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Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona perfiles de todo el genoma de objetivos de ADN para la modificación de histonas, factores de transcripción y otras proteínas asociadas al ADN.Combina la selectividad de la inmunoprecipitación de cromatina ChIP para recuperar complejos de proteína y ADN específicos con el poder de la secuenciación de próxima generación NGS para la secuenciación de alto rendimiento del ADN recuperado.Además, debido a que los complejos proteína-ADN se recuperan de células vivas, los sitios de unión se pueden comparar en diferentes tipos de células y tejidos, o en diferentes condiciones.Las aplicaciones van desde la regulación transcripcional hasta las vías de desarrollo, los mecanismos de las enfermedades y más.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación del genoma completo con bisulfito.
La metilación del ADN en la quinta posición de la citosina (5-mC) tiene una influencia fundamental en la expresión génica y la actividad celular.Los patrones anormales de metilación se han asociado con varias afecciones y enfermedades, como el cáncer.WGBS se ha convertido en el estándar de oro para estudiar la metilación de todo el genoma con una resolución de base única.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Ensayo de cromatina accesible a transposasa con secuenciación de alto rendimiento (ATAC-seq)
ATAC-seq es un método de secuenciación de alto rendimiento para el análisis de la accesibilidad a la cromatina en todo el genoma, que es importante para el control epigenético global de la expresión genética.Los adaptadores de secuenciación se insertan en regiones abiertas de cromatina mediante la transposasa Tn5 hiperactiva.Después de la amplificación por PCR, se construye una biblioteca de secuenciación.Todas las regiones de cromatina abiertas se pueden obtener en unas condiciones espacio-temporales específicas, no limitadas sólo a los sitios de unión de un factor de transcripción o a una determinada región modificada con histonas.
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Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
La investigación sobre la metilación del ADN siempre ha sido un tema candente en la investigación de enfermedades y está estrechamente relacionada con la expresión genética y los rasgos fenotípicos.RRBS es un método preciso, eficiente y económico para la investigación de la metilación del ADN.El enriquecimiento del promotor y de las regiones insulares CpG mediante escisión enzimática (Msp I), combinado con secuenciación con bisulfito, proporciona una detección de metilación del ADN de alta resolución.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
