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Productos

Bibliotecas predefinidas de DNBSEQ

DNBSEQ, desarrollada por MGI, es una innovadora tecnología de secuenciación de nueva generación (NGS) que ha logrado reducir aún más los costos de secuenciación y aumentar el rendimiento. La preparación de las bibliotecas DNBSEQ implica la fragmentación del ADN, la preparación de ADN monocatenario (ssDNA) y la amplificación por círculo rodante para obtener las nanobolas de ADN (DNB). Estas se cargan en una superficie sólida y posteriormente se secuencian mediante la síntesis combinatoria de sonda-anclaje (cPAS). La tecnología DNBSEQ combina las ventajas de una baja tasa de error de amplificación con el uso de patrones de error de alta densidad con nanobolas, lo que resulta en una secuenciación con mayor rendimiento y precisión.

Nuestro servicio de secuenciación de bibliotecas prefabricadas permite a los clientes preparar bibliotecas de secuenciación Illumina a partir de diversas fuentes (ARNm, genoma completo, amplicones, bibliotecas 10x, entre otras), que se convierten en bibliotecas MGI en nuestros laboratorios para ser secuenciadas en DNBSEQ-T7, lo que permite obtener grandes cantidades de datos a menor coste.


Detalles del servicio

Resultado de la demostración

Características

●Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7

●Modos de secuenciación:PE150

●Transferencia de bibliotecas de Illumina aMGI:Permite la secuenciación de grandes volúmenes de datos a bajo coste.

●Control de calidad de las bibliotecas antes de la secuenciación.

●Control de calidad y entrega de datos de secuenciación:Entrega del informe de control de calidad y los datos brutos en formato fastq después de la desmultiplexación y el filtrado de las lecturas Q30.

 

Ventajas

●Versatilidad de los servicios de secuenciación:El cliente puede optar por secuenciar por carril o por cantidad de datos.

●Alto nivel de datos:1500 Gb/carril

●Entrega del informe de control de calidad de secuenciación:con métricas de calidad, precisión de los datos y rendimiento general del proyecto de secuenciación.

●Proceso de secuenciación maduro:con un plazo de entrega corto.

●Control de calidad rigurosoImplementamos estrictos requisitos de control de calidad para garantizar la entrega de resultados de alta calidad de forma constante.

 

Requisitos de muestra

 

Cantidad de datos (X)

Concentración (qPCR/nM)

Volumen

Carril parcial

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 GB < X ≤ 100 GB

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 GB

≥ 4 nM

 

Carril único

Por carril

≥ 1,5 nM / grupo de la biblioteca

≥ 25 μl / grupo de la biblioteca

Además de la concentración y la cantidad total, también se requiere un patrón de picos adecuado.

Nota: La secuenciación por carriles de bibliotecas de baja diversidad requiere la adición de PhiX para garantizar una identificación de bases robusta.

Recomendamos enviar bibliotecas preagrupadas como muestras. Si necesita que BMKGENE realice la agrupación de bibliotecas, consulte los requisitos de biblioteca para la secuenciación parcial de carriles.

Tamaño de la biblioteca (Mapa de picos)

El pico principal debería estar entre 300 y 450 pb.

Las bibliotecas deben tener un único pico principal, sin contaminación por adaptadores y sin dímeros de cebadores.

Flujo de trabajo del servicio

preparación de muestras
Secuenciación
Análisis de datos
Control de calidad de muestras

  • Anterior:
  • Próximo:

  • Informe de control de calidad de la biblioteca

    Antes de la secuenciación, se proporciona un informe sobre la calidad de la biblioteca, que evalúa la cantidad de material genético disponible y su fragmentación.

     

    Informe de control de calidad de secuenciación

     

    Tabla 1. Estadísticas sobre datos de secuenciación.

    ID de muestra

    BMKID

    Lecturas sin procesar

    Datos brutos (pb)

    Lecturas limpias (%)

    Q20(%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figura 1. Distribución de la calidad a lo largo de las lecturas en cada muestra.

    A9

    Figura 2. Distribución del contenido base

    A10

    Figura 3. Distribución del contenido de lecturas en los datos de secuenciación.

    A11

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