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Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona perfiles de todo el genoma de objetivos de ADN para la modificación de histonas, factores de transcripción y otras proteínas asociadas al ADN.Combina la selectividad de la inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) para recuperar complejos específicos de proteína y ADN, con el poder de la secuenciación de próxima generación (NGS) para la secuenciación de alto rendimiento del ADN recuperado.Además, debido a que los complejos proteína-ADN se recuperan de las células vivas, los sitios de unión se pueden comparar en diferentes tipos de células y tejidos, o en diferentes condiciones.Las aplicaciones van desde la regulación transcripcional hasta las vías de desarrollo, los mecanismos de la enfermedad y más.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Secuenciación de bisulfitos del genoma completo
La metilación del ADN en la quinta posición de la citosina (5 mC) tiene una influencia fundamental en la expresión génica y la actividad celular.Los patrones de metilación anormales se han asociado con varias condiciones y enfermedades, como el cáncer.WGBS se ha convertido en el estándar de oro para estudiar la metilación de todo el genoma con una resolución de base única.
Plataforma: Illumina NovaSeq6000
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Ensayo de cromatina accesible por transposasa con secuenciación de alto rendimiento (ATAC-seq)
ATAC-seq es un método de secuenciación de alto rendimiento para el análisis de la accesibilidad de la cromatina en todo el genoma, que es importante para el control epigenético global de la expresión génica.Los adaptadores de secuenciación se insertan en regiones de cromatina abierta mediante transposasa Tn5 hiperactiva.Después de la amplificación por PCR, se construye una biblioteca de secuenciación.Todas las regiones de cromatina abierta se pueden obtener bajo una condición de espacio-tiempo específica, no solo limitada a los sitios de unión de un factor de transcripción, o una determinada región modificada por histonas.
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Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
La investigación de la metilación del ADN siempre ha sido un tema candente en la investigación de enfermedades y está estrechamente relacionada con la expresión génica y los rasgos fenotípicos.RRBS es un método preciso, eficiente y económico para la investigación de la metilación del ADN.El enriquecimiento del promotor y las regiones de islas CpG mediante escisión enzimática (Msp I), combinado con la secuenciación con bisulfito, proporciona una detección de metilación del ADN de alta resolución.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
