Ensaluti al BMKCloud

Produktoj

DNA/RNA Sekvencado - Nanopora Sekvencigilo

ONT-sekvencado estas teknologio por sekvencado de unuopa molekula realtempa elektra signalo bazita sur nanoporoj. La sekvencada principo de ĉiu platformo estas la sama. Duobla-fadena DNA/RNA ligiĝas al nanopora proteino enigita en la biofilmo kaj malvolviĝas sub la kondukilo de motora proteino. Sub la ago de tensiodiferenco de ambaŭ flankoj de la biofilmo, DNA/RNA-fadenoj trairas la nanopora kanalo de la proteino kun certa rapideco. Pro la diferencoj en la kemiaj ecoj de la malsamaj bazoj sur la DNA/RNA-fadeno, kiam unuopa bazo aŭ DNA-molekulo trairas la nanopora kanalo, ĝi kaŭzas ŝanĝon de malsamaj elektraj signaloj. Detektante kaj respondante al ĉi tiuj signaloj, la respondaj baztipoj povas esti kalkulitaj, kaj la realtempa detekto de la sekvenco povas esti kompletigita.

Kontaktu nin

Servaj Detaloj

Demonstraĵa Rezulto

Servaj Detaloj Trajtoj

Platformo	Biblioteka Grandeco	Teoria Datuma Rendimento (Po Ĉelo)	Unu-baza Precizeco	Aplikoj
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralonga, cDNA-PCR	70-90Gb/Ĉelo	85-92%	SV-voko, De novo, Plenlonga sekvencado, Iso-Seq, Gena prinotado, Detekto de DNA-metiligo

Servaj Avantaĝoj

● Pli ol 5-jara sperto pri la sekvenca platformo PacBio kun miloj da finitaj projektoj kun diversaj specioj.
● BMKGENE estas oficiala partnero de Oxford Nanopore, kun duobla-platforma RNA/DNA-atestilo.
● Ekzistas ĉefaj modeloj de sekvenciloj kun kompleta ekipaĵo kaj sufiĉa sekvenca trairo.
● Surbaze de la platformo Nanopore, pli ol 10 esploroj pri bestoj kaj plantoj de Denovo estis publikigitaj en internacie famaj revuoj.

Specimenaj Postuloj

Specimena Tipo

Kvanto

Koncentrtion (Kubito ®)

Volumeno

Pureco

Aliaj

Genara DNA

Dependi de Datuma Postulo

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Klara pinto je 260 nm, neniuj poluadoj

Koncentriĝo devas esti mezurata per Kvbito kaj Kvbito/Nanoporo ≤ 2

Totala RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0.5-2.5; neniuj poluadoj

RIN-valoro ≥7.5

Servolaborfluo

Specimena preparo

Biblioteka konstruado

Sekvencado

Analizo de datumoj

Projekta liverado

Antaŭa: Illumina antaŭfaritaj bibliotekoj

Sekva: Specife-Lokusa Plifortigita Fragmenta Sekvencado (SLAF-Seq)

Takso de la Kvalito de Datumoj pri DNA-Specimeno

Tabelo 1. Statistikoj pri puraj datumoj.

BMKID	krudaSekvencnumero	krudaSumaBazo	puraSeqNum	puraSumaBazo	puraN50Len	puraN90Len	puraMeanLen	puraMaxLen	puraMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9