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Productos

Illumina y BGI

La tecnología de secuenciación de Illumina, basada en Sequencing by Synthesis (SBS), es una innovación NGS adoptada a nivel mundial, responsable de generar más del 90 % de los datos de secuenciación del mundo.El principio de SBS implica obtener imágenes de terminadores reversibles marcados con fluorescencia a medida que se agrega cada dNTP y posteriormente se escinde para permitir la incorporación de la siguiente base.Con los cuatro dNTP unidos a un terminador reversible presentes en cada ciclo de secuenciación, la competencia natural minimiza el sesgo de incorporación.Esta tecnología versátil admite bibliotecas de lectura única y de pares, y se adapta a una variedad de aplicaciones genómicas.Las capacidades de alto rendimiento y la precisión de la secuenciación de Illumina la posicionan como una piedra angular en la investigación genómica, lo que permite a los científicos desentrañar las complejidades de los genomas con un detalle y una eficiencia inigualables.

DNBSEQ, desarrollada por BGI, es otra tecnología NGS innovadora que ha logrado reducir aún más los costos de secuenciación y aumentar el rendimiento.La preparación de bibliotecas DNBSEQ implica la fragmentación del ADN, la preparación de ssDNA y la amplificación por círculo rodante para obtener nanobolas de ADN (DNB).Luego se cargan sobre una superficie sólida y posteriormente se secuencian mediante síntesis combinatoria sonda-ancla (cPAS).

Nuestro servicio de secuenciación de bibliotecas prefabricadas facilita a los clientes la preparación de sus bibliotecas de secuenciación a partir de diversas fuentes (ARNm, genoma completo, amplicones, entre otros).Posteriormente, estas bibliotecas se pueden enviar a nuestros centros de secuenciación para control de calidad y secuenciación en plataformas Illumina o BGI.


Detalles del servicio

Resultado de la demostración

Características

Plataformas:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten y BGI-DNB-T7

Modos de secuenciación:PE50, PE100, PE150, PE250

Control de calidad de bibliotecas antes de la secuenciación.

Entrega de datos de secuenciación y control de calidad:entrega de informes de control de calidad y datos sin procesar en formato fastq después de demultiplexar y filtrar lecturas Q30.

 

Ventajas del servicio

Versatilidad de los servicios de secuenciación:el cliente puede optar por secuenciar por carril, celda de flujo o cantidad de datos.

Versatilidad de plataformas:Las bibliotecas DNB se pueden transferir a plataformas Illumina

Amplia experiencia en plataforma de secuenciación Illumina:con miles de proyectos cerrados con diversas especies. 

Entrega del informe de control de calidad de secuenciación:con métricas de calidad, precisión de los datos y rendimiento general del proyecto de secuenciación.

Proceso de secuenciación maduro:con un corto tiempo de respuesta.

Control de calidad riguroso: implementamos estrictos requisitos de control de calidad para garantizar la entrega de resultados consistentes de alta calidad.

Requisitos de muestra*

Secuenciación de carriles parciales

Cantidad de datos (X)

Concentración (qPCR/nM)

Volumen

X ≤ 50 GB

≥ 2 nM

≥ 20 µl

50 GB ≤ X < 100 GB

≥ 3 nM

≥ 20 µl

X ≥ 100 GB

≥ 4 nM

≥ 20 µl

Carril único (Illumina)

Plataforma

Concentración (qPCR/nM)

Volumen

HiSeq X Diez

≥ 2 nM

≥ 20 µl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 µl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

NovaSeqX

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 µl

 Además de la concentración y la cantidad total, también se requiere un patrón de picos adecuado.

 

Comuníquese con nosotros si sus muestras no cumplen con los requisitos del material de partida.

Flujo de trabajo del servicio

preparación de la muestra

control de calidad de la biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análisis de los datos

Control de calidad de datos

Control de calidad de muestra

Entrega del proyecto


  • Anterior:
  • Próximo:

  • Informe de control de calidad de la biblioteca

    Se proporciona un informe sobre la calidad de la biblioteca antes de la secuenciación, la evaluación de la cantidad y la fragmentación de la biblioteca.

     

    Informe de control de calidad de secuenciación

     

    Tabla 1. Estadísticas sobre datos de secuenciación.

    ejemplo de identificacion

    BMKID

    Lecturas crudas

    Datos brutos (pb)

    Lecturas limpias (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    CG(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figura 1. Distribución de calidad a lo largo de lecturas en cada muestra

    A9

    Figura 2. Distribución del contenido base

    A10

    Figura 3. Distribución de contenidos leídos en datos de secuenciación.

    A11

     

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