Longa Ne-koda Sekvencado-Illumina
Servaj Avantaĝoj
●Komuna analizo de mRNA kaj lncRNA: kombinante la kvantigon de mRNA-transskribaĵoj kun la studo de lncRNA kaj iliaj celoj, estas eble ricevi profundan superrigardon de la reguliga mekanismo subesta la ĉela respondo.
●Vasta Sperto: Nia teamo alportas abundon da sperto al ĉiu projekto, kun rekordo pri prilaborado de pli ol 23,000 specimenoj ĉe BMK ampleksanta diversajn specimenspecojn kaj lncRNA-projektojn.
●Rigora Kvalita Kontrolo: Ni efektivigas kernajn kontrolpunktojn tra ĉiuj stadioj, de specimena kaj biblioteka preparo ĝis sekvencado kaj bioinformadiko. Ĉi tiu zorgema monitorado certigas la liveron de konstante altkvalitaj rezultoj.
●Postvenda Subteno: Nia devontigo etendiĝas preter la kompletiĝo de la projekto kun 3-monata post-venda servoperiodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas projektan sekvadon, helpon pri solvo de problemoj kaj sesiojn pri demandoj kaj respondoj por trakti demandojn rilate al la rezultoj.
Specimenaj Postuloj kaj Livero
| Biblioteko | Platformo | Rekomenditaj datumoj | Datumoj QC |
| rRNA elĉerpita direkta biblioteko | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidoj:
| Konk. (ng/μl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
● Plantoj:
Radiko, Tigo aŭ Petalo: 450 mg
Folio aŭ Semo: 300 mg
Frukto: 1,2 g
● Besto:
Koro aŭ Intesto: 450 mg
Intestoj aŭ Cerbo: 240 mg
Muskolo: 600 mg
Ostoj, Haro aŭ Haŭto: 1,5 g
● Artropodoj:
Insektoj: 9 g
Krustacoj: 450 mg
● Tuta sango:2 tuboj
● Ĉeloj: 106 ĉeloj
● Serumo kaj Plasmo: 6 ml
Rekomendita Specimena Livero
Ujo: 2 ml centrifuga tubo (Stana folio ne rekomendas)
Ekzempla etikedado: Grupo+replikato ekz. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sendado:
1. Seka glacio: Specimenoj devas esti pakitaj en sakoj kaj enterigitaj en seka glacio.
2. RNAstable-tuboj: RNA-provaĵoj povas esti sekigitaj en RNA-stabiliga tubo (ekz. RNAstable®) kaj senditaj en ĉambra temperaturo.
Serva Laborfluo
Eksperimenta dezajno
Specimena livero
RNA-eltiro
Biblioteka konstruado
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
Bioinformadiko
Analizo de Differential Gene Expression (DEGoj).
Kvantigo de lncRNA-esprimo - amasiĝo
Riĉigo de lncRNA-celgenoj
Komuna mRNA kaj lncRNA-pozicia analizo - Circos-intrigo (meza cirklo estas mRNA kaj interna cirklo estas lncRNA)
Esploru la progresojn faciligitaj de la lncRNA-sekvencaj servoj de BMKGene per vikariita kolekto de publikaĵoj.
Ji, H. et al. (2020) 'Identigo, funkcia antaŭdiro kaj ŝlosila lncRNA-konfirmo de malvarmaj stres-rilataj lncRNA-oj en rataj hepatoj', Sciencaj Raportoj 2020 10:1, 10 (1), pp 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Integrative Transcriptomic Analysis Reveals the Imune Mechanism for a CyHV-3-Resistant Common Carp Strain', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization of Cometing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Genetika dissekcio de la gena kunesprimreto suba fotosintezo en Populus', Plant Biotechnology Journal, 18 (4), pp 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'A Global Regulatory Network for Disregulated Gene Expression and Abnormal Metabolic Signaling in Imune Cells in the Microenvironment of Graves' Disease and Hashimoto's Thyroiditis', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
