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Transcriptoma espacial BMKMANU S1000

La organización espacial de las células desempeña un papel vital en diversos procesos biológicos, como la infiltración inmune, el desarrollo embrionario, etc. La secuenciación espacial del transcriptoma, que indica el perfil de expresión genética al tiempo que retiene información de la posición espacial, ha proporcionado grandes conocimientos sobre la arquitectura tisular a nivel del transcriptoma.Con el desarrollo de la tecnología, es necesario estudiar con mayor resolución la morfología del tejido ultraclara y la diferencia estructural real de la expresión molecular espacial.BMKGENE proporciona un servicio integral e integral de secuenciación de transcriptomas espaciales, desde muestras hasta conocimientos biológicos.

Las tecnologías de transcriptómica espacial potenciaron perspectivas novedosas en diversos ámbitos de investigación al resolver el perfil de expresión genética con contenido espacial en muestras heterogéneas.

Chip transcriptoma espacial: BMKMANU S1000

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq

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Detalles del servicio

Bioinformática

Resultados de la demostración

Esquema técnico del transcriptoma espacial BMKMANU S1000

Ventajas de BMKMANU S1000

1) Resolución subcelular: cada área de captura contenía >2 millones de puntos espaciales con códigos de barras con un diámetro de 2,5 µm y un espacio de 5 µm entre los centros de los puntos, lo que permite el análisis del transcriptoma espacial con resolución subcelular (5 µm).

2) Análisis de resolución multinivel: análisis flexible de varios niveles que va desde 100 μm a 5 μm para resolver diversas características del tejido con una resolución óptima.

3) Perfiles completos del transcriptoma: las transcripciones capturadas de todo el portaobjetos de tejido se pueden analizar, sin restricción en el número de genes diana y el área objetivo.

Especificaciones de servicio

Biblioteca	Estrategia de secuenciación	Salida de datos recomendada
Biblioteca de ADNc S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60 Gb/muestra

Requisitos de muestra

Muestra	Número	Tamaño	Calidad del ARN
Bloque de tejido incluido en OCT	2-3 bloques/muestra	Aprox.6,8x6,8x6,8mm³	RIN≥7

Para obtener más detalles sobre la guía de preparación de muestras y el flujo de trabajo del servicio, no dude en hablar con unExperto en BMKGENE

Flujo de trabajo del servicio

Diseño de experimentos

Entrega de muestra

Pre-experimento

Código de barras espacial

construcción de biblioteca

Secuenciación

Análisis de los datos

Servicios postventa

Anterior: Transcriptoma espacial 10x Genomics Visium

Próximo: Secuenciación del genoma completo de plantas/animales

Los datos generados por BMKMANU S1000 se analizan utilizando el software "BSTMatrix", diseñado de forma independiente por BMKGENE, que incluye:

1) Generación de matriz de expresión genética.
2) Procesamiento de imágenes HE
3) Compatible con software de terceros para análisis
4) El “BSTViewer” en línea ayuda a obtener resultados de visualización en diferentes resoluciones.

1.Agrupación puntual

s1000 (4)