Secuenciación de ARNm eucariótico-Illumina
Ventajas
ØGran experiencia: se han procesado más de 200 000 muestras en BMK que abarcan diversos tipos de muestras, incluidos cultivos celulares, tejidos, fluidos corporales, etc. y se cerraron más de 7000 proyectos mRNA-Seq que abarcan diversas áreas de investigación.
ØSistema de control de calidad estricto: los puntos de control de calidad básicos en todos los pasos, incluida la preparación de muestras, la preparación de bibliotecas, la secuenciación y la bioinformática, se supervisan de cerca para ofrecer resultados de alta calidad.
ØMúltiples bases de datos disponibles para la anotación de funciones y estudios de enriquecimiento para cumplir diversos objetivos de investigación.
ØServicios postventa: Servicios postventa válidos durante 3 meses tras la finalización del proyecto, incluido el seguimiento del proyecto, resolución de problemas, preguntas y respuestas sobre los resultados, etc.
Requisitos de muestra y entrega
| Biblioteca | estrategia de secuenciación | Datos recomendados | Control de calidad |
| Poli A enriquecido | Ilumina PE150 | 6GB | Q30≥85% |
Requisitos de la muestra:
nucleótidos:
| Pureza | Integridad | Monto |
| DO260/280≥1.7-2.5 DO260/230≥0.5-2.5Se muestra contaminación limitada o nula de proteína o ADN en el gel. | Para plantas: RIN≥6.5;Para animales: RIN≥7;28S/18S≥1.0;elevación de referencia limitada o nula | Conc.≥30 ng/μl;Volumen ≥ 10 μl;Total ≥ 1,5 mcg |
Tejido: Peso (seco):≥1g
*Para tejido de menos de 5 mg, recomendamos enviar una muestra de tejido ultracongelada (en nitrógeno líquido).
Suspensión celular:Recuento de células = 3 × 106- 1×107
*Recomendamos enviar lisado celular congelado.En caso de que el recuento de células sea inferior a 5×105, se recomienda la congelación instantánea en nitrógeno líquido, que es preferible para la microextracción.
Muestras de sangre:Volumen≥1ml
Microorganismo:Masa ≥ 1 g
Entrega de muestra recomendada
Envase: tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda papel de aluminio)
Etiquetado de muestras: Grupo+réplica, por ejemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Envío:
- Hielo seco: Las muestras deben envasarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
- Tubos RNAstable: las muestras de RNA pueden secarse en un tubo de estabilización de RNA (p. ej., RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.
Flujo de trabajo de servicio
Diseño de experimentos
Entrega de muestra
extracción de ARN
Construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de los datos
Servicios postventa
Bioinformática
eucariota Flujo de trabajo de análisis de secuenciación de ARNm
Bioinformática
ØControl de calidad de datos sin procesar
ØAlineación del genoma de referencia
ØAnálisis de la estructura de la transcripción
ØCuantificación de expresión
ØAnálisis de expresión diferencial
ØAnotación y enriquecimiento de funciones
1.Curva de saturación de datos de ARNm
2.Análisis de expresión diferencial-Gráfica de volcán
3.Anotación KEGG en DEG
4.Clasificación GO en DEG
