Secuenciación de ARN pequeño exosómico - Illumina
Características
● El ARN total de los exosomas se utiliza como material de partida. Durante la purificación, se emplean microesferas de miRNA para aislar el miRNA.
● Análisis bioinformático centrado en la predicción de miRNA y sus dianas.
Ventajas del servicio
● Análisis bioinformático integral: Permite la identificación de miRNAs conocidos y nuevos, la identificación de dianas de miRNAs y la correspondiente anotación funcional y enriquecimiento con múltiples bases de datos (KEGG, GO).
● Control de calidad riguroso: Implementamos puntos de control esenciales en todas las etapas, desde la preparación de muestras y bibliotecas hasta la secuenciación y el análisis bioinformático. Este monitoreo meticuloso garantiza la obtención de resultados de alta calidad de forma constante.
● Soporte posventa: Nuestro compromiso va más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio posventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para resolver cualquier duda relacionada con los resultados.
Requisitos y entrega de muestras
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Control de calidad de datos |
| Aislamiento de miRNA exosomal | Illumina SE50 | 10-20 millones de lecturas | Q30≥85% |
Requisitos de muestra
Nucleótidos:
| Cantidad (ng) | Volumen (μL) |
| 40 | 20 |
Tejido:
Exosomas: 100 μL; 40 μg; >10^9 partículas/mL
Suero/plasma: 5 mL
Sobrenadante del cultivo celular: 100 mL
Orina: 100 ml
Saliva: 15 ml
Secreción nasal: 15 ml
Líquido cefalorraquídeo: 15 ml
Líquido amniótico: 50 ml
Semen: 5 ml
Bilis: 5 ml
Ascitis: 50 ml
Leche: 15 ml
Líquido folicular: 15 ml
Sobrenadante fecal: 50 ml
Sobrenadante del cultivo microbiano: 100 mL
Tejido animal: 3 g
Tejido vegetal: 1 g
Entrega de muestras recomendada
Recipiente: Tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda usar papel de aluminio).
Etiquetado de muestras: Grupo+réplica, por ejemplo, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Hielo seco: Las muestras deben empaquetarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
2. Tubos RNAstable: Las muestras de ARN se pueden secar en tubos de estabilización de ARN (por ejemplo, RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.
Flujo de trabajo del servicio
Diseño del experimento
Entrega de muestras
Extracción de ARN
Construcción de bibliotecas
Secuenciación
Análisis de datos
Servicios posventa
Bioinformática
● Control de calidad de datos brutos
● Clasificación de ARN pequeños
● Alineación con un genoma de referencia
● Identificación de miRNA conocidos y nuevos
● Análisis de la expresión diferencial de miRNA
● Anotación funcional de los objetivos de miRNA
Identificación de miRNA: estructura y profundidad
Expresión diferencial de miRNA: agrupamiento jerárquico
Anotación funcional de los genes diana de los microARN expresados diferencialmente.
