Secuenciación de ARN pequeño - Illumina
Características
● Preparación de la biblioteca de selección de tamaño.
● Análisis bioinformático centrado en la predicción y objetivos de miRNA.
Ventajas del servicio
●Amplia experienciaHemos procesado más de 300 muestras de diversos tipos. Aportamos nuestra vasta experiencia a cada proyecto.
●Control de calidad rigurosoImplementamos controles fundamentales en todas las etapas, desde la preparación de muestras hasta la preparación de bibliotecas, la secuenciación y la bioinformática. Nuestro meticuloso seguimiento garantiza la entrega de resultados consistentemente de alta calidad.
●Análisis bioinformático integral:Permite la identificación de miRNA conocidos y nuevos, la identificación de dianas de miRNA y la correspondiente anotación funcional y enriquecimiento con múltiples bases de datos (KEGG, GO).
●Soporte posventaEntendemos la importancia de estar presentes, por eso nuestro compromiso se extiende más allá de la finalización del proyecto con un servicio posventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para resolver cualquier duda relacionada con los resultados.
Requisitos de muestra y entrega
| Biblioteca | Plataforma | Datos recomendados | Control de calidad de datos |
| Talla seleccionada | Illumina SE50 | 10 millones a 20 millones de lecturas | Q30≥85% |
Requisitos de muestra:
Nucleótidos:
| Concentración (ng/μl) | Cantidad (μg) | Pureza | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Se muestra contaminación limitada o nula de proteínas o ADN en el gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevación basal limitada o nula |
● Plantas:
Raíz, tallo o pétalo: 450 mg
Hoja o semilla: 300 mg
Fruta: 1,2 g
●Animal:
Corazón o Intestino: 450 mg
Vísceras o cerebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Huesos, cabello o piel: 1,5 g
● Artrópodos:
Insectos: 9g
Crustáceos: 450 mg
● Sangre entera: 2 tubos
● Células: 106 células
● Suero y Plasma:6 ml
Entrega de muestra recomendada
Envase: Tubo de centrífuga de 2 ml (no se recomienda usar papel de aluminio)
Etiquetado de muestra: Grupo+réplica p.ej. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Envío:
1. Hielo seco: Las muestras deben empacarse en bolsas y enterrarse en hielo seco.
2. Tubos de estabilización de ARN: las muestras de ARN pueden secarse en un tubo de estabilización de ARN (por ejemplo, RNAstable®) y enviarse a temperatura ambiente.
Flujo de trabajo del servicio
Diseño de experimentos
Entrega de muestra
Extracción de ARN
Construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de datos
Servicios posventa
Bioinformática
● Control de calidad de datos sin procesar
● Clasificación de ARN pequeños
● Análisis de expresión de miRNA y expresión diferencial
● Anotación del gen diana de miRNA y del gen diana de miRNA expresado diferencialmente
● Anotación de genes diana y enriquecimiento de la función génica de miRNA expresados diferencialmente
Identificación de miRNA: estructura y profundidad
Expresión diferencial de miRNA: agrupamiento jerárquico
Anotación funcional del objetivo de los miRNA expresados diferencialmente
Explore los avances de investigación facilitados por los servicios de secuenciación de ARNm de BMKGene a través de una colección seleccionada de publicaciones.
Chen, H. et al. (2023) 'Las infecciones virales inhiben la biosíntesis de saponina y la fotosíntesis en Panax notoginseng',Fisiología y bioquímica vegetal, 203, pág. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'La proteína FREE1 que contiene el dominio FYVE de la planta se asocia con componentes del microprocesador para reprimir la biogénesis de miRNA',Informes de EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'El microARN Ame-Bantam-3p controla el desarrollo de las pupas larvarias al dirigirse al gen 8 de dominios similares al factor de crecimiento epidérmico múltiple (megf8) en la abeja melífera, Apis mellifera',Revista Internacional de Ciencias Moleculares, 24(6), pág. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'El análisis integrado de MiRNA y genes asociados con la calidad de la carne revela que Gga-MiR-140-5p afecta la deposición de grasa intramuscular en pollos',Fisiología celular y bioquímica, 46 (6), págs. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
