●Platformoj:Illumina Novaseq 6000 kaj Novaseq X Plus
●Sekvencaj Modoj:PE150 kaj PE250
●Kvalita kontrolo de bibliotekoj antaŭ sinsekvo
●Sekvencaj Datumoj QC kaj Transdono:Transdono de QC -raporto kaj krudaj datumoj en FASTQ -formato post demultiplekso kaj filtrado de Q30 legas
●Versatileco de sekvencaj servoj:La kliento povas elekti sekvenci per strateto, fluo -ĉelo, aŭ per kvanto da datumoj postulataj (parta sekvenco de stratoj).
●Vasta sperto pri Illumina Sekvenca Platformo:kun miloj da fermitaj projektoj kun diversaj specioj.
●Liverado de Sekvenca QC -Raporto:kun kvalitaj metrikoj, datuma precizeco kaj entuta agado de la sekvenca projekto.
●Matura sekvenca procezo:kun mallonga turnotempo.
●Rigora kvalitkontrolo: Ni efektivigas striktajn QC-postulojn por garantii liveradon de konstante altkvalitaj rezultoj.
Platformo | Flua ĉelo | Sekvenca reĝimo | Unuo | Estimata eligo |
Novaseq x | 10B (8 stratoj) | PE150 | Ununura strateto Parta strateto | 375GB / Lane |
25b (8 stratoj) | PE150 | Ununura strateto Parta strateto | 1000 GB/Lane | |
Novaseq 6000 | SP -flua ĉelo (2 stratoj) | PE250 | Flua ĉelo Ununura strateto Parta strateto | 325-400 m Legas / Lane |
S4 -flua ĉelo (4 stratoj) | PE150 | Flua ĉelo Ununura strateto Parta strateto | ~ 800 GB / Lane |
Datuma Kvanto (x) | Koncentriĝo (qPCR/nm) | Volumo | |
Parta Lane Sekvenco
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 µl |
10 Gb <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 µl | |
50 Gb <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 µl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 µl | |
Lane Sekvencado | Po strateto | ≥ 1,5 nm / biblioteka naĝejo | ≥ 25 µl / biblioteka naĝejo |
Krom koncentriĝo kaj totala kvanto, taŭga pinta ŝablono ankaŭ estas bezonata.
Noto: Lane-sekvenco de malaltaj diversecaj bibliotekoj postulas Phix Spike-In por certigi fortikan bazon.
Ni rekomendas sendi antaŭ-kolorajn bibliotekojn kiel specimenojn. Se vi postulas, ke BMKGENE plenumu bibliotekan amasiĝon, bonvolu raporti
La bibliotekaj postuloj por parta strato -sekvenco.
Ĉefa pinto estu ene de 300-450 bp.
Bibliotekoj devas havi ununuran ĉefan pinton, neniun adaptan poluadon kaj neniujn printempajn dimerojn.
Raporto pri la kvalito de la biblioteko estas provizita antaŭ sekvenco, taksi bibliotekan sumon kaj fragmentadon.
Tabelo 1. Statistikoj pri sekvencaj datumoj.
Specimena ID | Bmkid | Krudaj legaĵoj | Krudaj datumoj (BP) | Puraj Legaĵoj (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figuro 1. Kvalita distribuo laŭ legaĵoj en ĉiu specimeno
Figuro 2. Baza enhavo -distribuo
Figuro 3. Distribuo de legataj enhavoj en sekvencaj datumoj