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Productos

Secuenciación por inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)

La inmunoprecipitación de cromatina (CHIP) es una técnica que utiliza anticuerpos para enriquecer selectivamente las proteínas de unión al ADN y sus correspondientes dianas genómicas. Su integración con la secuenciación de nueva generación (NGS) permite el análisis genómico de las dianas de ADN asociadas a la modificación de histonas, factores de transcripción y otras proteínas de unión al ADN. Este enfoque dinámico permite comparar los sitios de unión en diversos tipos celulares, tejidos o condiciones. Las aplicaciones de ChIP-Seq abarcan desde el estudio de la regulación transcripcional y las vías de desarrollo hasta la elucidación de los mecanismos de las enfermedades, lo que la convierte en una herramienta indispensable para comprender los paisajes de regulación genómica y avanzar en el desarrollo de terapias.

Plataforma: Illumina NovaSeq


Detalles del servicio

Bioinformática

Resultados de la demostración

Ventajas del servicio

Análisis bioinformático avanzado y anotación exhaustiva:Utilizamos múltiples bases de datos para anotar funcionalmente los genes asociados con regiones de unión proteína-ADN, lo que proporciona información sobre los procesos celulares y moleculares que subyacen a la interacción.

Soporte postventa:Nuestro compromiso va más allá de la finalización del proyecto, con un período de servicio posventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para aclarar cualquier duda relacionada con los resultados.

Amplia experiencia:Con una trayectoria comprobada de éxito en numerosos proyectos de ChIP-Seq, nuestra empresa aporta más de una década de experiencia. Nuestro equipo de análisis altamente cualificado, junto con un contenido integral y un servicio de atención al cliente posventa, garantiza el éxito de sus proyectos.

● Control de calidad rigurosoImplementamos puntos de control esenciales en todas las etapas, desde la preparación de muestras y bibliotecas hasta la secuenciación y el análisis bioinformático. Este monitoreo meticuloso garantiza la obtención de resultados de alta calidad de forma constante.

Especificaciones de servicio

Biblioteca

Estrategia de secuenciación

Salida de datos recomendada

Control de calidad

ADN purificado tras inmunoprecipitación

Illumina PE150

10 GB

Q30≥85%

Requisitos de muestra

Cantidad total: ≥10 ng

Distribución del tamaño de los fragmentos: 100-750 pb

Flujo de trabajo del servicio

entrega de muestras

Entrega de muestras

Preparación de la biblioteca

Construcción de bibliotecas

Secuenciación

Secuenciación

Análisis de datos

Análisis de datos

Servicios postventa

Servicios posventa


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    Incluye el siguiente análisis:

    ● Control de calidad de datos brutos

    ● Detección de picos basada en el mapeo al genoma de referencia

    ● Anotación de genes asociados a picos

    ● Análisis de motivos: identificación de sitios de unión de factores de transcripción (TFBS)

    ● Análisis y anotación de picos diferenciales

    Evaluación del enriquecimiento cerca de los sitios de inicio de la transcripción (TSS)

     

    foto 92

     

    Distribución genómica de los picos de CHIP

    foto 93

     

    Clasificación de las regiones de picos

    foto 94

    Enriquecimiento funcional de genes relacionados con picos (KEGG)

    foto 95

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