mRNA-sekvenco (NGS) - De novo

mRNA-sekvencado permesas profiladon de ĉiuj mRNA-transskribaĵoj en ĉeloj sub specifaj kondiĉoj kaj estas vaste uzata teknologio en diversaj esplorkampoj. La BMKCloud De novo mRNA-sekvenca duktosistemo estas desegnita por analizi poli-A-riĉigitajn sekvencajn bibliotekojn kiam neniu referenca genaro estas havebla. La duktosistemo komenciĝas per kvalito-kontrolo, sekvata dede novotransskribaĵa kunmeto kaj unigena aro-selektado. La unigena strukturanalizo antaŭdiras kodan sekvencon (CDS) kaj simplajn sekvencripetojn (SSR). Poste, la diferenciga esprima analizo trovas diferencige esprimitajn genojn (DEG-ojn) inter la testitaj kondiĉoj, sekvata de funkcia prinotado kaj riĉigo de DEG-oj por ĉerpi biologiajn komprenojn.