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Secuenciación de ARNm/ARNnc largo/ARN circular exosómico - Illumina

Los exosomas son pequeñas vesículas secretadas por las células, con un diámetro que suele oscilar entre 30 y 100 nanómetros. Estas vesículas contienen diversos ARN. Se cree que los exosomas desempeñan funciones cruciales en la comunicación intercelular, las respuestas inmunitarias y el desarrollo de enfermedades, y pueden diseminarse a otras partes del cuerpo a través de fluidos corporales como el plasma, la saliva y la orina. Transportan biomoléculas específicas para regular las funciones de las células receptoras, influyendo en sus estados fisiológicos. También se considera que los exosomas desempeñan un papel fundamental en el desarrollo de enfermedades, como el cáncer, las enfermedades neurodegenerativas y las afecciones inflamatorias. La investigación sobre los exosomas ofrece nuevas perspectivas y métodos para el diagnóstico, el tratamiento y la prevención de enfermedades.


Detalles del servicio

Bioinformática

Resultados de la demostración

Características

● Se utilizan sondas especiales para agotar el ADNc ribosomal.

● Construcción de bibliotecas específicas para cada rama.

● Un único flujo de trabajo para obtener datos de ARNm, ARNnc largo y ARN circular simultáneamente.

Ventajas del servicio

● Control de calidad riguroso: Implementamos puntos de control esenciales en todas las etapas, desde la preparación de muestras y bibliotecas hasta la secuenciación y el análisis bioinformático. Este monitoreo meticuloso garantiza la obtención de resultados de alta calidad de forma constante.

● Soporte posventa: Nuestro compromiso va más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio posventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para resolver cualquier duda relacionada con los resultados.

Requisitos y entrega de muestras

Biblioteca

Plataforma

Datos recomendados

Control de calidad de datos

Biblioteca direccional con ARN ribosómico agotado

Illumina PE150

10-16 GB

Q30≥85%

Requisitos de muestra

Nucleótidos:

Cantidad (ng)

Volumen (μL)

40

20

Tejido:

Exosomas: 100 μL; 40 μg; >10^9 partículas/mL
Suero/plasma: 5 mL
Sobrenadante del cultivo celular: 100 mL
Orina: 100 ml
Saliva: 15 ml
Secreción nasal: 15 ml
Líquido cefalorraquídeo: 15 ml
Líquido amniótico: 50 ml
Semen: 5 ml
Bilis: 5 ml
Ascitis: 50 ml
Leche: 15 ml
Líquido folicular: 15 ml
Sobrenadante fecal: 50 ml
Sobrenadante del cultivo microbiano: 100 mL
Tejido animal: 3 g
Tejido vegetal: 1 g

Entrega de muestras recomendada

Recipiente: Tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda usar papel de aluminio).
Etiquetado de muestras: Grupo+réplica, por ejemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Hielo seco: Las muestras deben empaquetarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
2. Tubos RNAstable: Las muestras de ARN se pueden secar en tubos de estabilización de ARN (por ejemplo, RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.

Flujo de trabajo del servicio

Control de calidad de la muestra

Diseño del experimento

entrega de muestras

Entrega de muestras

Experimento piloto

Extracción de ARN

Preparación de la biblioteca

Construcción de bibliotecas

Secuenciación

Secuenciación

Análisis de datos

Análisis de datos

Servicios postventa

Servicios posventa


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    BioinformáticaBioinformática2 

    Predicción de circRNA: distribución cromosómica

     foto 36

     

    circRNAs expresados ​​diferencialmente: diagrama de volcán

     foto 37

     

    circRNAs con expresión diferencial: agrupamiento jerárquico

     foto 38

     

    Enriquecimiento funcional de los genes hospedadores del circRNA.

     foto 39

     

    Análisis de la expresión génica diferencial (DEGs)

     

     图片30

     

     

    Cuantificación de la expresión de lncRNA: agrupamiento

     

    foto 31 

     

    Enriquecimiento de genes diana de lncRNA

     

     foto 32

     

    Análisis conjunto de la posición del ARNm y el ARNnc: diagrama de Circos (el círculo central representa el ARNm y el círculo interior, el ARNnc).

     

     foto 33

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