | |
| NovaSeq 6000 | SP-fluoĉelo (2 lenoj) | PE250 | Flua Ĉelo Ununura Leno Parta Leno | 325-400 M legaĵoj / Leno |
| S4 Fluĉelo (4 lenoj) | PE150 | Flua Ĉelo Ununura Leno Parta Leno | ~800 Gb / Leno |
Specimenaj Postuloj
| Datuma Kvanto (X) | Koncentriĝo (qPCR/nM) | Volumeno | |
| Parta Lena Sekvencado
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Lena Sekvencado | Po Leno | ≥ 1.5 nM / Biblioteka naĝejo | ≥ 25 μl / Biblioteka naĝejo |
Aldone al koncentriĝo kaj totala kvanto, ankaŭ taŭga pinta padrono estas necesa.
Noto: Lena sekvencado de malalt-diversecaj bibliotekoj postulas PhiX-pikilon por certigi fortikan bazvokon.
Ni rekomendas sendi antaŭkunigitajn bibliotekojn kiel specimenojn. Se vi bezonas, ke BMKGENE plenumu bibliotekkunigadon, bonvolu rilati al
la bibliotekaj postuloj por parta lena sekvencado.
Biblioteka Grandeco (Pinta mapo)
La ĉefa pinto devus esti inter 300-450 bp.
Bibliotekoj devus havi ununuran ĉefan pinton, neniun adaptilpoluadon kaj neniujn enkondukajn dimerojn.
Bonvolu kontakti nin se viaj specimenoj ne plenumas la postulojn pri la komenca materialo.
Servolaborfluo
Biblioteka kvalito-kontrolo
Sekvencado
Kontrolo de datumoj pri kvalito
Projekta liverado
Biblioteka kvalitkontrola raporto
Raporto pri la kvalito de la biblioteko estas provizita antaŭ sekvencado, taksado de la biblioteka kvanto kaj fragmentiĝo.
Sekvenca QC-raporto
Tabelo 1. Statistikoj pri sekvencaj datumoj.
| Specimena ID | BMKID | Krudaj legaĵoj | Krudaj Datumoj (bp) | Puraj legaĵoj (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figuro 1. Kvalitdistribuo laŭ legaĵoj en ĉiu specimeno
Figuro 2. Distribuo de baza enhavo
Figuro 3. Distribuo de legita enhavo en sekvencaj datumoj
