● RRNA -elfluado sekvita de direkta mRNA -biblioteka preparo.
● Sekvenco pri Illumina Novaseq.
●Studu la ŝanĝojn de kompleksaj mikrobaj komunumoj:Ĉi tio okazas ĉe la transkripta nivelo kaj esploras eblajn novajn genojn.
●Klarigante mikrobajn komunumajn interagojn kun la gastiganto aŭ medio.
●Kompleta bioinformata analizo: Ĉi tio donas komprenojn pri komunumaj taksonomiaj kaj funkciaj komponaĵoj, same kiel diferenca gena esprimo -analizo.
●Vasta gena komentario:Uzante ĝisdatigitajn genajn funkciajn datumbazojn por informaj genaj esprimaj informoj de mikrobaj komunumoj.
●Post-venda subteno:Nia devontigo etendas preter projekt-kompletigo kun 3-monata post-venda servo-periodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas sekvadon de projektoj, problemojn pri helpo, kaj Q & A-sesioj por trakti iujn ajn demandojn rilatajn al la rezultoj.
Sekvenca platformo | Sekvenca Strategio | Datumoj Rekomenditaj | Kontrolo de Datumoj pri Kvalito |
Illumina novaseq | PE150 | 12GB | Q30≥85% |
Koncentriĝo (ng/µL) | Tuta kvanto (µg) | Volumo (µL) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Inkluzivas la jenan analizon:
● Sekvencado de datumkvalita kontrolo
● Transskriba Asembleo
● Taksonomia komentario kaj abundo
● Funkcia komentario kaj abundo
● Esprima kvantigo kaj diferenca analizo
Taksonomia distribuo de ĉiu specimeno:
Beta -diversa analizo: UPGMA
Funkcia komentario - Iru abunde
Diferenca Taksonomio -Abundo - LEFSE
Esploru la progresojn faciligitajn de la meta -transkriptomaj sekvencaj servoj de BMKGENE per komisiita kolekto de publikaĵoj.
Lu, Z. et al. (2023) 'Acida toleremo de lakte-utiligaj bakterioj de la ordo Bacteroidales kontribuas al antaŭzorgo de rumina acidozo en kaproj adaptitaj al alta koncentriĝa dieto',Besta nutrado, 14, pp 130-140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Kanto, Z. et al. (2017) 'Malkaŝanta kerna funkcia mikrobiota en tradicia solid-ŝtata fermentado per alt-trafa amplikonoj kaj metatranscriptomics sekvencado',Limoj en mikrobiologio, 8 (jul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/plena.
Wang, W. et al. (2022) 'Novaj micovirusoj malkovritaj de Metatranscriptomics -enketo de la fitopatogenaj alternaj fungoj',Virusoj, 14 (11), p. 2552. DOI: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Paralela metatranscriptoma analizo malkaŝas degeneron de plantaj malĉefaj metabolitoj per skaraboj kaj iliaj intestaj simbiontoj',Molekula Ekologio, 31 (15), pp 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.