Secuenciación de ARN pequeño-Illumina
Características
● Selección del tamaño del ARN antes de la preparación de la biblioteca.
● Análisis bioinformático centrado en la predicción de miARN y sus objetivos.
Ventajas del servicio
●Análisis bioinformático integral:permitiendo la identificación de miARN tanto conocidos como nuevos, la identificación de objetivos de miARN y la correspondiente anotación funcional y enriquecimiento con múltiples bases de datos (KEGG, GO)
●Control de calidad riguroso: implementamos puntos de control centrales en todas las etapas, desde la preparación de muestras y bibliotecas hasta la secuenciación y la bioinformática.Este seguimiento meticuloso garantiza la entrega de resultados consistentes de alta calidad.
●Soporte postventa: Nuestro compromiso se extiende más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio postventa de 3 meses.Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para abordar cualquier consulta relacionada con los resultados.
●Amplia experiencia: con un historial de cierre exitoso de múltiples proyectos de ARNs que cubren más de 100 especies en diversos dominios de investigación, nuestro equipo aporta una gran experiencia a cada proyecto.
Requisitos de muestra y entrega
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Control de calidad de datos |
| Tamaño seleccionado | Iluminación SE50 | 10M-20M lecturas | Q30≥85% |
Requisitos de muestra:
Nucleótidos:
| Conc.(ng/μl) | Cantidad (μg) | Pureza | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 En el gel se muestra contaminación limitada o nula de proteínas o ADN. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevación basal limitada o nula |
● Plantas:
Raíz, Tallo o Pétalo: 450 mg
Hoja o Semilla: 300 mg
Fruta: 1,2 gramos
● Animales:
Corazón o Intestino: 450 mg
Vísceras o Cerebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Huesos, Cabello o Piel: 1,5g
● Artrópodos:
Insectos: 9g
Crustáceos: 450 mg
● Sangre entera: 2 tubos
● Celdas: 106 células
● Suero y Plasma:6ml
Entrega de muestra recomendada
Envase:
Tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda papel de aluminio)
Etiquetado de muestras: Grupo+réplica, por ejemplo, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Envío:
1. Hielo seco: las muestras deben empaquetarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
2.Tubos RNAstable: las muestras de ARN se pueden secar en un tubo de estabilización de ARN (por ejemplo, RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.
Flujo de trabajo del servicio
Diseño de experimentos
Entrega de muestra
extracción de ARN
construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de los datos
Servicios postventa
Bioinformática
Identificación de miARN: estructura y profundidad.
Expresión diferencial de miARN – agrupamiento jerárquico
Anotación funcional del objetivo de miARN expresados diferencialmente.
Explore los avances en la investigación facilitados por los servicios de secuenciación de ARNs de BMKGene a través de una colección seleccionada de publicaciones.
Chen, H. y col.(2023) 'Las infecciones virales inhiben la biosíntesis y la fotosíntesis de saponinas en Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, pág.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. y col.(2023) 'La proteína FREE1 que contiene el dominio FYVE de la planta se asocia con componentes del microprocesador para reprimir la biogénesis de miARN', informa EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. y col.(2023) 'El microARN Ame-Bantam-3p controla el desarrollo de pupas larvarias dirigiéndose al gen 8 de dominios similares al factor de crecimiento epidérmico múltiple (megf8) en la abeja Apis mellifera', Revista Internacional de Ciencias Moleculares, 24 (6), pág. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. y col.(2018) 'El análisis integrado de miARN y genes asociados con la calidad de la carne revela que Gga-MiR-140-5p afecta la deposición de grasa intramuscular en pollos', Fisiología celular y bioquímica, 46 (6), págs.doi: 10.1159/000489649.
